种质资源数据库论文-李翔,徐建坡

种质资源数据库论文-李翔,徐建坡

导读:本文包含了种质资源数据库论文开题报告文献综述及选题提纲参考文献,主要关键词:天津市原种场,水稻种质资源,数据库,建设

种质资源数据库论文文献综述

李翔,徐建坡[1](2019)在《天津市原种场水稻种质资源数据库的建设》一文中研究指出本文介绍了天津市原种场水稻种质资源数据库管理现状,概述了天津市水稻种质资源库建设的架构、功能与作用,对水稻种质资源数据库的未来工作进行了展望,为水稻种质资源的智能化管理、实现精准育种、高效育种奠定了坚实的基础。(本文来源于《天津农林科技》期刊2019年04期)

杨文娟[2](2018)在《芝麻应用核心种质DNA分子身份证和种质资源数据库共享平台构建》一文中研究指出芝麻(Sesamum indicum,2n=26)是世界上最古老的油料作物之一,营养丰富,用途广泛,在食品、药品及保健品研发上均具有很高的利用价值。我国目前收集芝麻种质资源8115份,居世界前列,但长期以来由于芝麻种质资源信息交流平台有限,影响了资源利用率,而且至今尚未构建标准的分子生物学鉴定方法。从分子水平上能对种质进行区分,并较大程度的实现资源信息共享,是种质高效利用和有效保护的重要途径,对芝麻种质资源研究和品种改良均具有重要意义。因此,本研究以建立的应用核心种质为实验材料,探索了芝麻DNA分子身份证的构建方法;基于已获取的8115份芝麻种质资源基本信息和表型数据,建立了数据库,构建了网络共享平台。研究获得以下结果:1.通过对705份芝麻核心种质4年4点精准鉴定,依据优异育种目标,筛选出131份芝麻应用核心种质,分为高产、优质、抗病抗逆、生育期适宜、适应机械化、株型特异、综合性状优良七大类。2.为了探索芝麻DNA分子身份证的构建方法,以应用核心种质为材料,利用SSR变性聚丙烯酰胺凝胶电泳技术,从基于芝麻全基因组开发的32对SSR引物中,筛选出7对多态性高、带型清晰且空白条带少的引物,确定为核心引物。在此基础上,通过SSR荧光毛细管电泳技术,用获得的7对核心引物分析131份应用核心种质,共检测出53个多态性位点,一个引物能检测出的多态性位点数最多达12个。3.将毛细管电泳得到的分子量数据以数字+英文字母方式编码,利用IDANAlysis4.0软件筛选出6对核心引物排列组合:ZMM1494、ZMM1648、ZMM3037、ZMM2818、ZMM1851、ZMM1935,构建出如“4A32645(AC017)”这种简单、易使用的字符串DNA分子身份证,并确定了不同应用型的组内引物组合。利用条码软件将字符串DNA分子身份证转化为条形码和二维码DNA分子身份证,该类型分子身份证可迅速被电子设备识别,拓宽了DNA分子身份证的使用范围,并为以后芝麻种质标准化和品种DNA分子身份证库的构建奠定了重要的技术基础。4.对我国收集保存的8115份芝麻种质资源基础收集品的基本信息、形态特征和生物学特性、抗性等共计90420条数据信息及芝麻核心种质、微核心种质、应用核心种质信息进行规范整理,并广泛搜集其他与芝麻种质资源相关的资料,构建了芝麻种质资源信息数据库,并以该数据库为数据来源,通过开源的LAMP网站应用系统,结合HTML和Java Script语言建成了芝麻种质资源信息网络共享平台http://www.sesame-bioinfo.org。该平台集芝麻种质资源信息浏览、种质信息检索、种质资源实物索取功能为一体,共享种质数据量大、内容涵盖面广、实用性强,既可为专业的科技工作者提供标准化、准确性高的芝麻相关信息和实物资源,又可为广大芝麻爱好者提供专业的科普知识。(本文来源于《中国农业科学院》期刊2018-03-01)

