扩增法论文-秦万,王琼,王明栋,张娟,徐勇

扩增法论文-秦万,王琼,王明栋,张娟,徐勇

导读:本文包含了扩增法论文开题报告文献综述及选题提纲参考文献,主要关键词:结核,分枝杆菌,核酸检测,检出率

扩增法论文文献综述

秦万,王琼,王明栋,张娟,徐勇[1](2019)在《RNA恒温扩增法与PCR-荧光探针法在含结核菌菌量较少标本中检出率的比较》一文中研究指出目的比较实时荧光核酸恒温扩增检测技术(SAT)扩增法与PCR-荧光探针法两种检测方法在含结核菌菌量较少标本中对临床结核诊断的应用价值。方法对临床确诊的163例结核患者胸水(81例)、腹水(12例)、脑脊液(70例)标本用两种结核菌检测方法进行检测,同时对2018年6月来我院就诊和住院确诊的282例结核患者各类标本(痰、纤刷物、脓分泌物等)进行检测。结果 163例患者中检测阳性率分别为PCR–荧光探针法50.31%(82/163)、SAT扩增法82.21%(134/163,两者均阳性率为32.52%(53/163);282例患者中DNA(PCR-荧光探针法)检出率为83%(234/282)、RNA(SAT法)检出率为84.4%(238/282)、DNA与RNA均阳性率为67.38%(190/282)。结论 RNA恒温扩增法检测检测结核菌含菌量较少标本的敏感性比PCR-荧光扩增法高,故RNA恒温扩增法的推广检测对结核病的诊断具有重要意义,联合检测可互补对方的不足之处。(本文来源于《贵州医药》期刊2019年09期)

张梦寒,崔家瑞,王小龙[2](2019)在《环介导等温扩增法快速检测感染性腹泻病例标本中的空肠弯曲菌》一文中研究指出目的建立环介导等温扩增法(loop-mediated isothermal amplification,LAMP)快速检测感染性腹泻病例标本中的空肠弯曲菌。方法收集2017年苏州市辖区3家医院的感染性腹泻患者的粪便样品326件,用LAMP法对空肠弯曲菌的DNA进行检测,在DNA扩增试剂盒提供的反应体系加入引物和模板进行空肠弯曲菌的LAMP反应,测定LAMP方法检测空肠弯曲菌菌液的灵敏度;同时用滤膜法进行空肠弯曲菌的分离培养,参照GB 4789.9-2014《食品安全国家标准食品微生物学检验空肠弯曲菌检验》分离鉴定空肠弯曲菌。结果 LAMP法检测空肠弯曲菌菌液的灵敏度是2.2 CFU/μL;326件腹泻患者粪便中16件空肠弯曲菌LAMP检测为阳性,阳性率为4.91%。共分离培养出14株空肠弯曲菌,阳性率为4.29%。结论针对感染性腹泻患者的粪便样本的空肠弯曲菌检测项目,可以采用LAMP方法进行等温扩增初筛,初筛阳性的样品再有针对性地进行后续的传统培养。(本文来源于《食品安全质量检测学报》期刊2019年18期)

马静,马蓓蓓,李清元,周攀,黄英[3](2019)在《双扩增法和real-time RT-PCR法检测手足口病的比较》一文中研究指出目的开展双扩增法和real-time RT-PCR法检测手足口病的比较性研究,为基层实验室建立手足口病科学快速检测方法提供依据。方法对2016年-2017年宜昌市9县市区采集的205份手足口病患者的咽拭子样本,同时采用双扩增法和real-time RT-PCR法检测手足口病通用病毒、CoxA16、EV71,比较2种方法检测结果的差异,对2种方法检测结果相异的标本进行测序。结果双扩增法同real-time RT-PCR法检测结果比较,阳性标本数差异无统计学意义(χ~2=0.743,P>0.05);且2种方法与测序方法结果比较,符合数差异无统计学意义(χ~2=3.32,P>0.05)。结论双扩增法适合基层实验室推广使用。(本文来源于《中国卫生检验杂志》期刊2019年16期)

