导读:本文包含了基因型同源性论文开题报告文献综述及选题提纲参考文献，主要关键词:间日疟原虫,MSP-1基因,CSP基因,基因分型
基因型同源性论文文献综述
徐超,魏庆宽,孔祥礼,李瑾,王用斌[1]（2017）在《山东省间日疟原虫MSP-1和CSP等位基因型及同源性分析》一文中研究指出目的分析山东省间日疟原虫MSP-1和CSP基因类型及其同源性,为病例溯源提供科学依据。方法采集2011年山东省报告的12例间日疟患者血样,提取疟原虫基因组DNA;分别根据间日疟原虫MSP-1和CSP基因序列设计引物,进行巢式PCR扩增、酶切、测序、序列比对及同源性分析。结果 12份间日疟患者血样MSP-1基因全部出现470bp扩增条带以及350、120 bp酶切片段,均为Sal-1型;MSP-1进化树分析显示,9份省内感染者样品序列同属一个分枝,1份印度感染者样品序列与印度分离株位于同一分枝。12份间日疟患者样品CSP基因均包含GDRA(D/A)GQPA序列,为PV-Ⅰ型,其中10份省内感染者和1份广东感染者样品CSP基因出现560~840 bp和150~230 bp两种扩增条带,为PV-Ⅰ型温带族,1份在印度感染者样品CSP基因仅出现560~840 bp条带,为PV-Ⅰ型热带族。CSP进化树表明,10份省内感染者及1份广东感染者样品序列同属一个分枝,1份在印度感染者样品序列与印度和印度尼西亚分离株位于同一分枝。结论山东省本地感染间日疟原虫MSP-1基因型均为Sal-1型,CSP基因型均为PV-Ⅰ型温带族,本地虫株具有较强的基因同源性。(本文来源于《中国血吸虫病防治杂志》期刊2017年01期）
张晶波,王敬辉,崔京辉,于霞丽,陈萌[2]（2016）在《2014年北京市西城区40例麻疹患者分离的麻疹病毒基因型及同源性》一文中研究指出目的了解北京市某城区2014年分离的麻疹病毒基因型,及时发现输入性麻疹病例。方法采用荧光聚合酶链反应(PCR)方法,对北京市西城区2014年采集的标本进行病毒核酸鉴定、RT-PCR扩增,扩增产物进行测序及序列比对分析。结果 2014年北京市西城区共采集81例麻疹疑似患者的82份标本,其中咽拭子63份,尿19份。麻疹病毒核酸检测阳性70例,RT-PCR扩增、测序获得基因序列40份,麻疹病毒培养阳性毒株37例。种系进化树分析显示,获得的40份麻疹病毒基因序列与H基因簇代表株Chin9322/H1a,以及世界卫生组织推荐的代表株MVi/Hunan.CHN/0.93/7/H1在同一分支上,核苷酸水平上同源性分别为98%~98.9%、96.9%~97.8%;氨基酸水平上同源性分别为97.3%~99.3%、95.3%~98%。结论 2014年北京市西城区麻疹病例以本土基因型(H1)病例为主,进一步加强麻疹病例病原学监测对麻疹输入性病例的控制和预防具有重要意义。(本文来源于《中国感染控制杂志》期刊2016年10期）
郭大敏,黄汉,廖康,郭鹏豪,陈怡丽[3]（2016）在《耐万古霉素肠球菌的基因型和同源性分析》一文中研究指出目的了解中山大学附属第一医院临床分离的耐万古霉素肠球菌(VRE)的基因型和同源性,为本地区VRE的感染治疗和预防控制提依据。方法收集临床分离的VRE,E-Test法确定万古霉素、替考拉宁和利奈唑胺的最低抑菌浓度(MIC),多重PCR法检测万古霉素耐药基因,脉冲场凝胶电泳(PFGE)检测菌株的同源性。结果共收集到8株VRE菌株,均为屎肠球菌,分离自腹腔引流液。8株VRE均对万古霉素高度耐药(MIC≥256mg/L),对替考拉宁中介或耐药,对利奈唑胺、替加环素和四环素敏感,耐药基因型均为VanA;PFGE分型分为A、B两个克隆,其中7株为A克隆,1株为B克隆。结论中山大学附属第一医院VRE菌株均携带VanA基因,且多重耐药,在院内有小范围的流行,但非单一克隆流行。(本文来源于《检验医学与临床》期刊2016年05期）
