旋转异构体库论文-秦晨,曾圣渊,张冰,曾文碧

旋转异构体库论文-秦晨,曾圣渊,张冰,曾文碧

导读:本文包含了旋转异构体库论文开题报告文献综述及选题提纲参考文献,主要关键词:间甲基苯甲醚,旋转异构体,振动光谱,阈值电离

旋转异构体库论文文献综述

秦晨,曾圣渊,张冰,曾文碧[1](2014)在《间甲基苯甲醚分子旋转异构体的质量分辨阈值电离光谱》一文中研究指出间甲基苯甲醚分子有顺式和反式两个转动异构体.利用单光共振双光子电离技术和质量分辨阈值电离技术,研究了间甲基苯甲醚分子顺反异构体的基态到第一电子激发态(S1←S0)的跃迁和阈值电离.得到顺式、反式间甲基苯甲醚分子S1态的激发能(E1)分别为(36049±2)和(36117±2)cm-1,绝热电离能(Ip)分别为(64859±5)和(65110±5)cm-1.结合从头算法和密度泛函理论的量子化学计算,解释了顺式、反式间甲基苯甲醚分子E1和Ip存在差异的原因,并且对S1态和离子基态D0态出现的谱峰进行了标识.间甲基苯甲醚分子顺反异构体在S1态和D0态的活性振动主要是甲基转动、面内环的运动和与取代基相关的弯曲振动.间甲基苯甲醚分子的S1态振动光谱、D0态离子光谱以及理论计算均表明这两个转动异构体在D0态的几何构型与S1态的中性几何构型相比有较大改变,取代基与取代基、取代基与苯环间的相互作用强度高低次序为:S0<S1<D0.(本文来源于《物理化学学报》期刊2014年08期)

缪大俊,吕强,黄旭[2](2011)在《一种基于四层推理模型的旋转异构体库构造方法》一文中研究指出GPCR是一类重要的药物靶标,其侧链构象直接影响着对药物绑定位点的研究.现有的侧链旋转异构体库没有考虑侧链扭角之间的相互影响,而将它们同等看待.本文提出了一种基于四层推理模型的旋转异构体库构造方法,将侧链之间的相互影响也考虑进来,生成了一种富含层次化信息的旋转异构体库.并采用侧链预测程序Rosetta对GPCR Dock 2008和GPCR Dock 2010中的3个目标在本文产生的旋转异构体库的基础上进行预测,其预测精度接近于基于经典的旋转异构体库的侧链预测结果.通过实验还发现,本文提出的采用分层思想的模型生成的旋转异构体库明显优于不采用分层思想的模型生成的旋转异构体库.(本文来源于《苏州大学学报(自然科学版)》期刊2011年04期)

温炜,吕强,杨鹏,杨凌云,吴进珍[3](2011)在《一种基于HMM的蛋白质侧链旋转异构体构造方法》一文中研究指出蛋白质侧链预测是蛋白质结构预测以及蛋白质设计中非常重要的子问题,而旋转异构体库的构造是进行侧链预测的基础,为预测提供搜索空间.现有的旋转异构体库考虑的是单个氨基酸的统计信息,没有考虑与之相邻的氨基酸对其构象产生的影响.本文提出一种基于隐马尔科夫模型的旋转异构体库构造方法,将相邻氨基酸的构象信息也考虑进来,产生与序列相关的旋转异构体库.并采用蛋白质预测程序Rosetta对CASP8中的12个自由建模蛋白质在本文提出的旋转异构体库基础上进行侧链预测,与基于经典的旋转异构体库的侧链预测结果相比,在预测精度上有了一定的提高.(本文来源于《小型微型计算机系统》期刊2011年01期)

张敬来,苗体方,朱蕾[4](2002)在《2-叁氰基乙烯基蒽及其旋转异构体的量子化学研究》一文中研究指出用量子化学从头算方法 ,在RHF/STO - 3G水平上 ,对 2_叁氰基乙烯基蒽 (2_TCVA)分子进行了理论计算 ,优化得到了它的平衡几何构型 ,并计算了它的谐振动频率 .结果表明 :2_TCVA存在两种旋转异构体 :2_TCVA(1)和 2_TCVA(2 ) ,2_TCVA(2 )的总能量比 2_TCVA(1)的略高 .在PM3/CIS水平上计算了它们的电子光谱 ,得到了由基态到各激发态的垂直跃迁能和相应的振子强度 .研究表明 :2_TCVA(1)和 2_TCVA(2 )的强度最大的吸收波长分别为 2 4 9.72nm和 2 89.4 1nm ,2_TCVA(2 )的强度最大的吸收波长比 2_TCVA(1)的要长 .计算结果与实验结果符合得较好(本文来源于《化学研究》期刊2002年02期)

钟儒刚,赵玉芬,戴乾圜,钟儒刚[5](1999)在《N-磷酰化丙氨酸分子内混酐假旋转异构体的MNDO研究》一文中研究指出用MNDO半经验分子轨道计算方法对N-磷酰丙氨酸生成的五配位磷中间体的假旋 转异构体的结构和性质进行了研究。结果表明这些异构体是高活性的,并且具有不同的反应 性质,因此他们可能成为具有多重反应性的合成子.(本文来源于《北京工业大学学报》期刊1999年01期)