杨丽霞,曾思思,钟菲菲[4](2019)在《实时荧光等温扩增法检测4种常见食源性致病菌》一文中研究指出目的建立实时荧光等温扩增法(loop-mediated isothermal amplification,LAMP)检测金黄色葡萄球菌、沙门氏菌、副溶血性弧菌、单核细胞增生李斯特氏菌4种常见食源性致病菌的分析方法。方法根据4种致病菌特异性基因合成LAMP引物,在反应前加入荧光染料,在63℃条件下反应45 min;反应结果可以根据扩增曲线变化直接判断。并通过在实际样品中添加标准菌株菌液,测定了其在增菌0、6、24 h的检测灵敏度。结果金黄色葡萄球菌、沙门氏菌、单核细胞增生李斯特氏菌等基因组DNA的LAMP检测灵敏度为1 pg,副溶血性弧菌的检测灵敏度为10 pg;在样品加标实验中,其灵敏度在6 h分别可达到101、100、100、102 CFU/mL。结论该方法用于食源性致病菌的快速检测,具有可实时监控反应过程、反应快速,灵敏度和特异性高等优点,适合于基层食品安全监管领域现场快速检测。(本文来源于《食品安全质量检测学报》期刊2019年14期)

刘文鑫,袁超文,张力国,冯瑜菲[5](2019)在《交叉引物扩增法检测食品中大肠杆菌不耐热肠毒素的研究》一文中研究指出产肠毒素性大肠杆菌(enterotoxigenic Escherichia coli,ETEC)可引起严重食源性疾病,建立快速、准确的检测方法对保障食品安全和人类健康具有重要意义。对ETEC不耐热肠毒素(heat-labile enterotoxin,LT)基因保守序列设计交叉引物等温扩增(cross priming amplification,CPA)特异性引物,同时对反应温度、脱氧核糖核苷叁磷酸(deoxyribonucleoside triphosphate,dNTPs)浓度、Bst-DNA聚合酶大片段浓度、Mg~(2+)浓度、甜菜碱浓度和反应时间进行优化;选取6株大肠杆菌和其他8株近源菌对CPA法进行特异性和敏感性分析;将纯培养后的产肠毒素大肠杆菌菌液稀释后随机污染46份不含LT肠毒素的生猪肉样品以评价该方法的应用效果。结果表明,CPA的最优反应温度为62℃、dNTPs浓度为0.3 mol/L、Bst聚合酶浓度为8 U/管、Mg~(2+)浓度为2.0 mmol/L、甜菜碱浓度为0.8 mol/L、反应时间为45 min;CPA方法检测产肠毒素大肠杆菌菌液的最低检出量为40 cfu/mL,为环介导等温扩增(loop-mediated isothermal amplification,LAMP)方法的2倍,且特异性较高;46份人工污染生猪肉样品中共检测出阳性样品7份,CPA扩增结果与LAMP和荧光定量聚合酶链反应结果一致,检出率均为15.2%。(本文来源于《食品研究与开发》期刊2019年09期)

