罗铮:黔北麻羊Tβ4基因多态性及生物信息学分析论文

罗铮:黔北麻羊Tβ4基因多态性及生物信息学分析论文

本文主要研究内容

作者罗铮,翁吉梅,艾锦新,龙安炬,罗卫星,蔡惠芬(2019)在《黔北麻羊Tβ4基因多态性及生物信息学分析》一文中研究指出:本研究旨在对黔北麻羊胸腺素β4(thymosin beta 4,Tβ4)基因的多态位点进行筛选及生物信息学分析。根据GenBank中山羊Tβ4基因序列(登录号:NC030810和NW017189516),应用Primer Premier 5.0软件设计引物,运用混合DNA池结合PCR产物直接测序获得黔北麻羊Tβ4基因X染色体第1、2、3外显子和3号染色体第1外显子序列进行多态性分析,利用生物信息学分析软件对黔北麻羊Tβ4基因进行同源性、系统进化树、理化性质、疏水性、卷曲螺旋、跨膜结构、信号肽、亚细胞定位、结构域、磷酸化位点、糖基化位点、二级结构和三级结构分析。结果显示,共筛选出10个SNPs,分别为:G55C、C82T、G112A、C129T、G216A、G431A、G551T、T579A、A609G和A619G。同源性比对分析结果显示,黔北麻羊与黄牛、马、野猪、人、裸滨鼠、褐家鼠、小家鼠和原鸡Tβ4基因核苷酸序列同源性分别为97.8%、96.3%、95.6%、94.1%、94.8%、91.1%、92.6%和86.7%。蛋白理化性质分析显示,黔北麻羊Tβ4蛋白理论等电点为5.02,亲水值最小为-3.011,无疏水性氨基酸,无卷曲螺旋,不是跨膜蛋白,无信号肽存在,分布在细胞核(60.9%)、线粒体(4.3%)、细胞骨架(17.4%)和细胞质(17.4%),有1个THY结构域,有1个苏氨酸磷酸化位点,无N糖基化位点,有4个O糖基化位点。二级结构分析显示,C129T突变使其蛋白质二级结构中α-螺旋增加,无规则卷曲减少。本研究成功筛选出黔北麻羊Tβ4基因多态位点,为研究黔北麻羊育种的分子遗传标记辅助选择提供了参考依据。

Abstract

ben yan jiu zhi zai dui qian bei ma yang xiong xian su β4(thymosin beta 4,Tβ4)ji yin de duo tai wei dian jin hang shai shua ji sheng wu xin xi xue fen xi 。gen ju GenBankzhong shan yang Tβ4ji yin xu lie (deng lu hao :NC030810he NW017189516),ying yong Primer Premier 5.0ruan jian she ji yin wu ,yun yong hun ge DNAchi jie ge PCRchan wu zhi jie ce xu huo de qian bei ma yang Tβ4ji yin Xran se ti di 1、2、3wai xian zi he 3hao ran se ti di 1wai xian zi xu lie jin hang duo tai xing fen xi ,li yong sheng wu xin xi xue fen xi ruan jian dui qian bei ma yang Tβ4ji yin jin hang tong yuan xing 、ji tong jin hua shu 、li hua xing zhi 、shu shui xing 、juan qu luo xuan 、kua mo jie gou 、xin hao tai 、ya xi bao ding wei 、jie gou yu 、lin suan hua wei dian 、tang ji hua wei dian 、er ji jie gou he san ji jie gou fen xi 。jie guo xian shi ,gong shai shua chu 10ge SNPs,fen bie wei :G55C、C82T、G112A、C129T、G216A、G431A、G551T、T579A、A609Ghe A619G。tong yuan xing bi dui fen xi jie guo xian shi ,qian bei ma yang yu huang niu 、ma 、ye zhu 、ren 、luo bin shu 、he jia shu 、xiao jia shu he yuan ji Tβ4ji yin he gan suan xu lie tong yuan xing fen bie wei 97.8%、96.3%、95.6%、94.1%、94.8%、91.1%、92.6%he 86.7%。dan bai li hua xing zhi fen xi xian shi ,qian bei ma yang Tβ4dan bai li lun deng dian dian wei 5.02,qin shui zhi zui xiao wei -3.011,mo shu shui xing an ji suan ,mo juan qu luo xuan ,bu shi kua mo dan bai ,mo xin hao tai cun zai ,fen bu zai xi bao he (60.9%)、xian li ti (4.3%)、xi bao gu jia (17.4%)he xi bao zhi (17.4%),you 1ge THYjie gou yu ,you 1ge su an suan lin suan hua wei dian ,mo Ntang ji hua wei dian ,you 4ge Otang ji hua wei dian 。er ji jie gou fen xi xian shi ,C129Ttu bian shi ji dan bai zhi er ji jie gou zhong α-luo xuan zeng jia ,mo gui ze juan qu jian shao 。ben yan jiu cheng gong shai shua chu qian bei ma yang Tβ4ji yin duo tai wei dian ,wei yan jiu qian bei ma yang yo chong de fen zi wei chuan biao ji fu zhu shua ze di gong le can kao yi ju 。

论文参考文献

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  • 论文详细介绍

    论文作者分别是来自中国畜牧兽医的罗铮,翁吉梅,艾锦新,龙安炬,罗卫星,蔡惠芬,发表于刊物中国畜牧兽医2019年08期论文,是一篇关于黔北麻羊论文,基因论文,生物信息学论文,中国畜牧兽医2019年08期论文的文章。本文可供学术参考使用,各位学者可以免费参考阅读下载,文章观点不代表本站观点,资料来自中国畜牧兽医2019年08期论文网站,若本站收录的文献无意侵犯了您的著作版权,请联系我们删除。

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