杨文娟,高媛,魏鑫,王林海,黎冬华[3](2018)在《芝麻种质资源信息数据库的设计与构建》一文中研究指出农作物种质资源信息的数据建设对品种改良至关重要。本研究对我国收集保存的8 115份芝麻种质资源的基本信息、形态特征和生物学特性、品质特性、抗性等数据进行规范整理,以90 420条芝麻信息为数据来源,采用LMAP数据库技术构建了在线芝麻种质资源信息数据库http://www.sesame-bioinfo.org/phenotype/index.html。数据库主要功能包括芝麻种质资源信息浏览、信息检索及实物索取。本数据库的创建打破了传统纸质或综合性数据库存储芝麻种质资源信息的局限,有效解决芝麻种质资源数据保存分散,共享、交流、利用困难等问题,实现了芝麻资源数字化管理和交流,将极大促进资源的有效利用。(本文来源于《中国油料作物学报》期刊2018年01期)

杨瑞恒,吴莹莹,宋春艳,田果廷,李传华[4](2018)在《基于公共数据库信息对中国野生香菇种质资源地理分布的再分析》一文中研究指出本文基于野生香菇资源的文献以及公共数据库中的序列信息,调查了香菇在我国以及世界范围内的地理分布,同时利用ITS序列进行了遗传多样性分析。结果显示香菇在我国的21个省市有分布,其中对云南、四川和湖北等省香菇资源的研究最为密集。不同菌株的聚类与地域来源有一定的相关性,进一步通过多样性分析显示我国野生香菇的多样性中心分布于西北和西南地区。本文有助于指导我们进行香菇野生资源的调查,进一步挖掘香菇种质资源的多样性。(本文来源于《菌物学报》期刊2018年03期)

戴亚,陈程杰,高用顺,邵子坤,彭江容[5](2017)在《基于PHP+MySQL构建枇杷属植物种质资源数据库》一文中研究指出枇杷属(Eriobotrya Lindl.)是蔷薇科(Rosaceae)中一个独具南方特色的属,有至少26个种。只有1个种普通枇杷(E.japonica Lindl.)是栽培种,对于该种,福建省农业科学院果树研究所已积累了大量的信息资料;而枇杷属多数的野生种信息主要是在近十几年中逐步积累起来的,且目前尚未有专门的针对枇杷属种质资源的数据管理系统。在收集、整理华南农业大学园艺学院枇杷课题组2003至今的枇杷属植物历史调查数据基础上,对国内外众多的资料兼收并济,以Windows+PHP+Mysql+Apache为开发平台,构建网页版枇杷属植物种质资源数据库。枇杷属植物种质资源数据库的设计分为需求分析和总体设计,数据库最基本的功能满足:储存数据、数据修改、种质查询、信息检索;数据库系统总体设计为4个模块:安全登录、查询系统、管理系统、帮助。数据库系统按照功能可划分为:功能表示层(Presentation)、功能实现层(Business Logic)、数据服务层(Date Service)。用户在功能表示层将请求发给Apache服务器,之后交给功能实现层处理,PHP作为交互语言,实现上传下达逻辑处理,在MySQL数据库中执行数据查询,并将查询结果以页面的形式返还给用户。登录页面是网站的门户页面,用户输入用户名和密码,验证通过之后进入主页。枇杷属种质资源数据库主页有包括导航栏、26个种的枇杷属植物的种名列表和网站版权信息,选中种名列表中任意种进入相应的种质详情页面。内容包括对应种质的树形、花、叶、果实、生境特征图片以及详细的种质信息描述。种质数据查询是数据库的核心,有"种质清单"和"数据查询"两种查询方式。"种质清单"下分"野生枇杷"和"栽培枇杷",清单查询可以看到网站储存的所有枇杷属植物的编号、品种名、产地。"数据查询"下分"快速搜索"和"标准查询","快速搜索"等同于模糊搜索,输入品种名来查询符合条件的种质。"标准查询"归纳和设立"树性"、"树高"、"树干皮孔"等52个常见描述为描述符基础,构成了数据库动态交互选项,其中35个为可选项,17个为输入项,客户可根据需求查询种质。基于PHP+MySQL构建的网页版数据库具有超越平台性、交互性、整合性和稳定性,为将来数据库系统的进一步完善和改进奠定了重要基础。目前,数据库里的信息,野生种方面更饱满,而栽培枇杷方面由于有巨量的信息,尚未完整收进数据库,因此,数据库系统的进一步完善是十分重要的。(本文来源于《中国园艺学会2017年论文摘要集》期刊2017-10-19)