闻海丰,冯忠军,秦瑾,于文静[4]（2016）在《采用ERIC-PCR与PFGE分析鲍曼不动杆菌基因型和同源性并对比方法学差异》一文中研究指出目的比较脉冲场凝胶电泳(pulsed field gel electrophoresis,PFGE)与肠杆菌科基因间重复序列聚合酶链式反应(enterobacterial repetitive intergenic consensus-polymerase chain reaction,ERICPCR)检测鲍曼不动杆菌同源性的结果差异。方法分别采用PFGE和ERIC-PCR对我院院内分离的43株鲍曼不动杆菌进行分型检测。结果 43株鲍曼不动杆菌通过PFGE分型得出:A型22株、B型10株、C型3株、D型4株、E型2株、F型1株、G型1株;通过ERIC-PCR得出7种型别:Ⅰ型22株、Ⅱ型10株、Ⅲ型3株、Ⅳ型2株、V型3株、Ⅵ型1株、Ⅶ型2株。2种方法结果相符率为76.8%。我院鲍曼不动杆菌存在克隆株传播。结论 ERIC-PCR操作简便、结果可靠,与PFGE结果一致性高,2种分型方法均适合作为医院进行病原菌流行病学调查的分型检测手段。(本文来源于《分子诊断与治疗杂志》期刊2016年01期）
齐艳,钱香,杨玮,蒋琰,楼正青[5]（2015）在《耐碳青霉烯类大肠埃希菌耐药基因型检测与同源性分析》一文中研究指出目的探讨医院感染耐碳青霉烯类大肠埃希菌的耐药传播机制及克隆流行,为临床治疗提供参考依据。方法收集2011年1月-2012年6月医院临床分离的19株耐碳青霉烯类大肠埃希菌,采用PCR及序列比对等方法检测耐药基因的分布;脉冲场凝胶电泳和多位点序列分型进行菌株同源性分析,数据采用SPSS 17.0进行统计分析。结果共19株耐碳青霉烯类大肠埃希菌,检出科室以EICU检出最多,共8株占42.11%;共检出产KPC-2型碳青霉烯酶菌株17株;11株细菌同时编码ESBLs基因,包括携带blaKPC-2、blaCTX-M-14和blaTEM-13种β-内酰胺酶基因;脉冲场凝胶电泳证实有9个克隆株,其中A克隆共8株细菌,是主要流行的克隆;多位点序列分型结果显示3株产KPC-2菌株均为ST131型。结论产KPC酶大肠埃希菌同时携带有其他耐药基因,CTX-M型超广谱β-内酰胺酶最为常见;ST131型产KPC-2大肠埃希菌在中国出现,同时也扩大了其在世界流行范围。(本文来源于《中华医院感染学杂志》期刊2015年16期）
张伟铮,何慧婵,许振杰,李松,屈平华[6]（2015）在《耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌的基因型及同源性分析》一文中研究指出目的探讨耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌耐药性、基因型和同源性。方法收集临床碳青霉烯类抗生素耐药肺炎克雷伯菌23株,使用API 20E和GN卡鉴定,KB法检测18种抗菌药物和ESBLs表型,改良Hodge试验(MHT)确证碳青霉烯酶表型,PCR、DNA测序和BLAST证实基因型,应用脉冲场电泳(PFGE)分析产酶菌株同源性。(本文来源于《中华医学会第十二次全国临床微生物学术年会暨第十一次全球华人临床微生物学与感染症学术年会论文汇编》期刊2015-08-06）
张伟铮,何慧婵,许振杰,李松,屈平华[7]（2015）在《耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌的基因型及同源性分析》一文中研究指出目的探讨耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌的耐药性、基因型和同源性。方法收集临床采集的碳青霉烯类耐药肺炎克雷伯菌23株,检测其药物敏感性和ESBLs表型,改良Hodge试验确证碳青霉烯酶表型,PCR、DNA测序和BLAST证实基因型,脉冲场电泳(PFGE)分析产酶菌株同源性。结果 23株肺炎克雷伯菌对碳青霉烯类抗生素完全耐药,其中47.8%来源于痰液标本,主要分布在神经外科重症监护室(NCU)。23株菌ESBLs和改良Hodge试验阳性率分别为21.7%、82.6%,检出SHV-11(22株)、KPC-2(14株)、NDM-1(6株)、VEB(2株)、IMP(1株)、OXA-1(2株)和OXA-10(2株)耐药基因。PFGE将23株菌基因分成A~G 7个带型,其中以A型为主(69.6%,16/23)。结论碳青霉烯酶基因型以KPC-2型及NDM-1型为主,院内存在克隆株流行。(本文来源于《临床检验杂志》期刊2015年05期）
