上游启动子区论文-王明山,任强,陆树,白培明

上游启动子区论文-王明山,任强,陆树,白培明

导读:本文包含了上游启动子区论文开题报告文献综述及选题提纲参考文献,主要关键词:鸡卵清蛋白上游启动子转录因子(COUP-TF)Ⅱ,癌症进展,血管生成,淋巴转移

上游启动子区论文文献综述

王明山,任强,陆树,白培明[1](2018)在《鸡卵清蛋白上游启动子转录因子Ⅱ的功能及其在肿瘤中的作用》一文中研究指出鸡卵清蛋白上游启动子转录因子(COUP-TF)Ⅱ是一种转录调节因子,在器官发育和血管生成的过程中起着重要的作用,近几年来发现它能调节多个信号通路来控制多种肿瘤细胞生长和血管生成及淋巴管的生成,且被证实与多种肿瘤的发生和转移有至关重要的作用~([1])。本文研究其在非腺癌膀胱癌中的表达,并重点对COUP-TFⅡ的表达、功能调节及其在相关肿瘤中的作用进行综述。(本文来源于《中国老年学杂志》期刊2018年18期)

庄瑞蓉,储文婷,赵闪闪,陈坤,谢文萍[2](2018)在《花生AhBW3基因上游启动子克隆及其功能鉴定》一文中研究指出含有核苷酸结合位点(nucleotide-binding site,NBS)和富亮氨酸重复(leucine-rich repeat,LRR)结构域的NBS-LRR类抗性基因在植物抗病防御反应中起着重要作用,启动子是调控基因表达的重要顺式元件。为研究花生(Arachis hypogaea)青枯病候选基因3(bacterial wilt candidate resistance gene 3 of Arachis hypogaea,AhBW3)表达调控机制,本研究前期克隆获得了1个青枯病抗性相关的NBS-LRR类基因,发现含有TIR结构域的全长序列(AhBW3,GenBank No.HQ637177.1)和不带TIR结构域序列(AhqBW3)的转基因烟草(Nicotiana tabacum),对青枯病的抗性响应存在差异。为研究AhBW3表达调控花生对青枯菌的响应机制,本研究利用电子克隆技术,从抗青枯病花生品种粤油92基因组DNA中克隆AhBW3基因上游1 978 bp序列,命名为pAhBW3。通过生物信息学分析发现,AhBW3含有多个TATA-box和CAAT-box等真核生物启动子核心元件,还包括根特异表达元件、光调控元件、抗逆境响应等元件。通过构建GUS融合表达载体并遗传转化拟南芥(Arabidopsis thaliana),转基因拟南芥的GUS组织化学活性表达结果显示,GUS在拟南芥根部表达量最高,莲座叶的表达量亦高,在茎和花中表达量较弱,说明pAhBW3是根和叶丰富表达的启动子。通过qRT-PCR分析,显示pAhBW3调控的GUS基因能响应外源激素、干旱、高盐的胁迫,表现不同程度的上调应答。本研究为pAhBW3启动子的利用和AhBW3基因在花生的抗逆反应机制的进一步研究提供了科学依据。(本文来源于《农业生物技术学报》期刊2018年07期)

