俎峰:甘蓝型油菜BnEOD3基因克隆与比较测序分析论文

俎峰:甘蓝型油菜BnEOD3基因克隆与比较测序分析论文

本文主要研究内容

作者俎峰,李霞,何晓莹,张国建,张建昆,董云松,王敬乔,束正齐,陈苇(2019)在《甘蓝型油菜BnEOD3基因克隆与比较测序分析》一文中研究指出:【目的】克隆拟南芥籽粒大小发育母体效应基因EOD3在甘蓝型油菜籽粒中表达的同源基因拷贝,并在大、小籽粒材料间开展序列比较分析。【方法】以1份大籽粒与1份小籽粒种质发育中的籽粒为研究材料,利用RT-PCR克隆发育中籽粒表达的BnEOD3基因拷贝,结合生物信息学手段在大、小籽粒材料间进行差异比较分析。【结果】生物信息学分析发现BnEOD3基因在甘蓝型油菜中有4个同源拷贝(BnaC04g00760D,BnaA05g01200D,BnaC04g50960D,BnaA04g27100D)。其中BnaA04g27100D在大、小籽粒材料发育籽粒中均有表达,且在第114碱基处存在SNP变异(大籽粒为C,小籽粒为G),BnaC04g50960D则仅在小籽粒材料中检测到表达,BnaC04g00760D与BnaA05g01200D基因则在大、小籽粒中均未检测到表达。【结论】BnEOD3基因仅有2个拷贝(BnaA04g27100D和BnaC04g50960D)在发育籽粒中检测到表达,其中BnaA04g27100D在第114碱基处的SNP变异导致氨基酸序列甘氨酸(G)与丙氨酸(A)的氨基酸的差异,可能与大、小籽粒性状有关。

Abstract

【mu de 】ke long ni na gai zi li da xiao fa yo mu ti xiao ying ji yin EOD3zai gan lan xing you cai zi li zhong biao da de tong yuan ji yin kao bei ,bing zai da 、xiao zi li cai liao jian kai zhan xu lie bi jiao fen xi 。【fang fa 】yi 1fen da zi li yu 1fen xiao zi li chong zhi fa yo zhong de zi li wei yan jiu cai liao ,li yong RT-PCRke long fa yo zhong zi li biao da de BnEOD3ji yin kao bei ,jie ge sheng wu xin xi xue shou duan zai da 、xiao zi li cai liao jian jin hang cha yi bi jiao fen xi 。【jie guo 】sheng wu xin xi xue fen xi fa xian BnEOD3ji yin zai gan lan xing you cai zhong you 4ge tong yuan kao bei (BnaC04g00760D,BnaA05g01200D,BnaC04g50960D,BnaA04g27100D)。ji zhong BnaA04g27100Dzai da 、xiao zi li cai liao fa yo zi li zhong jun you biao da ,ju zai di 114jian ji chu cun zai SNPbian yi (da zi li wei C,xiao zi li wei G),BnaC04g50960Dze jin zai xiao zi li cai liao zhong jian ce dao biao da ,BnaC04g00760Dyu BnaA05g01200Dji yin ze zai da 、xiao zi li zhong jun wei jian ce dao biao da 。【jie lun 】BnEOD3ji yin jin you 2ge kao bei (BnaA04g27100Dhe BnaC04g50960D)zai fa yo zi li zhong jian ce dao biao da ,ji zhong BnaA04g27100Dzai di 114jian ji chu de SNPbian yi dao zhi an ji suan xu lie gan an suan (G)yu bing an suan (A)de an ji suan de cha yi ,ke neng yu da 、xiao zi li xing zhuang you guan 。

论文参考文献

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  • 论文详细介绍

    论文作者分别是来自西南农业学报的俎峰,李霞,何晓莹,张国建,张建昆,董云松,王敬乔,束正齐,陈苇,发表于刊物西南农业学报2019年01期论文,是一篇关于油菜论文,基因克隆论文,大籽粒论文,比较测序论文,基因论文,西南农业学报2019年01期论文的文章。本文可供学术参考使用,各位学者可以免费参考阅读下载,文章观点不代表本站观点,资料来自西南农业学报2019年01期论文网站,若本站收录的文献无意侵犯了您的著作版权,请联系我们删除。

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