文献组学论文-韦卓,伍新诚,郑景辉

文献组学论文-韦卓,伍新诚,郑景辉

导读:本文包含了文献组学论文开题报告文献综述及选题提纲参考文献,主要关键词:高血压,肝阳上亢证,代谢组学,生物信息学

文献组学论文文献综述

韦卓,伍新诚,郑景辉[1](2019)在《基于文献计量学的高血压肝阳上亢证病人血浆代谢组学研究》一文中研究指出目的基于文献计量学探讨高血压肝阳上亢证代谢产物谱及其相互作用。方法检索中文数据库中国知网、重庆维普和万方,检索英文数据库EMbase、PubMed,筛选有关高血压肝阳上亢证病人血浆代谢组学研究。收集纳入研究重复出现的代谢产物作为高血压肝阳上亢证代谢产物谱。在网络数据库上对代谢产物进行分析处理。结果筛选后,共9篇文献纳入研究,其中9个重复出现的代谢产物认为是高血压肝阳上亢证代谢产物谱,它们出现在29条代谢通路上。在网络数据库上对代谢产物谱进行通路拓扑分析,其中5条代谢通路P≤0.05,认为是高血压肝阳上亢证的代谢通路,分别是:氨酰tRNA生物合成(Aminoacyl-tRNA biosynthesis),氮代谢(Nitrogen metabolism),硫胺素代谢(Thiamine metabolism),苯丙氨酸、酪氨酸和色氨酸生物合成(Phenylalanine,tyrosine and tryptophan biosynthesis),苯丙氨酸代谢(Phenylalanine metabolism)。结论高血压肝阳上亢证的病理机制涉及氨基酸、蛋白质、维生素及血管活性物质的生物代谢,在此过程中产生大量活性氧,进一步产生炎症反应,损伤血管内皮。(本文来源于《中西医结合心脑血管病杂志》期刊2019年12期)

李晓曼,张扬,徐倩,谢能付[2](2019)在《基于文献计量的植物表型组学研究进展分析》一文中研究指出[目的]为了掌握植物表型组学研究的发展脉络和现状,本文基于文献计量学方法探讨了植物表型组学的研究现状。[方法]本研究基于Web of Science核心合集数据库分析了1995-2018年的学术论文,利用多个指标从学术产出(年度变化趋势分析、国家和地区分析、期刊分析和学科领域分析)和学术合作(国家合作情况分析和机构合作情况分析)两个方面对植物表型组学文献进行了统计分析。同时,本文使用Web of Science数据库文献分析平台和EXCEL、DDA等软件,利用共词分析方法构建文献关键词共现矩阵,进一步对矩阵进行聚类分析,并利用VOSviewer文献计量工具进行可视化。此外,本文构建了1995-2002年、2003-2010年、2011-2018年叁个时间片的关键词共现矩阵,分析了不同时间片主题的变化情况。[结果]本文基于Web of Science共检索到与植物表型组学研究和应用相关的文献6800篇,发现植物表型组学文献数量整体呈上升趋势,现阶段正处于高速增长阶段。从学术产出归属国家和地区分布来看,美国发文量最多,中国排名第四。从国际合作来看,澳大利亚、法国和西班牙国际合作论文占比较高,美国的占比靠后。虽然植物表型组组学研究已经呈现多学科合作发展趋势,但植物科学还是主体领域。从研究主题上看,主要包括遥感技术在表型组学中的应用、植物表型组学基础研究、利用光学成像的图像分析、机器学习和计算机视觉技术、利用不同植物种类如小麦和水稻的相关研究。(本文来源于《农业大数据学报》期刊2019年02期)

