本文主要研究内容
作者姜智文（2019）在《一株赛鸽源基因Ⅵk亚型新城疫病毒的分离鉴定及其全基因组分析》一文中研究指出：新城疫是由新城疫病毒（Newcastle disease virus,NDV）引起并导致禽类高死亡率的一种烈性传染性疾病,该病毒可引起包括鸽子在内的多种禽类或鸟类发病。鸽源新城疫病毒又被称为鸽副黏病毒Ⅰ型,其基因组为单股负链、无节段RNA,共编码6个结构蛋白和2个非结构蛋白,结构基因在基因组中排列为3’-NP-P-M-F-HN-L-5’,病毒基因组长度遵循“六碱基原则”。根据对鸡的致病性可以将新城疫病毒分为强毒力毒株、中等毒力毒株和弱毒力毒株3种,鸽源新城疫病毒通常对鸽子的致病性较强,主要引起鸽子出现典型的神经症状。根据基因组大小和遗传进化分析可以将新城疫病毒分为ClassⅠ和ClassⅡ两大类,ClassⅠ分支包括基因19型,ClassⅡ分支包括基因ⅠⅩⅧ型,而鸽源新城疫病毒通常属于ClassⅡ基因Ⅵ型。本研究采集陕西省西安市某赛鸽公棚疑似感染新城疫赛鸽的肝脏、脾脏、肾脏和脑等组织病料,使用9日龄SPF鸡胚分离病毒,并运用HA、HI试验验证,确定分离病毒为新城疫病毒,并命名为NDV/pigeon/China/Shaanxi-06/2018。运用RT-PCR技术扩增NDV/pigeon/China/Shaanxi-06/2018分离株F基因,经测序验证后进行遗传进化分析,结果显示该分离株属于ClassⅡ基因Ⅵk亚型NDV毒株。F基因同源性分析结果显示NDV/pigeon/China/Shaanxi-06/2018分离株与上海株Pigeon/Shanghai/215/2011、Pi/China/SH/2013/163和Pi/China/SH/2013/168核苷酸同源性最高,与山东株Pigeon/China/SD069/2012、比利时株PPMV-1/Belgium/11-09620/2011氨基酸同源性最高。测定该分离株致病指数MDT（110 h）和ICPI（0.31）,根据OIE规定的毒力判定标准显示该毒株为弱毒力毒株。然而,该毒株F蛋白裂解位点的氨基酸序列为112R-R-Q-K-R-F117,符合OIE规定的NDV强毒株的分子生物学判定标准。以Pigeon/Shanghai/215/2011株的全基因组核苷酸序列为参考,设计6对互有重叠并包含整个NDV全基因组的引物,运用RT-PCR、分子克隆、测序和序列拼接等方法,获得NDV/pigeon/China/Shaanxi-06/2018分离株全基因组序列,全长为15192 nt。与32株NDV参考毒株进行基于全基因组水平的遗传进化和同源性分析,结果显示NDV/pigeon/China/Shaanxi-06/2018分离株与上海株Pigeon/Shanghai/215/2011、山东株Pigeon/China/SDLC/2011、云南株Pigeon/Yunnan/1111/2013和安徽株Pigeon/Anhui/2369/2012亲缘关系较近,而与疫苗株、基因Ⅶ型毒株以及ClassⅠ毒株亲缘关系较远。各结构基因的遗传进化关系和同源性数据分析结果同全基因组分析结果相同。NDV/pigeon/China/Shaanxi-06/2018分离株全基因组序列的分析将为鸽源NDV的遗传演化情况提供理论依据,此外,基因Ⅵk亚型新城疫病毒流传范围的扩大提示有必要对鸽子进行密切关注并开展鸽新城疫流行病学调查。
Abstract
xin cheng yi shi you xin cheng yi bing du （Newcastle disease virus,NDV）yin qi bing dao zhi qin lei gao si wang lv de yi chong lie xing chuan ran xing ji bing ,gai bing du ke yin qi bao gua ge zi zai nei de duo chong qin lei huo diao lei fa bing 。ge yuan xin cheng yi bing du you bei chen wei ge fu nian bing du Ⅰxing ,ji ji yin zu wei chan gu fu lian 、mo jie duan RNA,gong bian ma 6ge jie gou dan bai he 2ge fei jie gou dan bai ,jie gou ji yin zai ji yin zu zhong pai lie wei 3’-NP-P-M-F-HN-L-5’,bing du ji yin zu chang du zun xun “liu jian ji yuan ze ”。gen ju dui ji de zhi bing xing ke yi jiang xin cheng yi bing du fen wei jiang du li du zhu 、zhong deng du li du zhu he ruo du li du zhu 3chong ,ge yuan xin cheng yi bing du tong chang dui ge zi de zhi bing xing jiao jiang ,zhu yao yin qi ge zi chu xian dian xing de shen jing zheng zhuang 。gen ju ji yin zu da xiao he wei chuan jin hua fen xi ke yi jiang xin cheng yi bing du fen wei ClassⅠhe ClassⅡliang da lei ,ClassⅠfen zhi bao gua ji yin 19xing ,ClassⅡfen zhi bao gua ji yin ⅠⅩⅧxing ,er ge yuan xin cheng yi bing du tong chang shu yu ClassⅡji yin Ⅵxing 。