李传杰,李军,陶建萍,高健全,梁锦辉[8]（2014）在《鼻咽癌放疗患者铜绿假单胞菌感染基因型同源性》一文中研究指出目的探讨鼻咽癌放疗患者铜绿假单胞菌(PA)感染的病原菌临床分布、耐药特点及其基因型(同源)亲缘关系。方法采用BD phoenix 100全自动微生物鉴定药敏系统和CLSI M100-S23指南对临床分离菌进行鉴定和耐药表型分组,应用随机引物扩增多态性(RAPD)技术进行基因分型同源性分析。结果 49株PA来源于43位发生不同程度医院感染的鼻咽癌放疗患者,主要分布在咽拭子(46.94%)、痰(32.65%)、口腔分泌物(10.20%)等临床感染标本,耐药表型分组分别为Ⅰ组32株、Ⅱ组7株、Ⅲ组5株、Ⅳ组5株。49份PA样本经扩增后电泳出46个电泳图谱,分19个基因型别。在放疗二区高分布的H型菌株(57.14%)与在放疗四区高分布的J型菌株(60.00%)高度同源,耐药Ⅲ组、Ⅳ组的组内及组间型别亲缘关系不明显。不同病区鼻咽癌放疗患者之间存在基因型高度同源的PA感染局部流行,不同型别高耐药菌株的感染散发,部分亲缘关系密切菌株的耐药表型相似。结论应用基因分型技术检测分析病原菌同源性对医院感染监测和追踪具有重要意义。(本文来源于《分子诊断与治疗杂志》期刊2014年06期）
万艳红,葛银林,郝崇华,王淑峰,戎建荣[9]（2014）在《耐甲氧西林金黄色葡萄球菌表型及基因型同源性分析》一文中研究指出耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(MRSA)是引起医院和社区感染的重要病原菌之一[1]。近年来随着广谱及超广谱β-内酰胺类抗菌药物在临床上的广泛使用,MRSA的检出率不断增加[2]。MRSA感染有逐年增高的趋势,且具有多重耐药的特点。对MRSA耐药机制进行研究,寻找药物作用的新靶点,是目前全世界都密切关注的问题之一。由于MRSA在不同国(本文来源于《中国药物与临床》期刊2014年05期）
甘龙杰,吴秀风,高丽钦,林宇岚,陈勇[10]（2014）在《碳青霉烯类耐药肺炎克雷伯菌基因型检测及同源性分析》一文中研究指出目的了解福建医科大学附属第一医院耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌(KPC)的耐药基因分型及同源性分布情况。方法收集临床分离的29株KPC,改良Hodge试验检测碳青霉烯酶表型。PCR检测碳青霉烯酶blaKPC、blaIMP-1、blaVIM-1、blaOXA-48及blaNDM-1基因;阳性结果进行DNA测序,并进行BLAST比对确定其基因型。采用肠杆菌科基因间重复序列(ERIC-PCR)对KPC进行同源性分析。结果 29株KPC中Hodge试验阳性27株,阳性率为93.1%(27/29)。PCR扩增和DNA测序显示28株为blaKPC-2,1株为blaIMP-1,未检出blaVIM-2、blaOXA-48和blaNDM-1基因。同源性分析发现KPC主要存在两种型别:28株A1和1株A2。结论 blaKPC-2型碳青霉烯酶是该院KPC的主要型别,A1型已在该院流行,应加强院感监测和预防。ERIC-PCR是一种简便、快捷的基因分型技术,适合同源性的初步分型筛查。(本文来源于《中国微生态学杂志》期刊2014年03期）
基因型同源性论文开题报告
（1）论文研究背景及目的
此处内容要求：
首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景，再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题，并提出你的论文准备的观点或解决方法。
写法范例：