张永怡,孙志岭,谢彤,焦文娟,何静[3](2018)在《基于代谢组学针灸研究领域的文献计量学分析》一文中研究指出目的系统分析基于代谢组学针灸研究领域文献的基本信息、研究内容与研究方向。方法基于文献计量学的方法,检索各数据库建库以来至2017年8月针灸领域应用代谢组学技术的文献,中文数据库:中国知网、维普中文期刊数据库、万方全文数据库、中国生物医学文献数据库;外文数据库:Cochrane library、MEDLINE。使用文献计量学方法对检索出的文献进行归纳与总结。结果纳入文献67篇,其中英文文献11篇,中文文献56篇。文献包括综述类11篇(16.42%)、临床试验32篇(47.76%)、动物实验22篇(32.84%)与实验计划2篇(2.99%)。涉及疾病19种,以消化系统疾病为研究热点共25篇(包含功能性消化不良、肠易激综合征、溃疡性结肠炎等)。代谢组学检测技术主要是核磁共振技术35篇,检测样本主要为血浆28篇。结论代谢组学在中医药领域的应用十分广泛,但使用代谢组学技术分析针灸问题的研究相对较少,且起步较晚。先进的代谢组学技术与传统中医针灸疗法相结合,才能够更加科学的解释针灸的作用机制,促进针灸的科学发展。(本文来源于《中国中西医结合杂志》期刊2018年12期)

卓小媛,郑景辉,伍新诚,马晓聪,张新春[4](2018)在《基于文献计量学的大鼠心肌梗死模型尿液代谢组学研究》一文中研究指出目的探讨大鼠心肌梗死模型尿液代谢组生物信息学通路。方法从中国知网、万方数据库、维普数据库、Embase、PubMed数据库中检索大鼠心肌梗死的实验研究,对纳入研究代谢产物进行汇总。信号通路分析采用KEGG,代谢产物分子注释、相关的酶或转运蛋白及其相关性质分析采用HMDB,代谢产物路径可视化采用metPA网络软件。结果通过通路拓扑分析选出了3条代谢通路作为大鼠心肌梗死代谢通路,分别是:柠檬酸循环(TCA循环);丙氨酸、天门冬氨酸和谷氨酸代谢;精氨酸和脯氨酸代谢。结论大鼠心肌梗死代谢组生物信息分析显示心肌梗死发病机制涉及糖类、脂肪、蛋白质等物质代谢及其代谢通路。(本文来源于《中西医结合心脑血管病杂志》期刊2018年17期)

韦卓,伍新诚,郑景辉[5](2018)在《基于文献计量学的高血压阴虚阳亢证患者血浆代谢组学研究》一文中研究指出目的:探讨高血压阴虚阳亢证代谢产物谱及其相互作用。方法:从中国知网、万方数据库、维普数据库、Embase、Pub Med数据库中分别检索高血压阴虚阳亢证患者血浆代谢组学研究,对其纳入研究代谢产物进行汇总。信号通路分析采用KEGG,代谢产物分子注释、相关酶或转运蛋白及其相关性质分析采用HMDB,代谢产物路径可视化采用Met PA网络软件。结果:共有5篇文献纳入研究,16个代谢产物,主要参与了34条代谢通路。通过通路拓扑分析选出了10条P<0.05的代谢通路作为高血压阴虚阳亢证的代谢通路,分别是:氨酰t RNA生物合成,缬氨酸、亮氨酸和异亮氨酸生物合成,甘氨酸、丝氨酸和苏氨酸代谢,脂肪酸生物合成,丙氨酸、天门冬氨酸和谷氨酸代谢,精氨酸和脯氨酸代谢,泛酸和辅酶A生物合成,丙酸代谢,缬氨酸、亮氨酸和异亮氨酸降解,乙醛酸和二羧酸盐代谢。结论:高血压阴虚阳亢证的病理机制涉及糖类、脂肪、蛋白质、维生素及血管活性物质的生物代谢,参与活性氧簇介导的血管内皮损伤,及血管炎症反应。本研究从分子水平阐述肝阳上亢证的发病机制,为其诊断及与其他证型之间的鉴别诊断提供基础,也为发现药物作用靶点提供依据,进一步指导两证中医立法选方。(本文来源于《中医临床研究》期刊2018年22期)