石芳[6](2019)在《一步核酸扩增法诊断乳腺癌前哨淋巴结转移的meta分析》一文中研究指出目的:应用诊断性试验的meta分析方法,从病人和淋巴结两个角度进行数据分析,评价一步核酸扩增法(OSNA)对乳腺癌前哨淋巴结(SLN)转移和宏转移的诊断性能,为OSNA的临床应用提供参考依据。方法:计算机检索PubMed、Web of Science、Cochrane library、Scopus、BMJ Journals Online、Wiley Online Library、Elsevier Science、Springer-Link、Taylor&Francis Online、Karger Publishers、中国知网、万方数据知识服务平台、维普中文期刊全文数据库和中国生物医学文献数据库等14个数据库,获取公开发表的关于OSNA诊断乳腺癌SLN转移和宏转移的中英文文献。检索时限为建库至2018年12月31日。根据预先制定的纳入排除标准筛选文献。使用Stata软件进行诊断性试验的meta分析,分别以病人数和淋巴结数为单位,评价OSNA诊断乳腺癌SLN转移和宏转移的灵敏度、特异度、阳性预测值(PLR)、阴性预测值(NLR)、诊断比值比(DOR)和曲线下面积(AUC)。以地区、病人数/淋巴结数、金标准方法、是否使用细胞角蛋白19免疫组织化学染色(CK19 IHC)和是否排除组织分配偏倚(TAB)为协变量进行亚组分析和meta回归。结果:1.以病人数为单位研究OSNA诊断乳腺癌SLN转移的meta分析共纳入12篇文献,OSNA的灵敏度是0.87(95%CI 0.81-0.91),特异度是0.92(95%CI0.86-0.95),PLR是10.65(95%CI 6.18-18.34),NLR是0.14(95%CI 0.10-0.20),DOR是75.08(95%CI 37.77-149.22),AUC是0.94(95%CI 0.91-0.95)。2.以病人数为单位进行OSNA诊断SLN转移的亚组分析和meta回归,亚洲乳腺癌患者中灵敏度和特异度是0.82和0.92,其他地区乳腺癌患者中灵敏度和特异度是0.91和0.90,灵敏度的差异有统计学意义(P<0.05),特异度的差异无统计学意义(P>0.05);在病人数<100的文献中灵敏度和特异度是0.95和0.94,在病人数≥100的文献中灵敏度和特异度是0.85和0.91,灵敏度和特异度的差异均无统计学意义(P>0.05);在金标准使用苏木精和伊红(HE)染色的文献中灵敏度和特异度是0.87和0.89,在金标准使用HE染色和IHC联合诊断的文献中灵敏度和特异度是0.88和0.95,灵敏度和特异度的差异均有统计学意义(P<0.05)。3.以淋巴结数为单位研究OSNA诊断乳腺癌SLN转移的meta分析共纳入18篇文献,OSNA的灵敏度是0.90(95%CI 0.86-0.93),特异度是0.96(95%CI0.95-0.97),PLR是22.62(95%CI 16.57-30.87),NLR是0.11(95%CI 0.08-0.15),DOR是211.81(95%CI 120.75-371.53),AUC是0.98(95%CI 0.96-0.99)。4.以淋巴结数为单位进行OSNA诊断SLN转移的亚组分析和meta回归,亚洲乳腺癌患者中灵敏度和特异度是0.83和0.95,其他地区乳腺癌患者中灵敏度和特异度是0.93和0.97,灵敏度和特异度的差异均有统计学意义(P<0.05);在淋巴结数<100的文献中灵敏度和特异度是0.91和0.97,在淋巴结数≥100的文献中灵敏度和特异度是0.89和0.96,灵敏度和特异度的差异均有统计学意义(P<0.05);在金标准使用HE染色的文献中灵敏度和特异度是0.89和0.95,在金标准使用HE和IHC联合诊断的文献中灵敏度和特异度是0.91和0.97,灵敏度和特异度的差异均有统计学意义(P<0.05);在使用CK19 IHC的文献中灵敏度和特异度是0.90和0.97,在不使用CK19 IHC的文献中灵敏度和特异度是0.90和0.95,灵敏度和特异度的差异均有统计学意义(P<0.05);在排除TAB的文献中灵敏度和特异度是0.96和0.98,在未排除TAB的文献中灵敏度和特异度是0.87和0.95,灵敏度的差异无统计学意义(P>0.05),特异度的差异有统计学意义(P<0.05)。5.以病人数为单位研究OSNA诊断乳腺癌SLN宏转移的meta分析共纳入8篇文献,OSNA的灵敏度是0.80(95%CI 0.72-0.86),特异度是0.96(95%CI0.92-0.98),PLR是21.67(95%CI 10.78-43.57),NLR是0.21(95%CI 0.15-0.29),DOR是103.00(95%CI 53.91-196.78),AUC是0.92(95%CI 0.90-0.94)。6.以病人数为单位进行OSNA诊断SLN宏转移的亚组分析和meta回归,亚洲乳腺癌患者中灵敏度和特异度是0.77和0.96,其他地区乳腺癌患者中灵敏度和特异度是0.90和0.97,灵敏度的差异有统计学意义(P<0.05),特异度的差异无统计学意义(P>0.05);在金标准使用HE的文献中灵敏度和特异度是0.80和0.95,在金标准使用HE和IHC联合诊断的文献中灵敏度和特异度是0.80和0.97,灵敏度的差异有统计学意义(P<0.05),特异度的差异无统计学意义(P>0.05)。7.以淋巴结数为单位研究OSNA诊断乳腺癌SLN宏转移的meta分析共纳入12篇文献,OSNA的灵敏度是0.85(95%CI 0.80-0.88),特异度是0.98(95%CI0.97-0.99),PLR是55.11(95%CI 30.07-101.00),NLR是0.15(95%CI 0.12-0.20),DOR是355.80(95%CI 202.40-625.46),AUC是0.94(95%CI 0.92-0.96)。8.以淋巴结数为单位进行OSNA诊断乳腺癌SLN宏转移的亚组分析和meta回归,在金标准使用HE的文献中灵敏度和特异度是0.85和0.99,在金标准使用HE和IHC联合诊断的文献中灵敏度和特异度是0.85和0.98,灵敏度的差异有统计学意义(P<0.05),特异度的差异无统计学意义(P>0.05)。在使用CK19 IHC文献中灵敏度和特异度是0.82和0.99,在不使用CK19 IHC的文献中灵敏度和特异度是0.88和0.98,灵敏度的差异有统计学意义(P<0.05),特异度的差异无统计学意义(P>0.05)。在排除TAB的文献中灵敏度和特异度是0.83和0.98,在未排除TAB的文献中灵敏度和特异度是0.85和0.98,灵敏度的差异有统计学意义(P<0.05),特异度的差异无统计学意义(P>0.05)。结论:1.OSNA对乳腺癌SLN转移和宏转移有较强的诊断效能,OSNA可作为乳腺癌患者术中SLN活检的常规诊断方法。2.以病人数为单位评估OSNA的诊断效能低于以淋巴结数为单位评估OSNA的诊断效能。3.OSNA诊断乳腺癌SLN转移的灵敏度高于诊断SLN宏转移的灵敏度,特异度低于诊断SLN宏转移的特异度。4.OSNA对亚洲地区乳腺癌患者的诊断效能低于对其他地区乳腺癌患者的诊断效能。5.联合应用CK19 IHC后,OSNA对乳腺癌SLN转移的诊断效能提高,对SLN宏转移的诊断效能降低。6.排除TAB后,OSNA对乳腺癌SLN转移的诊断效能提高,对SLN宏转移的诊断效能降低。(本文来源于《吉林大学》期刊2019-05-01)

