王越:美国白蛾HcSID-1基因的克隆、表达模式分析及其在幼虫中的功能验证论文

王越:美国白蛾HcSID-1基因的克隆、表达模式分析及其在幼虫中的功能验证论文

本文主要研究内容

作者王越,张苏芳,徐瑶,刘福,孔祥波,张真(2019)在《美国白蛾HcSID-1基因的克隆、表达模式分析及其在幼虫中的功能验证》一文中研究指出:【目的】克隆美国白蛾系统性RNA干扰缺失基因序列,对该基因进行序列特征分析和时空表达模式检测,并研究其在美国白蛾幼虫系统性RNA干扰中的功能。【方法】通过RT-PCR和RACE技术从美国白蛾幼虫中进行基因克隆,并进行生物信息学分析;利用qPCR技术检测该基因在美国白蛾不同发育阶段和幼虫不同组织中的相对表达量;利用RNAi和qPCR技术验证外源dsRNA对该基因的干扰效率,以及干扰该基因表达后对其他靶标基因干扰效率的影响。【结果】从美国白蛾幼虫中克隆得到一个美国白蛾系统性RNA干扰缺失基因并命名为HcSID-1(Gen Bank登陆号:MG696730)。该基因全长2 761 bp,开放阅读框(ORF) 2 613 bp,编码870个氨基酸,预测蛋白分子量为97. 08 kD,理论等电点(pI) 6. 81,有1个19 aa的信号肽。氨基酸序列分析表明,Hc SID-1蛋白有1个长N末端(308 aa),序列中后段309—855位氨基酸之间具有典型的11个跨膜结构域;系统进化分析表明HcSID-1与鳞翅目昆虫同源性较高,和家蚕的Bm SID-3亲缘关系最近;时空表达分析表明,HcSID-1在美国白蛾各发育阶段和幼虫各组织中均有表达,在幼虫中肠组织表达量最高。注射HcSID-1 dsRNA可显著降低该基因在转录水平的相对表达量,且该基因的下调能降低HcChi dsRNA在美国白蛾幼虫中的RNA干扰效率。【结论】获得具有典型家族特征的美国白蛾SID-1基因序列,该基因的下调能够影响其他靶标基因dsRNA的RNAi效率,表明该基因可能具有与其他SID基因在系统性RNAi过程中相同的功能。

Abstract

【mu de 】ke long mei guo bai e ji tong xing RNAgan rao que shi ji yin xu lie ,dui gai ji yin jin hang xu lie te zheng fen xi he shi kong biao da mo shi jian ce ,bing yan jiu ji zai mei guo bai e you chong ji tong xing RNAgan rao zhong de gong neng 。【fang fa 】tong guo RT-PCRhe RACEji shu cong mei guo bai e you chong zhong jin hang ji yin ke long ,bing jin hang sheng wu xin xi xue fen xi ;li yong qPCRji shu jian ce gai ji yin zai mei guo bai e bu tong fa yo jie duan he you chong bu tong zu zhi zhong de xiang dui biao da liang ;li yong RNAihe qPCRji shu yan zheng wai yuan dsRNAdui gai ji yin de gan rao xiao lv ,yi ji gan rao gai ji yin biao da hou dui ji ta ba biao ji yin gan rao xiao lv de ying xiang 。【jie guo 】cong mei guo bai e you chong zhong ke long de dao yi ge mei guo bai e ji tong xing RNAgan rao que shi ji yin bing ming ming wei HcSID-1(Gen Bankdeng liu hao :MG696730)。gai ji yin quan chang 2 761 bp,kai fang yue dou kuang (ORF) 2 613 bp,bian ma 870ge an ji suan ,yu ce dan bai fen zi liang wei 97. 08 kD,li lun deng dian dian (pI) 6. 81,you 1ge 19 aade xin hao tai 。an ji suan xu lie fen xi biao ming ,Hc SID-1dan bai you 1ge chang Nmo duan (308 aa),xu lie zhong hou duan 309—855wei an ji suan zhi jian ju you dian xing de 11ge kua mo jie gou yu ;ji tong jin hua fen xi biao ming HcSID-1yu lin chi mu kun chong tong yuan xing jiao gao ,he jia can de Bm SID-3qin yuan guan ji zui jin ;shi kong biao da fen xi biao ming ,HcSID-1zai mei guo bai e ge fa yo jie duan he you chong ge zu zhi zhong jun you biao da ,zai you chong zhong chang zu zhi biao da liang zui gao 。zhu she HcSID-1 dsRNAke xian zhe jiang di gai ji yin zai zhuai lu shui ping de xiang dui biao da liang ,ju gai ji yin de xia diao neng jiang di HcChi dsRNAzai mei guo bai e you chong zhong de RNAgan rao xiao lv 。【jie lun 】huo de ju you dian xing jia zu te zheng de mei guo bai e SID-1ji yin xu lie ,gai ji yin de xia diao neng gou ying xiang ji ta ba biao ji yin dsRNAde RNAixiao lv ,biao ming gai ji yin ke neng ju you yu ji ta SIDji yin zai ji tong xing RNAiguo cheng zhong xiang tong de gong neng 。

论文参考文献

论文详细介绍

论文作者分别是来自林业科学的王越,张苏芳,徐瑶,刘福,孔祥波,张真,发表于刊物林业科学2019年10期论文,是一篇关于美国白蛾论文,系统性干扰缺失基因论文,克隆表达论文,干扰论文,林业科学2019年10期论文的文章。本文可供学术参考使用,各位学者可以免费参考阅读下载,文章观点不代表本站观点,资料来自林业科学2019年10期论文网站,若本站收录的文献无意侵犯了您的著作版权,请联系我们删除。

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