李靖宇[6](2018)在《组学研究的脉络梳理与趋势展望—文献挖掘视角》一文中研究指出目的:随着现代医学的快速发展,人们发现单纯研究某一方向无法解释全部生物医学问题,组学被呈现在公众视野面前。由于疾病种类多,要做到精准医学提倡的精确用药,离不开组学大数据的支持。目前整合多组学的研究工作还很缺乏,尤其是基于不同类型组学数据关联分析的研究。因此准确的把握组学研究的脉络和趋势,有助于科研工作者及时抓住研究热点,调整自己的研究方向。方法:选取PubMed数据库对其1896-2016年收录的所有文献题录信息共计27040819条记录进行下载,利用Python编程语言对具有“组学”含义的单词在每篇文献的题目和摘要中进行标注、统计并分析统计结果。结果:共得到346977条数据,通过年度趋势变化图得到组学文献发表量逐年递增,从2000年后呈井喷式增长;各类单一组学的文献发表量都呈逐年递增的趋势,其中基因组学文献发表量最多,在2014年之前,蛋白质组学文献发表量排第二,2014年之后,转录组学超过了蛋白质组学的文献发表量,成为了继基因组学之后的第二大组学类型;通过主题河图展现了转录组学和线粒体基因组学与基因组学共现的文献量在某一时间节点后呈井喷式增长,其余组学类型与基因组学共现的文献量都呈稳定增长的趋势;通过上下文分析发现与组学类型相关的关键词以其研究技术为主。结论:不同类型组学相继涌现,成为研究热点;由单一组学类型研究向多类型组学融合研究发展;组学研究离不开其研究技术的支持。(本文来源于《山西医科大学》期刊2018-06-05)

何静,孙志岭,谢彤,焦文娟,张永怡[7](2018)在《基于文献计量学分析代谢组学在中医证型研究领域的应用》一文中研究指出背景:代谢组学是以组群指标分析为基础,以高通量检测和数据处理为手段,以信息建模和系统整合为目标的系统生物学分支,其方法适用于识别代谢指标,可以为个体化诊疗、诊断提供依据,更好指导临床辨证论治。目的:分析建库至今以来代谢组学在中医证型研究领域应用的文献特征和研究现状,为该组学技术在中医证型研究领域的应用提供借鉴。方法:以中国知网、万方数据库、中国生物医学文献数据库、Pub Med、Web of science、Medline数据库为资料来源,检索建库至2017年6月收录的中医证型研究领域应用代谢组学的文献,建立文献数据库,采用文献计量学及数据挖掘的方法,对其文献特征及研究特征进行统计分析。结果与结论:(1)纳入499篇,期刊文献371篇(74.35%),会议论文30篇(6.01%),学位论文98篇(19.64%)。371篇关于代谢组学在中医证型研究领域应用的期刊文献共分布在124种期刊上,其中中文核心期刊32种,占总文献量的45.28%;SCI收录期刊10种,占总文献量的3.77%;(2)根据文献内容统计分类得到7类病症系统(以消化系统和循环系统为主),涉及23种疾病,39种干预措施;(3)中医证型研究领域应用代谢组学技术辨证分型的统一化、标准化仍有待提高,同时文献的质量也相对欠缺。应加强提高动物实验类研究的质量,探讨疾病证型本质及干预措施机制,以期控制疾病的发生发展。(本文来源于《中国组织工程研究》期刊2018年16期)

范芳芳,赵可惠,王天虹,孟宪丽,张艺[8](2018)在《蛋白质组学在我国传统医药研究领域应用的文献计量学分析》一文中研究指出目的:了解国内蛋白质组学在传统中医药研究领域的研究现状,分析蛋白质组学在传统中医药研究中的发展趋势和研究热点。方法:基于中国知网(CNKI)、维普数据库和万方医药卫生数据库,收集2007年1月1日—2016年12月31日与主题相关研究型文献,运用Note Express v3.2.0.6915和Excel 2013等软件以及各数据库自带分析功能从发表时间、期刊分布、研究机构、研究人员、文献被引量、基金资助情况和高频关键词等方面进行统计分析。结果:共检索到1350篇有效文献。蛋白质组学近10年在传统中医药研究领域的年均发文量135篇,基本形成核心作者群体,发文量前3位的研究机构为浙江中医药大学、北京中医药大学、中南大学湘雅医院。对22个高频关键词分析发现,蛋白质组学技术在中医证型证候上研究较多,在中药及中药复方研究中以药效作用机制研究为主,通常以双向电泳-质谱联合为蛋白质组学常用技术分析方法,在治疗疾病方面,以心脑血管疾病上应用最多。结论:在国家大力支持下,蛋白质组学技术已成为中国传统医药研究领域热门技术,并逐步走向成熟,极大地促进了中国传统医药现代化和世界化发展,但在少数民族医药领域的研究仍处于起步阶段,应加强该技术在民族医药领域的研究,以促进中国传统医药的全面协调发展。(本文来源于《中华中医药学刊》期刊2018年04期)