曹佳伟,邹南南,江国峰,纪海玲,李同霞[7](2019)在《PCR-荧光探针法与RNA恒温扩增法对肺结核诊断的价值》一文中研究指出目的探讨RNA恒温扩增法和PCR-荧光探针法在肺结核临床诊断中的价值及意义。方法以403例临床病原学确诊的肺结核病人为观察组,50例无肺部疾病病人为对照组,分别采用齐-尼痰涂片抗酸染色法、改良罗氏培养基培养法、PCR-荧光探针法和RNA恒温扩增法检测痰标本中结核分枝杆菌,并将检测结果进行对比分析。结果齐-尼痰涂片抗酸染色法、改良罗氏培养基培养法、PCR-荧光探针法和RNA恒温扩增法检测痰标本中结核分枝杆菌的灵敏度分别为37.5%、65.2%、68.7%、60.8%;特异度分别为100%、100%、98%、100%。结论PCR-荧光探针法与RNA恒温扩增法检测结核分枝杆菌快速、敏感、可靠,适合作为肺结核实验室辅助临床诊断的有效检测方法,可为肺结核的早期诊断和早期治疗提供重要依据。(本文来源于《精准医学杂志》期刊2019年02期)

庄仕龙,高健齐,刘志辉[8](2019)在《环介导等温扩增法在淋巴结结核诊断中的应用研究》一文中研究指出目的:总结环介导等温扩增(LAMP)在淋巴结结核诊断中的临床意义。方法:将2017年1月至2018年10月广州市胸科医院收治的124例淋巴结结核手术获取的淋巴结标本进行组织匀浆,然后运用LAMP法检测结核分枝杆菌,并对阳性病例进行药物敏感性检测,同时采用涂片检测、结核菌培养、Xpert方法,比较其阳性检测结果和敏感性、特异性。结果:LAMP检测法阳性率高于涂片检测、结核培养法,与Xpert法之间的无明显差别。结论:LAMP法在临床上对于淋巴结结核的检查阳性率高,且便捷、准确,时间由传统方法的数周缩短到2天以内。(本文来源于《岭南急诊医学杂志》期刊2019年02期)

林青[9](2019)在《环介导等温扩增法对虾酱中致病菌检测结果的分析》一文中研究指出样品按照GB4789系列标准进行增菌后,提取致病菌核酸利用环介导等温扩增技术对检测虾酱中食源性致病菌进行快速检测。结果显示:5种致病菌沙门氏菌、志贺氏菌、金黄色葡萄球菌、副溶血性弧菌和大肠杆菌O157检测结果阴性,符合率100%,在副溶血性弧菌中有假阳性出现。环介导等温法检测虾酱时应考虑有干扰导致假阳性出现的可能。(本文来源于《吉林农业》期刊2019年07期)