目的了解北京市某城区2014年分离的麻疹病毒基因型,及时发现输入性麻疹病例。方法采用荧光聚合酶链反应(PCR)方法,对北京市西城区2014年采集的标本进行病毒核酸鉴定、RT-PCR扩增,扩增产物进行测序及序列比对分析。结果 2014年北京市西城区共采集81例麻疹疑似患者的82份标本,其中咽拭子63份,尿19份。麻疹病毒核酸检测阳性70例,RT-PCR扩增、测序获得基因序列40份,麻疹病毒培养阳性毒株37例。种系进化树分析显示,获得的40份麻疹病毒基因序列与H基因簇代表株Chin9322/H1a,以及世界卫生组织推荐的代表株MVi/Hunan.CHN/0.93/7/H1在同一分支上,核苷酸水平上同源性分别为98%~98.9%、96.9%~97.8%;氨基酸水平上同源性分别为97.3%~99.3%、95.3%~98%。结论 2014年北京市西城区麻疹病例以本土基因型(H1)病例为主,进一步加强麻疹病例病原学监测对麻疹输入性病例的控制和预防具有重要意义。
（2）本文研究方法
调查法：该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。
观察法：用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。
实验法：通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。
文献研究法：通过调查文献来获得资料，从而全面的、正确的了解掌握研究方法。
实证研究法：依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。
定性分析法：对研究对象进行“质”的方面的研究，这个方法需要计算的数据较少。
定量分析法：通过具体的数字，使人们对研究对象的认识进一步精确化。
跨学科研究法：运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。
功能分析法：这是社会科学用来分析社会现象的一种方法，从某一功能出发研究多个方面的影响。
模拟法：通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。
基因型同源性论文参考文献
[1].徐超,魏庆宽,孔祥礼,李瑾,王用斌.山东省间日疟原虫MSP-1和CSP等位基因型及同源性分析[J].中国血吸虫病防治杂志.2017
[2].张晶波,王敬辉,崔京辉,于霞丽,陈萌.2014年北京市西城区40例麻疹患者分离的麻疹病毒基因型及同源性[J].中国感染控制杂志.2016
[3].郭大敏,黄汉,廖康,郭鹏豪,陈怡丽.耐万古霉素肠球菌的基因型和同源性分析[J].检验医学与临床.2016
[4].闻海丰,冯忠军,秦瑾,于文静.采用ERIC-PCR与PFGE分析鲍曼不动杆菌基因型和同源性并对比方法学差异[J].分子诊断与治疗杂志.2016
[5].齐艳,钱香,杨玮,蒋琰,楼正青.耐碳青霉烯类大肠埃希菌耐药基因型检测与同源性分析[J].中华医院感染学杂志.2015
[6].张伟铮,何慧婵,许振杰,李松,屈平华.耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌的基因型及同源性分析[C].中华医学会第十二次全国临床微生物学术年会暨第十一次全球华人临床微生物学与感染症学术年会论文汇编.2015
[7].张伟铮,何慧婵,许振杰,李松,屈平华.耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌的基因型及同源性分析[J].临床检验杂志.2015
[8].李传杰,李军,陶建萍,高健全,梁锦辉.鼻咽癌放疗患者铜绿假单胞菌感染基因型同源性[J].分子诊断与治疗杂志.2014
[9].万艳红,葛银林,郝崇华,王淑峰,戎建荣.耐甲氧西林金黄色葡萄球菌表型及基因型同源性分析[J].中国药物与临床.2014
[10].甘龙杰,吴秀风,高丽钦,林宇岚,陈勇.碳青霉烯类耐药肺炎克雷伯菌基因型检测及同源性分析[J].中国微生态学杂志.2014