戴小凯[3](2017)在《小金海棠MxbZIPIO上游启动子克隆与生物信息学分析》一文中研究指出小金海棠(Malus xiaojinensis)是我国学者发现的第一个抗缺铁苹果树种,是极其重要的苹果种质资源,本文以小金海棠为试材,克隆了转录因子Mxb ZIP10上游启动子,并对该启动子进行了生物信息学分析,主要研究结果如下:1)根据Mxb ZIP10序列在NCBI中查找高度同源序列,通过PCR方法克隆Mxb ZIP10上游启动子,PCR上下游引物分别为GCTATCCACAAACTCCTAAA、AACATATAGACTCTCTCCGC,最终成功克隆到Mxb ZIP10上游启动子1489bp。2)利用CTAB法提取小金海棠DNA,并分别用分光光度法和凝胶电泳对DNA进行检测,结果显示小金海棠DNA在波长为260 nm处吸光度值为0.012,而在280 nm处吸光度值为0.006,260 nm/280 nm值为2,小金海棠DNA浓度为120μg/m L。以小金海棠DNA为模板,通过PCR程序扩增,得到一条约为1500bp的条带,将目的条带DNA回收。回收得到的DNA片段克隆到p GEM-T载体,并转化到已经制备好的超级感受态中进行蓝白筛选。挑阳性克隆培养后提取质粒,T-pro Mxb ZIP10命名。测序结果表明,小金海棠Mxb ZIP10上游启动子包含1489bp碱基序列。3)采用软件plant CARE对Mxb ZIP10上游启动子进行在线分析,该启动子序列中含有核心元件17个TATA-box和12个CAAT-box。另外还包括响应ABA的功能元件ABRE 1个、响应逆境的功能元件HSE 1个、LTR 1以及响应光的功能元件G-box5个等作用元件。综上,小金海棠作为一种重要的铁营养果树资源,研究其吸收铁机制为果树等农作物种植提供基础依据,同时为解决作物生长发育提供理论基础,Mxb ZIP10上游启动子为研究Mxb ZIP10表达调控机制提供了重要基础,具有十分重要的意义。(本文来源于《四川农业大学》期刊2017-10-01)

刘骉[4](2017)在《东方粘虫中肠胰蛋白酶基因上游启动子核心序列的克隆及功能验证》一文中研究指出随着人们对食品安全以及绿色农业的持续深入的关注,对安全使用农药问题的认识也越来越深刻,因此,利用天然产物研究开发新型农药成了近年的热点之一。前期研究发现,杠柳新苷类化合物对东方粘虫具有一定的杀虫活性,并且可以上调昆虫体内胰蛋白酶的表达,使其发生过分表达分泌的现象,超出虫体自身的生命代谢水平,从而可能使其自身的器官和组织被该类酶水解破坏,最终导致昆虫死亡。但是,目前的研究尚未明确该类化合物如何产生这种效应,对其杀虫机理也未有明确的研究。1.东方粘虫中肠胰蛋白酶基因启动子的缺失克隆本研究利用生物信息学方法预测粘虫中肠胰蛋白酶基因启动子上游的序列中潜在的转录因子及其结合位点,根据初步预测的结果,设计出7段缺失引物,对靶标启动子进行分段PCR扩增,并将得到质粒重组到荧光素酶报告基因载体,共同转染至昆虫Sf21细胞系中,瞬时表达检测相对荧光活性,从而比较出各段启动子活性。试验结果表明靶标基因启动子区在-1003/-788和-274/-188间可能包含某些对胰蛋白酶基因转录调控起关键作用的转录因子结合位点,并且在-1003/-788之间可能存在转录激活因子,在-274/-188之间可能存在转录抑制因子。2.东方粘虫中肠胰蛋白酶基因启动子的突变克隆采用生物信息学预测方法,结合缺失片段启动子活性强弱,参考各个转录因子的结构与功能,预测出符合先前实验结果的可能存在的6个可能潜在的转录因子Zeste、Ubx、Myod、Cf2、SMAD、STAT的结合位点,并将其可能的结合位点序列突变,设计出6对突变引物,利用PCR技术对启动子序列进行突变克隆,构建包含有突变启动子片段质粒的表达载体,转染至Sf21细胞,瞬时表达后比较其各段启动子活性,发现突变Myod和Cf2的结合位点序列后,启动子活性与空白对照组有差异,从而推测这两个转录因子可能存在于粘虫体内,并对于粘虫中肠胰蛋白酶基因的转录调控有重要作用。3.杠柳化合物对靶标基因启动子的影响本试验为了探究杠柳新苷类化合物是否可以直接作用于靶标启动子,将供试药物利用DMSO溶解配制成不同浓度梯度的药剂,在由启动子全长构建的荧光素表达载体转染的Sf21细胞中直接用不同浓度的药剂孵育5 h,待表达完成后与空白对照组比较启动子活性。结果表明,粘虫中肠胰蛋白酶基因启动子在杠柳新苷T低浓度处理下活性均有所降低,且随着杠柳新苷T处理浓度的升高,启动子活性降低,表明杠柳新苷T对胰蛋白酶基因启动子活性有影响。本研究通过对粘虫中肠的胰蛋白酶基因进行了分析与预测,与空白对照的启动子活性比较,初步找到了靶标启动子基因中可能存在的转录因子结合位点,并利用杠柳新苷类化合物作用靶标启动子,结果表明,该类化合物对靶标启动子有一定影响,为杀虫剂作用于昆虫基因转录及表达水平的作用机制的研究奠定了理论基础。(本文来源于《西北农林科技大学》期刊2017-05-01)