刘亚丽,叶莎,张文娟,王洁,刘畅[10](2019)在《体外培养法与RNA等温扩增法对脲原体检测能力比较》一文中研究指出目的比较体外培养法与RNA等温扩增法对脲原体的检测能力。方法 2016年1-8月共收集了103份就诊于北京协和医院门诊患者的首次尿标本。标本平均分成3份,分别用于脲原体的检测。第1份采用RNA等温扩增法,第2份采用体外培养法,第3份采用体外培养联合测序法。其中,体外培养联合测序法将作为参考方法,横向评估体外培养法和RNA恒温扩增法对脲原体的检测能力。结果基于体外培养联合测序法,共有24例标本(23.30%)检测出了脲原体。其中,14例(17.50%)来自于男性,10例(43.47%)来自于女性,差异有统计学意义(P=0.022);40~<50岁脲原体检出率最高(5/12,41.67%)。与参考方法相比,体外培养法的灵敏度和特异度分别为75.00%(18/24)和100.00%(79/79);RNA等温扩增法的灵敏度和特异度分别为95.83%(23/24)和96.20%(76/79),差异无统计学意义(P>0.05)。在24份检测出脲原体阳性标本中,17例(70.83%)为微小脲原体,7例(29.17%)为解脲脲原体,未检查到微小脲原体和解脲脲原体共同存在的情况。18例培养阳性标本进行了体外药敏测定,其中环丙沙星和氧氟沙星的体外敏感性最差。结论与培养联合测序法相比,体外培养法和RNA等温扩增法均表现出了较好的灵敏度和特异度,但从临床应用角度来讲,二者联合使用可能会对脲原体感染的诊断和治疗提供更全面的指导。(本文来源于《国际检验医学杂志》期刊2019年06期)

扩增法论文开题报告

(1)论文研究背景及目的

此处内容要求:

首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景,再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题,并提出你的论文准备的观点或解决方法。

写法范例:

目的建立环介导等温扩增法(loop-mediated isothermal amplification,LAMP)快速检测感染性腹泻病例标本中的空肠弯曲菌。方法收集2017年苏州市辖区3家医院的感染性腹泻患者的粪便样品326件,用LAMP法对空肠弯曲菌的DNA进行检测,在DNA扩增试剂盒提供的反应体系加入引物和模板进行空肠弯曲菌的LAMP反应,测定LAMP方法检测空肠弯曲菌菌液的灵敏度;同时用滤膜法进行空肠弯曲菌的分离培养,参照GB 4789.9-2014《食品安全国家标准食品微生物学检验空肠弯曲菌检验》分离鉴定空肠弯曲菌。结果 LAMP法检测空肠弯曲菌菌液的灵敏度是2.2 CFU/μL;326件腹泻患者粪便中16件空肠弯曲菌LAMP检测为阳性,阳性率为4.91%。共分离培养出14株空肠弯曲菌,阳性率为4.29%。结论针对感染性腹泻患者的粪便样本的空肠弯曲菌检测项目,可以采用LAMP方法进行等温扩增初筛,初筛阳性的样品再有针对性地进行后续的传统培养。

(2)本文研究方法

调查法:该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。

观察法:用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。

实验法:通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。

文献研究法:通过调查文献来获得资料,从而全面的、正确的了解掌握研究方法。

实证研究法:依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。

定性分析法:对研究对象进行“质”的方面的研究,这个方法需要计算的数据较少。

定量分析法:通过具体的数字,使人们对研究对象的认识进一步精确化。

跨学科研究法:运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。

功能分析法:这是社会科学用来分析社会现象的一种方法,从某一功能出发研究多个方面的影响。

模拟法:通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。

扩增法论文参考文献

[1].秦万,王琼,王明栋,张娟,徐勇.RNA恒温扩增法与PCR-荧光探针法在含结核菌菌量较少标本中检出率的比较[J].贵州医药.2019

[2].张梦寒,崔家瑞,王小龙.环介导等温扩增法快速检测感染性腹泻病例标本中的空肠弯曲菌[J].食品安全质量检测学报.2019

[3].马静,马蓓蓓,李清元,周攀,黄英.双扩增法和real-timeRT-PCR法检测手足口病的比较[J].中国卫生检验杂志.2019

[4].杨丽霞,曾思思,钟菲菲.实时荧光等温扩增法检测4种常见食源性致病菌[J].食品安全质量检测学报.2019

[5].刘文鑫,袁超文,张力国,冯瑜菲.交叉引物扩增法检测食品中大肠杆菌不耐热肠毒素的研究[J].食品研究与开发.2019

[6].石芳.一步核酸扩增法诊断乳腺癌前哨淋巴结转移的meta分析[D].吉林大学.2019

[7].曹佳伟,邹南南,江国峰,纪海玲,李同霞.PCR-荧光探针法与RNA恒温扩增法对肺结核诊断的价值[J].精准医学杂志.2019

[8].庄仕龙,高健齐,刘志辉.环介导等温扩增法在淋巴结结核诊断中的应用研究[J].岭南急诊医学杂志.2019

[9].林青.环介导等温扩增法对虾酱中致病菌检测结果的分析[J].吉林农业.2019

[10].刘亚丽,叶莎,张文娟,王洁,刘畅.体外培养法与RNA等温扩增法对脲原体检测能力比较[J].国际检验医学杂志.2019

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