荆煦瑛,欧阳天美,陈文驹[6](1985)在《O,O-二甲基二硫代磷酸旋转异构体的红外光谱研究》一文中研究指出我们曾经相继报导了(RO)_2P(S)SH类型化合物的R=Et,i-P_r两种化合物的旋转异构现象的红外及拉曼光谱的研究结果,本文将继续报导同系物R=Me的FT-IR研究结果。标题化合物按文献方法制备及提纯处理。样品的常温及低温光谱是在Nicofet5DX型FT-IR光谱仪上记录的,使用液氮作低温冷却剂。在不同温度下记录的P=S伸展振动带用计算机程序进行分峰处理,结果表明,P=S谱带仍由4个不同频率组成,这四个频率依次为671,661,655和649cm~(-1),它们对应于四个构象不同的旋转异构体。我们得到的结果是,第一,在室温到-80℃范围内,这四个异构体的P=S谱带的相对面积(S%)与温度之间的关系表明,异构体(1)与(2),(3)与(4)之间分别存在着对应相互转化关系,即异构体(1)的含量减少时,(2)便相应增加,反之亦然。(3)与(4)之间也有类似的现象。第二,O~-—R~-基的局部偶极场对P=S键的作用是一种引力场,因此构象(1)对应于四个频率中最高的671cm~(-1)带,构象(4)则对应于最低的频率649cm~(-1)。第叁,由于存在S—H……S=P内氢键,因此S—H基的空间取向一旦形成,便不易改变,只有—OR基可绕O—P键旋转,所以存在异构体(1)与(2),(3)与(4)之间的相互转化关系。(本文来源于《光谱学与光谱分析》期刊1985年06期)

陈文驹,宋树贵,荆煦瑛[7](1984)在《O,O-二乙基二硫代磷酸旋转异构体的红外及拉曼光谱研究》一文中研究指出本文研究了O,O-二乙基二硫代磷酸从室温到-50℃的红外光谱及拉曼光谱。发现其P=S,P(—O)~2,P—S和S—H等基团的振动带都具有多重结构,而且谱带的相对强度随着样品的温度改变而发生变化。根据这些实验结果,提出了O,O-二乙基二硫代磷酸分子存在四种不同的旋转异构体,并且对不同异构体引起振动带发生分裂的原因进行了讨论。(本文来源于《化学学报》期刊1984年01期)

唐敖庆,陈世元,王治中[8](1978)在《正链烷烃分子内旋转异构体的相对浓度的理论研究》一文中研究指出本文从正链烷烃分子阻碍旋转产生的构型特征出发,根据玻尔兹曼统计理论,推导出内旋转异构体相对浓度的一般公式,利用此式、非常简便地计算了正丁烷到正庚烷四个分子的旋转异构体的百分浓度,计算值与实验值比较,符合良好。(本文来源于《浙江大学学报》期刊1978年01期)

旋转异构体库论文开题报告

(1)论文研究背景及目的

此处内容要求:

首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景,再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题,并提出你的论文准备的观点或解决方法。

写法范例:

GPCR是一类重要的药物靶标,其侧链构象直接影响着对药物绑定位点的研究.现有的侧链旋转异构体库没有考虑侧链扭角之间的相互影响,而将它们同等看待.本文提出了一种基于四层推理模型的旋转异构体库构造方法,将侧链之间的相互影响也考虑进来,生成了一种富含层次化信息的旋转异构体库.并采用侧链预测程序Rosetta对GPCR Dock 2008和GPCR Dock 2010中的3个目标在本文产生的旋转异构体库的基础上进行预测,其预测精度接近于基于经典的旋转异构体库的侧链预测结果.通过实验还发现,本文提出的采用分层思想的模型生成的旋转异构体库明显优于不采用分层思想的模型生成的旋转异构体库.

(2)本文研究方法

调查法:该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。

观察法:用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。

实验法:通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。

文献研究法:通过调查文献来获得资料,从而全面的、正确的了解掌握研究方法。

实证研究法:依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。

定性分析法:对研究对象进行“质”的方面的研究,这个方法需要计算的数据较少。

定量分析法:通过具体的数字,使人们对研究对象的认识进一步精确化。

跨学科研究法:运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。

功能分析法:这是社会科学用来分析社会现象的一种方法,从某一功能出发研究多个方面的影响。

模拟法:通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。

旋转异构体库论文参考文献

[1].秦晨,曾圣渊,张冰,曾文碧.间甲基苯甲醚分子旋转异构体的质量分辨阈值电离光谱[J].物理化学学报.2014

[2].缪大俊,吕强,黄旭.一种基于四层推理模型的旋转异构体库构造方法[J].苏州大学学报(自然科学版).2011

[3].温炜,吕强,杨鹏,杨凌云,吴进珍.一种基于HMM的蛋白质侧链旋转异构体构造方法[J].小型微型计算机系统.2011

[4].张敬来,苗体方,朱蕾.2-叁氰基乙烯基蒽及其旋转异构体的量子化学研究[J].化学研究.2002

[5].钟儒刚,赵玉芬,戴乾圜,钟儒刚.N-磷酰化丙氨酸分子内混酐假旋转异构体的MNDO研究[J].北京工业大学学报.1999

[6].荆煦瑛,欧阳天美,陈文驹.O,O-二甲基二硫代磷酸旋转异构体的红外光谱研究[J].光谱学与光谱分析.1985

[7].陈文驹,宋树贵,荆煦瑛.O,O-二乙基二硫代磷酸旋转异构体的红外及拉曼光谱研究[J].化学学报.1984

[8].唐敖庆,陈世元,王治中.正链烷烃分子内旋转异构体的相对浓度的理论研究[J].浙江大学学报.1978

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