王凯,连海峰,牛琼,贾兴芳,刘成霞[5](2016)在《胃癌组织中鸡卵清蛋白上游启动子转录因子Ⅱ、神经纤毛蛋白2的表达变化及其意义》一文中研究指出目的观察胃癌组织中鸡卵清蛋白上游启动子转录因子Ⅱ(COUP-TFⅡ)和神经纤毛蛋白2(NRP2)的表达变化,并分析COUP-TFⅡ、NRP2表达与胃癌临床病理参数的关系。方法收集手术切除的新鲜胃癌组织及其癌旁正常胃黏膜组织各60例,采用Western blotting法和免疫组化法检测胃癌组织及正常胃黏膜组织中的COUPTFⅡ、NRP2,分析COUP-TFⅡ、NRP2表达与胃癌临床病理参数的关系。结果胃癌组织中COUP-TFⅡ、NRP2阳性表达率分别为70.0%、78.3%,正常胃黏膜组织中COUP-TFⅡ、NRP2阳性表达率分别为30.0%、21.7%。胃癌组织、正常胃黏膜组织中COUP-TFⅡ相对表达量分别为0.84±0.22、0.68±0.34,NRP2相对表达量分别为0.86±0.17、0.58±0.22,胃癌组织中COUP-TFⅡ、NRP2相对表达量均高于正常胃黏膜组织(P均<0.05)。胃癌组织中COUP-TFⅡ、NRP2表达呈正相关关系(r=0.263,P<0.05)。浸润深度为T_3、T_4的胃癌组织中COUP-TFⅡ、NRP2阳性表达率高于浸润深度T_1、T_2的胃癌组织(P均<0.05);中低分化胃癌组织中COUP-TFⅡ、NRP2阳性表达率高于高分化胃癌组织(P均<0.05);有淋巴结转移的胃癌组织中COUP-TFⅡ、NRP2阳性表达率高于无淋巴结转移的胃癌组织(P均<0.05)。结论 COUP-TFⅡ、NRP2在胃癌组织中高表达,并与胃癌的浸润深度、分化程度及淋巴结转移有关,二者可能协同参与了胃癌的发生和发展。(本文来源于《山东医药》期刊2016年31期)

焦点,杨安钢,王禾,温伟红[6](2015)在《鸡卵清蛋白上游启动子转录因子2与肿瘤关系的研究进展》一文中研究指出鸡卵清蛋白上游启动子转录因子2(COUP-TF2)是核受体家族的重要成员,其编码基因位于第15号染色体。COUP-TF2参与调节血管和淋巴管生成、能量代谢和脂肪生成、神经发育和器官形成等。COUP-TF2可抑制肿瘤细胞表面MHCⅠ类分子的表达,导致肿瘤细胞逃避免疫系统的监视从而诱发肿瘤。COUP-TF2也在多种肿瘤组织中高表达,且其表达水平与肿瘤的恶性程度呈正相关。COUP-TF2还可通过调节血管和淋巴管生成、肿瘤细胞的侵袭和转移、肿瘤细胞对激素的敏感性等机制参与肿瘤的发生发展。本文就COUP-TF2的生理作用及其参与肿瘤发生发展的分子机制进行综述。(本文来源于《细胞与分子免疫学杂志》期刊2015年11期)

许淑娣,王涛,李惟捷,牛梦婕,李瑛[7](2015)在《人NLK上游启动子区的克隆与鉴定》一文中研究指出初步鉴定并分析NLK上游启动子,为研究其转录调控打下基础。对NLK基因翻译起始位点上游约1 958 bp的序列分别进行生物信息学分析,以PCR技术扩增以上序列并测序。将PCR所得到的NLK上游片段进一步克隆到PGL-3basic载体中,构建荧光素酶报告基因质粒PGL-3basic-luc。通过荧光素酶报告基因实验检测上述启动子的活性。成功构建了包含NLK基因上游启动子序列的荧光报告系统,经荧光素酶报告基因实验证明该重组质粒体具有转录活性。构建的NLK基因上游启动子报告基因载体为进一步研究NLK基因的转录调控机制奠定了基础。(本文来源于《科学技术与工程》期刊2015年20期)