李靖宇,程景民,贺培凤,田玥,于琦[9](2018)在《基于文献挖掘视角的组学研究脉络梳理》一文中研究指出目的:梳理组学研究脉络,分析组学研究热点趋势,帮助科研工作者把握研究方向,为科研管理部门在组学研究方面的资助提供决策支持。方法:利用E-utilities下载1986-2016年Pub Med数据库收录的含有"-Omics/Omic/Omes/Ome"的题录信息27 040 819条,在题录信息的题目和摘要中对以"-Omics/Omic/Omes/Ome"结尾的词进行标注、筛选,并利用词频分析法、共现分析法、社会网络分析法对筛选结果进行分析。结果:获得组学相关记录共346 977条,文献发表量逐年递增,自2000年后呈井喷式增长。各类单一组学的文献发表量均呈逐年递增的趋势,其中基因组学文献发表量最多。2014年之后,转录组学的文献发表量赶超了蛋白质组学,成为继基因组学之后的第二大组学类型。转录组学、线粒体基因组学与基因组学共现的文献量在某一时间节点后呈井喷式增长,其余组学类型与基因组学共现的文献量都稳定增长。结论:后基因组时代把组学研究推向了高潮,无论是数量还是种类都出现了井喷式的增长。多类型组学的融合研究越来越受科研人员的关注。(本文来源于《中华医学图书情报杂志》期刊2018年03期)

张永怡,孙志岭,彭琳秀,薛莲,焦文娟[10](2018)在《代谢组学在关节炎领域的研究现状及文献计量学分析》一文中研究指出背景:研究表明,关节炎的诊断与治疗机制研究可以从代谢组学的角度,进行代谢产物分析。代谢组学结合文献分析,可全面地了解其在骨关节炎领域的研究现状。目的:基于文献计量学对代谢组学在关节炎的研究现状进行分析与总结,并对未来发展趋势进行展望。方法:计算机检索中国知网、维普网、万方、中国生物医学数据库、Pub Med、EBSCO、Web of Science、Elsevier数据库中有关代谢组学在关节炎领域研究的文献,检索时间为建库到2017年5月。中文检索词:"(代谢组学"OR"代谢组")AND"关节炎";英文检索词:"Metabolomics"AND"Arthritis"。初步检索得到文献201篇,按照纳入和排除标准,最终纳入59篇进行文献进行基本信息与研究内容的分析。结果与结论:(1)从2007年开始出现相关文献,文献数量逐年增加;(2)第一作者研究单位是高校、医院、研究院,发文量分别是37篇(63%)、15篇(25%)和7篇(12%);(3)收录期刊文献44篇(75%)、学位论文11篇(19%)、会议论文4篇(7%),44篇期刊文献收录在38种期刊杂志;(4)基金支持:36篇文献获得基金资助(61%)。国家自然科学基金资助的文献最多,共29篇(49%),厅局级基金18篇(31%),省部级基金10篇(17%),国外基金5篇(8%),校级项目5篇(8%);(5)关节炎类型:类风湿关节炎40篇(68%)、骨关节炎7篇(12%)、痛风性关节炎6篇(10%),其他类型6篇(10%);(6)文献研究方向:关节炎治疗机制研究30篇(51%),发病机制研究17篇(29%),关节炎中医症候研究6篇(10%),综述6篇(10%);(7)代谢组学检测样本:体液样本53篇(90%),组织样本6篇(10%);(8)代谢组学分析技术:液相色谱-质谱联用技术33篇(56%)、核磁共振15篇(25%)、气相色谱-质谱联用技术10篇(17%)、联合液相与气相色谱-质谱技术1篇(2%);(9)由此提示,代谢组学已经普遍应用到关节炎领域中,并成为研究热点。另外,基于代谢组学了解中医药治疗关节炎副作用代谢途径,可为中医药的前瞻性研究与临床合理使用中医药治疗关节炎提供科学参考。(本文来源于《中国组织工程研究》期刊2018年04期)