ben yan jiu cai ji shan xi sheng xi an shi mou sai ge gong peng yi shi gan ran xin cheng yi sai ge de gan zang 、pi zang 、shen zang he nao deng zu zhi bing liao ,shi yong 9ri ling SPFji pei fen li bing du ,bing yun yong HA、HIshi yan yan zheng ,que ding fen li bing du wei xin cheng yi bing du ,bing ming ming wei NDV/pigeon/China/Shaanxi-06/2018。yun yong RT-PCRji shu kuo zeng NDV/pigeon/China/Shaanxi-06/2018fen li zhu Fji yin ,jing ce xu yan zheng hou jin hang wei chuan jin hua fen xi ,jie guo xian shi gai fen li zhu shu yu ClassⅡji yin Ⅵkya xing NDVdu zhu 。Fji yin tong yuan xing fen xi jie guo xian shi NDV/pigeon/China/Shaanxi-06/2018fen li zhu yu shang hai zhu Pigeon/Shanghai/215/2011、Pi/China/SH/2013/163he Pi/China/SH/2013/168he gan suan tong yuan xing zui gao ,yu shan dong zhu Pigeon/China/SD069/2012、bi li shi zhu PPMV-1/Belgium/11-09620/2011an ji suan tong yuan xing zui gao 。ce ding gai fen li zhu zhi bing zhi shu MDT（110 h）he ICPI（0.31）,gen ju OIEgui ding de du li pan ding biao zhun xian shi gai du zhu wei ruo du li du zhu 。ran er ,gai du zhu Fdan bai lie jie wei dian de an ji suan xu lie wei 112R-R-Q-K-R-F117,fu ge OIEgui ding de NDVjiang du zhu de fen zi sheng wu xue pan ding biao zhun 。yi Pigeon/Shanghai/215/2011zhu de quan ji yin zu he gan suan xu lie wei can kao ,she ji 6dui hu you chong die bing bao han zheng ge NDVquan ji yin zu de yin wu ,yun yong RT-PCR、fen zi ke long 、ce xu he xu lie pin jie deng fang fa ,huo de NDV/pigeon/China/Shaanxi-06/2018fen li zhu quan ji yin zu xu lie ,quan chang wei 15192 nt。yu 32zhu NDVcan kao du zhu jin hang ji yu quan ji yin zu shui ping de wei chuan jin hua he tong yuan xing fen xi ,jie guo xian shi NDV/pigeon/China/Shaanxi-06/2018fen li zhu yu shang hai zhu Pigeon/Shanghai/215/2011、shan dong zhu Pigeon/China/SDLC/2011、yun na zhu Pigeon/Yunnan/1111/2013he an hui zhu Pigeon/Anhui/2369/2012qin yuan guan ji jiao jin ,er yu yi miao zhu 、ji yin Ⅶxing du zhu yi ji ClassⅠdu zhu qin yuan guan ji jiao yuan 。ge jie gou ji yin de wei chuan jin hua guan ji he tong yuan xing shu ju fen xi jie guo tong quan ji yin zu fen xi jie guo xiang tong 。NDV/pigeon/China/Shaanxi-06/2018fen li zhu quan ji yin zu xu lie de fen xi jiang wei ge yuan NDVde wei chuan yan hua qing kuang di gong li lun yi ju ,ci wai ,ji yin Ⅵkya xing xin cheng yi bing du liu chuan fan wei de kuo da di shi you bi yao dui ge zi jin hang mi qie guan zhu bing kai zhan ge xin cheng yi liu hang bing xue diao cha 。
论文参考文献
论文详细介绍
论文作者分别是来自西北农林科技大学的姜智文，发表于刊物西北农林科技大学2019-07-11论文，是一篇关于赛鸽论文,新城疫病毒论文,分离鉴定论文,全基因组论文,遗传进化论文,西北农林科技大学2019-07-11论文的文章。本文可供学术参考使用，各位学者可以免费参考阅读下载，文章观点不代表本站观点，资料来自西北农林科技大学2019-07-11论文网站，若本站收录的文献无意侵犯了您的著作版权，请联系我们删除。
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