匡仟卉柠,李景云,季晨博,郭锡镕,倪毓辉[8](2014)在《hsa-miR-1908上游启动子区的生物信息学分析》一文中研究指出目的利用各种生物信息学工具预测hsa-miR-1908上游启动子功能,以进一步研究其在人脂肪细胞中的转录调控机制。方法应用Ensemble数据库获取hsa-miR-1908上游启动子序列,利用多种在线相关软件预测出甲基化部位和转录因子结合部位。结果获取hsa-miR-1908上游启动子序列全长1 458 bp。miR-1908启动子序列中CpG岛位于(438~756)bp、(836~937)bp、(979~1374)bp处,CpG岛的存在会抑制miR-1908启动子的转录。miR-1908有15个转录因子的结合位点。结论 miRNA启动子相关生物信息学的研究,提高对启动子的研究效率,为进一步研究miR-1908的转录调控机制提供了重要的信息。(本文来源于《临床儿科杂志》期刊2014年04期)

黄雪盈,石兰平,杨晟,卢蓉,王博[9](2014)在《CaKR1上游启动子分离及其表达分析》一文中研究指出运用基因组步移技术分离获得了CaKR1基因上游-1594 bp的启动子序列,命名为CaKR1p,发现其中含有SA、ABA、低温等信号应答原件以及其它诸如W盒等应答逆境胁迫的调控原件。进一步构建CaKR1p与GUS报告基因融合的植物表达载体,获得了烟草转基因植株及其相应的T1代株系,利用T1代转基因株系分析了CaKR1p在几种外源激素处理下的GUS基因的表达,结果表明外源激素SA、JA和ABA的诱导处理均可激活该启动子下游报告基因GUS的表达,说明CaKR1的表达和作用受到SA、ABA以及JA等信号通路调节。(本文来源于《江西农业学报》期刊2014年02期)

李增亮,姜宝飞,李伟,徐皓,徐泽宽[10](2013)在《鸡卵清蛋白上游启动子转录因子Ⅱ在人胃癌组织中的表达及临床意义》一文中研究指出目的:检测鸡卵清蛋白上游启动子转录因子Ⅱ(COUP-TFⅡ)在人胃癌组织中的表达,并探讨其临床意义及其影响胃癌发生、发展的可能分子机制。方法:收集66例手术切除的胃癌组织和相对应的癌旁非肿瘤组织标本,采用免疫组织化学法检测标本中COUP-TFⅡ和基质金属蛋白酶-2(MMP-2)蛋白的表达,分析COUP-TFⅡ与患者临床病理特征及预后之间的关系,以及COUP-TFⅡ与其潜在靶基因MMP-2的相关性。结果:COUP-TFⅡ蛋白在胃癌和癌旁组织中的阳性表达率分别为65.2%(43/66)和19.7%(13/66),两者比较差异有统计学意义(P<0.05)。COUP-TFⅡ蛋白的表达与胃癌的浸润深度、分化程度、淋巴结转移及TNM分期密切相关(P<0.05),而与患者的性别、年龄、肿瘤大小无关(P>0.05)。COUP-TFⅡ蛋白阳性表达的患者术后平均生存时间比阴性表达者短,分别为(26.8±2.6)个月和(36.4±3.0)个月(χ2=4.118,P=0.042)。MMP-2蛋白在胃癌和癌旁组织中的阳性表达率分别为78.8%(52/66)和34.8%(23/66),两者比较差异有统计学意义(P<0.05)。COUP-TFⅡ与MMP-2蛋白在胃癌组织中的表达呈正相关(r=0.310,P=0.011)。结论:COUP-TFⅡ蛋白与胃癌的发生、发展、侵袭、转移以及不良预后密切相关,推测可能是通过调控MMP-2的表达而发挥作用。(本文来源于《南京医科大学学报(自然科学版)》期刊2013年07期)

上游启动子区论文开题报告

(1)论文研究背景及目的

此处内容要求:

首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景,再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题,并提出你的论文准备的观点或解决方法。

写法范例:

含有核苷酸结合位点(nucleotide-binding site,NBS)和富亮氨酸重复(leucine-rich repeat,LRR)结构域的NBS-LRR类抗性基因在植物抗病防御反应中起着重要作用,启动子是调控基因表达的重要顺式元件。为研究花生(Arachis hypogaea)青枯病候选基因3(bacterial wilt candidate resistance gene 3 of Arachis hypogaea,AhBW3)表达调控机制,本研究前期克隆获得了1个青枯病抗性相关的NBS-LRR类基因,发现含有TIR结构域的全长序列(AhBW3,GenBank No.HQ637177.1)和不带TIR结构域序列(AhqBW3)的转基因烟草(Nicotiana tabacum),对青枯病的抗性响应存在差异。为研究AhBW3表达调控花生对青枯菌的响应机制,本研究利用电子克隆技术,从抗青枯病花生品种粤油92基因组DNA中克隆AhBW3基因上游1 978 bp序列,命名为pAhBW3。通过生物信息学分析发现,AhBW3含有多个TATA-box和CAAT-box等真核生物启动子核心元件,还包括根特异表达元件、光调控元件、抗逆境响应等元件。通过构建GUS融合表达载体并遗传转化拟南芥(Arabidopsis thaliana),转基因拟南芥的GUS组织化学活性表达结果显示,GUS在拟南芥根部表达量最高,莲座叶的表达量亦高,在茎和花中表达量较弱,说明pAhBW3是根和叶丰富表达的启动子。通过qRT-PCR分析,显示pAhBW3调控的GUS基因能响应外源激素、干旱、高盐的胁迫,表现不同程度的上调应答。本研究为pAhBW3启动子的利用和AhBW3基因在花生的抗逆反应机制的进一步研究提供了科学依据。

(2)本文研究方法

调查法:该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。

观察法:用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。

实验法:通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。

文献研究法:通过调查文献来获得资料,从而全面的、正确的了解掌握研究方法。

实证研究法:依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。

定性分析法:对研究对象进行“质”的方面的研究,这个方法需要计算的数据较少。

定量分析法:通过具体的数字,使人们对研究对象的认识进一步精确化。

跨学科研究法:运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。

功能分析法:这是社会科学用来分析社会现象的一种方法,从某一功能出发研究多个方面的影响。

模拟法:通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。

上游启动子区论文参考文献

[1].王明山,任强,陆树,白培明.鸡卵清蛋白上游启动子转录因子Ⅱ的功能及其在肿瘤中的作用[J].中国老年学杂志.2018

[2].庄瑞蓉,储文婷,赵闪闪,陈坤,谢文萍.花生AhBW3基因上游启动子克隆及其功能鉴定[J].农业生物技术学报.2018

[3].戴小凯.小金海棠MxbZIPIO上游启动子克隆与生物信息学分析[D].四川农业大学.2017

[4].刘骉.东方粘虫中肠胰蛋白酶基因上游启动子核心序列的克隆及功能验证[D].西北农林科技大学.2017

[5].王凯,连海峰,牛琼,贾兴芳,刘成霞.胃癌组织中鸡卵清蛋白上游启动子转录因子Ⅱ、神经纤毛蛋白2的表达变化及其意义[J].山东医药.2016

[6].焦点,杨安钢,王禾,温伟红.鸡卵清蛋白上游启动子转录因子2与肿瘤关系的研究进展[J].细胞与分子免疫学杂志.2015

[7].许淑娣,王涛,李惟捷,牛梦婕,李瑛.人NLK上游启动子区的克隆与鉴定[J].科学技术与工程.2015

[8].匡仟卉柠,李景云,季晨博,郭锡镕,倪毓辉.hsa-miR-1908上游启动子区的生物信息学分析[J].临床儿科杂志.2014

[9].黄雪盈,石兰平,杨晟,卢蓉,王博.CaKR1上游启动子分离及其表达分析[J].江西农业学报.2014

[10].李增亮,姜宝飞,李伟,徐皓,徐泽宽.鸡卵清蛋白上游启动子转录因子Ⅱ在人胃癌组织中的表达及临床意义[J].南京医科大学学报(自然科学版).2013

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