文献组学论文开题报告

(1)论文研究背景及目的

此处内容要求:

首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景,再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题,并提出你的论文准备的观点或解决方法。

写法范例:

[目的]为了掌握植物表型组学研究的发展脉络和现状,本文基于文献计量学方法探讨了植物表型组学的研究现状。[方法]本研究基于Web of Science核心合集数据库分析了1995-2018年的学术论文,利用多个指标从学术产出(年度变化趋势分析、国家和地区分析、期刊分析和学科领域分析)和学术合作(国家合作情况分析和机构合作情况分析)两个方面对植物表型组学文献进行了统计分析。同时,本文使用Web of Science数据库文献分析平台和EXCEL、DDA等软件,利用共词分析方法构建文献关键词共现矩阵,进一步对矩阵进行聚类分析,并利用VOSviewer文献计量工具进行可视化。此外,本文构建了1995-2002年、2003-2010年、2011-2018年叁个时间片的关键词共现矩阵,分析了不同时间片主题的变化情况。[结果]本文基于Web of Science共检索到与植物表型组学研究和应用相关的文献6800篇,发现植物表型组学文献数量整体呈上升趋势,现阶段正处于高速增长阶段。从学术产出归属国家和地区分布来看,美国发文量最多,中国排名第四。从国际合作来看,澳大利亚、法国和西班牙国际合作论文占比较高,美国的占比靠后。虽然植物表型组组学研究已经呈现多学科合作发展趋势,但植物科学还是主体领域。从研究主题上看,主要包括遥感技术在表型组学中的应用、植物表型组学基础研究、利用光学成像的图像分析、机器学习和计算机视觉技术、利用不同植物种类如小麦和水稻的相关研究。

(2)本文研究方法

调查法:该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。

观察法:用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。

实验法:通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。

文献研究法:通过调查文献来获得资料,从而全面的、正确的了解掌握研究方法。

实证研究法:依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。

定性分析法:对研究对象进行“质”的方面的研究,这个方法需要计算的数据较少。

定量分析法:通过具体的数字,使人们对研究对象的认识进一步精确化。

跨学科研究法:运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。

功能分析法:这是社会科学用来分析社会现象的一种方法,从某一功能出发研究多个方面的影响。

模拟法:通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。

文献组学论文参考文献

[1].韦卓,伍新诚,郑景辉.基于文献计量学的高血压肝阳上亢证病人血浆代谢组学研究[J].中西医结合心脑血管病杂志.2019

[2].李晓曼,张扬,徐倩,谢能付.基于文献计量的植物表型组学研究进展分析[J].农业大数据学报.2019

[3].张永怡,孙志岭,谢彤,焦文娟,何静.基于代谢组学针灸研究领域的文献计量学分析[J].中国中西医结合杂志.2018

[4].卓小媛,郑景辉,伍新诚,马晓聪,张新春.基于文献计量学的大鼠心肌梗死模型尿液代谢组学研究[J].中西医结合心脑血管病杂志.2018

[5].韦卓,伍新诚,郑景辉.基于文献计量学的高血压阴虚阳亢证患者血浆代谢组学研究[J].中医临床研究.2018

[6].李靖宇.组学研究的脉络梳理与趋势展望—文献挖掘视角[D].山西医科大学.2018

[7].何静,孙志岭,谢彤,焦文娟,张永怡.基于文献计量学分析代谢组学在中医证型研究领域的应用[J].中国组织工程研究.2018

[8].范芳芳,赵可惠,王天虹,孟宪丽,张艺.蛋白质组学在我国传统医药研究领域应用的文献计量学分析[J].中华中医药学刊.2018

[9].李靖宇,程景民,贺培凤,田玥,于琦.基于文献挖掘视角的组学研究脉络梳理[J].中华医学图书情报杂志.2018

[10].张永怡,孙志岭,彭琳秀,薛莲,焦文娟.代谢组学在关节炎领域的研究现状及文献计量学分析[J].中国组织工程研究.2018

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