张兴伟,戴培刚,佟英,刘国祥[6](2017)在《烟草种质资源图像数据库的维护与更新》一文中研究指出阐述了建设烟草种质资源图像数据库对于烟草种质资源的保护、研究、共享利用的重要性,并制定了拍摄、处理、存储的一套维护更新的规范标准,形成了图像数据库维护更新作业流程,并给出了图像维护更新过程中一些问题的处理方法。(本文来源于《安徽农业科学》期刊2017年27期)

任海龙,张龑,徐麟,高强,王天地[7](2017)在《基于Internet的新疆农业科学院南繁种质资源数据库构建》一文中研究指出为实现新疆农业科学院南繁种质资源数据的共享,采用Python开发语言、Postgresql数据库及浏览器/服务器(B/S)的架构,建立基于Internet的新疆农业科学院南繁种质资源数据库,该数据库具有南繁种质资源信息查询等基本功能。(本文来源于《黑龙江农业科学》期刊2017年06期)

吴强,李庆伟,王应君[8](2016)在《大蒜种质资源数据库系统的设计与实现》一文中研究指出大蒜是我国重要的农副产品,构建大蒜种质资源库,对于品种改良,培育高产、优质、抗逆性强的新品种,以及为生物学理论研究提供丰富的种质和研究材料都具有重要意义。该研究基于.NET开发平台和Microsoft SQL Server 2005数据库系统,应用C#和JavaScript语言,调用百度地图API,设计并实现了大蒜种植资源数据库系统,系统主要包括大蒜种质资源地理分布显示、大蒜种质资源数据查询、大蒜栽培和加工技术,以及系统与用户管理等功能,实现了大蒜种质资源和生产技术的数字化共享。(本文来源于《北方园艺》期刊2016年07期)

陈佳瀛,潘以峰,李玉龙,蔡玲婷,李雪鸽[9](2015)在《上海多功能花卉种质资源数据库的建立与应用前景》一文中研究指出通过资源调查,收集了上海市常见花卉种质的相关资料,用现代信息发展的数据管理技术,研究设计软件,组织构建了一个界面友好、操作方便、通用性强的花卉种质资源数据库系统,并在此基础上,对数据库研究了互动性、商业性、职业培训的应用前景.(本文来源于《上海师范大学学报(自然科学版)》期刊2015年06期)

姜建福[10](2015)在《葡萄种质资源数据库系统研建成功》一文中研究指出性状调查与采集是作物种质资源开发与利用的前提,种质性状由于受到当年气候和环境等因素的影响,某一年的调查数据并不代表该品种的实际特性。目前国内外种质资源数据库多基于种质的基本信息进行录入和查询,未见针对某一种质多年调查数据的数据管理系统,缺乏对数据的持续观测和分析,不利于种质潜在信息的挖掘和利用。为了更好地利用先进的信息技术保护和利用我国葡萄种质资源、提高葡萄种质资源信息共享的长度,中国农业科学院郑州果树研究所葡萄资源课题(本文来源于《基层农技推广》期刊2015年06期)

种质资源数据库论文开题报告

(1)论文研究背景及目的

此处内容要求:

首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景,再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题,并提出你的论文准备的观点或解决方法。

写法范例:

芝麻(Sesamum indicum,2n=26)是世界上最古老的油料作物之一,营养丰富,用途广泛,在食品、药品及保健品研发上均具有很高的利用价值。我国目前收集芝麻种质资源8115份,居世界前列,但长期以来由于芝麻种质资源信息交流平台有限,影响了资源利用率,而且至今尚未构建标准的分子生物学鉴定方法。从分子水平上能对种质进行区分,并较大程度的实现资源信息共享,是种质高效利用和有效保护的重要途径,对芝麻种质资源研究和品种改良均具有重要意义。因此,本研究以建立的应用核心种质为实验材料,探索了芝麻DNA分子身份证的构建方法;基于已获取的8115份芝麻种质资源基本信息和表型数据,建立了数据库,构建了网络共享平台。研究获得以下结果:1.通过对705份芝麻核心种质4年4点精准鉴定,依据优异育种目标,筛选出131份芝麻应用核心种质,分为高产、优质、抗病抗逆、生育期适宜、适应机械化、株型特异、综合性状优良七大类。2.为了探索芝麻DNA分子身份证的构建方法,以应用核心种质为材料,利用SSR变性聚丙烯酰胺凝胶电泳技术,从基于芝麻全基因组开发的32对SSR引物中,筛选出7对多态性高、带型清晰且空白条带少的引物,确定为核心引物。在此基础上,通过SSR荧光毛细管电泳技术,用获得的7对核心引物分析131份应用核心种质,共检测出53个多态性位点,一个引物能检测出的多态性位点数最多达12个。3.将毛细管电泳得到的分子量数据以数字+英文字母方式编码,利用IDANAlysis4.0软件筛选出6对核心引物排列组合:ZMM1494、ZMM1648、ZMM3037、ZMM2818、ZMM1851、ZMM1935,构建出如“4A32645(AC017)”这种简单、易使用的字符串DNA分子身份证,并确定了不同应用型的组内引物组合。利用条码软件将字符串DNA分子身份证转化为条形码和二维码DNA分子身份证,该类型分子身份证可迅速被电子设备识别,拓宽了DNA分子身份证的使用范围,并为以后芝麻种质标准化和品种DNA分子身份证库的构建奠定了重要的技术基础。4.对我国收集保存的8115份芝麻种质资源基础收集品的基本信息、形态特征和生物学特性、抗性等共计90420条数据信息及芝麻核心种质、微核心种质、应用核心种质信息进行规范整理,并广泛搜集其他与芝麻种质资源相关的资料,构建了芝麻种质资源信息数据库,并以该数据库为数据来源,通过开源的LAMP网站应用系统,结合HTML和Java Script语言建成了芝麻种质资源信息网络共享平台http://www.sesame-bioinfo.org。该平台集芝麻种质资源信息浏览、种质信息检索、种质资源实物索取功能为一体,共享种质数据量大、内容涵盖面广、实用性强,既可为专业的科技工作者提供标准化、准确性高的芝麻相关信息和实物资源,又可为广大芝麻爱好者提供专业的科普知识。

(2)本文研究方法

调查法:该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。

观察法:用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。

实验法:通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。

文献研究法:通过调查文献来获得资料,从而全面的、正确的了解掌握研究方法。

实证研究法:依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。

定性分析法:对研究对象进行“质”的方面的研究,这个方法需要计算的数据较少。

定量分析法:通过具体的数字,使人们对研究对象的认识进一步精确化。

跨学科研究法:运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。

功能分析法:这是社会科学用来分析社会现象的一种方法,从某一功能出发研究多个方面的影响。

模拟法:通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。

种质资源数据库论文参考文献

[1].李翔,徐建坡.天津市原种场水稻种质资源数据库的建设[J].天津农林科技.2019

[2].杨文娟.芝麻应用核心种质DNA分子身份证和种质资源数据库共享平台构建[D].中国农业科学院.2018

[3].杨文娟,高媛,魏鑫,王林海,黎冬华.芝麻种质资源信息数据库的设计与构建[J].中国油料作物学报.2018

[4].杨瑞恒,吴莹莹,宋春艳,田果廷,李传华.基于公共数据库信息对中国野生香菇种质资源地理分布的再分析[J].菌物学报.2018

[5].戴亚,陈程杰,高用顺,邵子坤,彭江容.基于PHP+MySQL构建枇杷属植物种质资源数据库[C].中国园艺学会2017年论文摘要集.2017

[6].张兴伟,戴培刚,佟英,刘国祥.烟草种质资源图像数据库的维护与更新[J].安徽农业科学.2017

[7].任海龙,张龑,徐麟,高强,王天地.基于Internet的新疆农业科学院南繁种质资源数据库构建[J].黑龙江农业科学.2017

[8].吴强,李庆伟,王应君.大蒜种质资源数据库系统的设计与实现[J].北方园艺.2016

[9].陈佳瀛,潘以峰,李玉龙,蔡玲婷,李雪鸽.上海多功能花卉种质资源数据库的建立与应用前景[J].上海师范大学学报(自然科学版).2015

[10].姜建福.葡萄种质资源数据库系统研建成功[J].基层农技推广.2015

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