郑斌:芒果果实bHLH家族转录因子的生物信息学分析论文

郑斌:芒果果实bHLH家族转录因子的生物信息学分析论文

本文主要研究内容

作者郑斌,文定青,武红霞,邹明宏,刘恒,王松标,赵巧丽(2019)在《芒果果实bHLH家族转录因子的生物信息学分析》一文中研究指出:bHLH家族作为植物中较大的转录因子家族之一,在真核生物生长发育调控中具有重要作用。本研究基于芒果果实转录组数据,利用生物信息学方法鉴定出87个bHLH家族蛋白,其中酸性蛋白所占比例较大,大部分为不稳定蛋白,且均为不含信号肽的亲水性蛋白,除CL10714.Contig1为膜结合转录因子外,其余均不含跨膜结构。芒果bHLH蛋白结构域有多个氨基酸位点保守性较高,87个芒果bHLH蛋白中73个(83.91%)具有E-box结合功能。GO分析发现芒果bHLH蛋白共注释到生物学过程、细胞组分和分子功能3大类功能的17个亚类。进化树分析发现芒果bHLH蛋白与拟南芥有较高的保守性,并基于进化树对部分bHLH蛋白的功能进行了预测。本研究结果将为下一步芒果bHLH蛋白的功能研究奠定基础。

Abstract

bHLHjia zu zuo wei zhi wu zhong jiao da de zhuai lu yin zi jia zu zhi yi ,zai zhen he sheng wu sheng chang fa yo diao kong zhong ju you chong yao zuo yong 。ben yan jiu ji yu mang guo guo shi zhuai lu zu shu ju ,li yong sheng wu xin xi xue fang fa jian ding chu 87ge bHLHjia zu dan bai ,ji zhong suan xing dan bai suo zhan bi li jiao da ,da bu fen wei bu wen ding dan bai ,ju jun wei bu han xin hao tai de qin shui xing dan bai ,chu CL10714.Contig1wei mo jie ge zhuai lu yin zi wai ,ji yu jun bu han kua mo jie gou 。mang guo bHLHdan bai jie gou yu you duo ge an ji suan wei dian bao shou xing jiao gao ,87ge mang guo bHLHdan bai zhong 73ge (83.91%)ju you E-boxjie ge gong neng 。GOfen xi fa xian mang guo bHLHdan bai gong zhu shi dao sheng wu xue guo cheng 、xi bao zu fen he fen zi gong neng 3da lei gong neng de 17ge ya lei 。jin hua shu fen xi fa xian mang guo bHLHdan bai yu ni na gai you jiao gao de bao shou xing ,bing ji yu jin hua shu dui bu fen bHLHdan bai de gong neng jin hang le yu ce 。ben yan jiu jie guo jiang wei xia yi bu mang guo bHLHdan bai de gong neng yan jiu dian ding ji chu 。

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  • 论文详细介绍

    论文作者分别是来自热带作物学报的郑斌,文定青,武红霞,邹明宏,刘恒,王松标,赵巧丽,发表于刊物热带作物学报2019年02期论文,是一篇关于芒果论文,家族论文,转录因子论文,生物信息学论文,热带作物学报2019年02期论文的文章。本文可供学术参考使用,各位学者可以免费参考阅读下载,文章观点不代表本站观点,资料来自热带作物学报2019年02期论文网站,若本站收录的文献无意侵犯了您的著作版权,请联系我们删除。

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