本文主要研究内容
作者（2019）在《水稻细菌性穗枯病病原鉴定及颖壳伯克氏菌（Burkholderia glumae）基因组甲基化研究》一文中研究指出：水稻细菌性穗枯病是由颖壳伯克氏菌(Burkholderia glumae)和唐菖蒲伯克氏菌(B.gladioli)引起,颖壳伯克氏菌是其主要病原。对细菌性穗枯病病原菌的遗传和表观遗传学特征进行研究,有助于制定其可持续防控方案。因此,我们在国内首次报道了一种伯克氏菌引起的水稻病害,同时对B.glumae的DNA甲基化和基因表达进行了研究。采用生物化学和分子生物学方法,从我国具有典型穗部枯萎病症状的病株中分离得到唐菖蒲伯克氏菌。DNA甲基化由DNA甲基化转移酶催化完成,是原核和真核生物基因组中常见的表观修饰形式,然而甲基化修饰在多数植物病原细菌与寄主互作过程中的功能还有待研究。B.glumae的DNA甲基化作用尚不明确。本项目旨在利用SMRT测序技术研究B.glumae菌株LMG2196的全基因组DNA甲基化模式。我们检测了B.glumae基因组中6mA和4mC两种甲基化形式,结果共检测到11,450预测的6mA残基和12,049预测的4mC残基,明确了6mA残基4mC残基在基因组中的位点;共同和菌株特异的DNA甲基化基序的分析结果表明DNA甲基化呈现高度的分歧;这些研究结果有助于推进细菌甲基化和DNA甲基化在基因调控中作用的研究。此外,大多数病原细菌和植物互作过程中转录组的研究主要集中在病原菌的侵染过程中寄主植物基因的表达分析,反过来研究病原细菌转录组的很少。在人工培养阶段,很多病原菌致病相关基因并不表达,然而在被侵染的寄主中研究病原菌的基因表达是不易的。我们试图探究在人工培养条件下模拟植物—病原细菌互作系统,以激活致病相关基因表达的方法。我们添加水稻根系分泌物(作为寄主信号)和细菌N-acyl homoserine lactone(AHL)信号分子到生长颖壳伯克氏菌的LB培养基,qRT-PCR结果表明这些信号分子可以大幅诱导其致病相关基因的表达。因此,数据表明暴露于人工环境(添加水稻根系分泌物和C8-AHL信号分子的LB培养基)中的颖壳伯克氏菌细胞的行为与自然互作环境中的相似;在该模型系统中颖壳伯克氏菌细胞的基因表达变化在侵染过程中具有可追溯性。
Abstract
shui dao xi jun xing sui ku bing shi you ying ke bai ke shi jun (Burkholderia glumae)he tang chang pu bai ke shi jun (B.gladioli)yin qi ,ying ke bai ke shi jun shi ji zhu yao bing yuan 。dui xi jun xing sui ku bing bing yuan jun de wei chuan he biao guan wei chuan xue te zheng jin hang yan jiu ,you zhu yu zhi ding ji ke chi xu fang kong fang an 。yin ci ,wo men zai guo nei shou ci bao dao le yi chong bai ke shi jun yin qi de shui dao bing hai ,tong shi dui B.glumaede DNAjia ji hua he ji yin biao da jin hang le yan jiu 。cai yong sheng wu hua xue he fen zi sheng wu xue fang fa ,cong wo guo ju you dian xing sui bu ku wei bing zheng zhuang de bing zhu zhong fen li de dao tang chang pu bai ke shi jun 。DNAjia ji hua you DNAjia ji hua zhuai yi mei cui hua wan cheng ,shi yuan he he zhen he sheng wu ji yin zu zhong chang jian de biao guan xiu shi xing shi ,ran er jia ji hua xiu shi zai duo shu zhi wu bing yuan xi jun yu ji zhu hu zuo guo cheng zhong de gong neng hai you dai yan jiu 。B.glumaede DNAjia ji hua zuo yong shang bu ming que 。ben xiang mu zhi zai li yong SMRTce xu ji shu yan jiu B.glumaejun zhu LMG2196de quan ji yin zu DNAjia ji hua mo shi 。wo men jian ce le B.glumaeji yin zu zhong 6mAhe 4mCliang chong jia ji hua xing shi ,jie guo gong jian ce dao 11,450yu ce de 6mAcan ji he 12,049yu ce de 4mCcan ji ,ming que le 6mAcan ji 4mCcan ji zai ji yin zu zhong de wei dian ;gong tong he jun zhu te yi de DNAjia ji hua ji xu de fen xi jie guo biao ming DNAjia ji hua cheng xian gao du de fen qi ;zhe xie yan jiu jie guo you zhu yu tui jin xi jun jia ji hua he DNAjia ji hua zai ji yin diao kong zhong zuo yong de yan jiu 。ci wai ,da duo shu bing yuan xi jun he zhi wu hu zuo guo cheng zhong zhuai lu zu de yan jiu zhu yao ji zhong zai bing yuan jun de qin ran guo cheng zhong ji zhu zhi wu ji yin de biao da fen xi ,fan guo lai yan jiu bing yuan xi jun zhuai lu zu de hen shao 。zai ren gong pei yang jie duan ,hen duo bing yuan jun zhi bing xiang guan ji yin bing bu biao da ,ran er zai bei qin ran de ji zhu zhong yan jiu bing yuan jun de ji yin biao da shi bu yi de 。wo men shi tu tan jiu zai ren gong pei yang tiao jian xia mo ni zhi wu —bing yuan xi jun hu zuo ji tong ,yi ji huo zhi bing xiang guan ji yin biao da de fang fa 。wo men tian jia shui dao gen ji fen bi wu (zuo wei ji zhu xin hao )he xi jun N-acyl homoserine lactone(AHL)xin hao fen zi dao sheng chang ying ke bai ke shi jun de LBpei yang ji ,qRT-PCRjie guo biao ming zhe xie xin hao fen zi ke yi da fu you dao ji zhi bing xiang guan ji yin de biao da 。yin ci ,shu ju biao ming bao lou yu ren gong huan jing (tian jia shui dao gen ji fen bi wu he C8-AHLxin hao fen zi de LBpei yang ji )zhong de ying ke bai ke shi jun xi bao de hang wei yu zi ran hu zuo huan jing zhong de xiang shi ;zai gai mo xing ji tong zhong ying ke bai ke shi jun xi bao de ji yin biao da bian hua zai qin ran guo cheng zhong ju you ke zhui su xing 。
论文参考文献
论文详细介绍
论文作者分别是来自中国农业科学院的，发表于刊物中国农业科学院2019-07-05论文，是一篇关于水稻穗枯病论文,颖壳伯克氏菌论文,甲基化论文,测序论文,基因表达论文,中国农业科学院2019-07-05论文的文章。本文可供学术参考使用，各位学者可以免费参考阅读下载，文章观点不代表本站观点，资料来自中国农业科学院2019-07-05论文网站，若本站收录的文献无意侵犯了您的著作版权，请联系我们删除。
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