导读:本文包含了谱库鉴定论文开题报告文献综述及选题提纲参考文献，主要关键词:蛋白质鉴定,串联质谱,谱库搜索,质谱鉴定
谱库鉴定论文文献综述
王耀君,孙世伟,卜东波,刘金刚[1]（2012）在《串联质谱谱库搜索鉴定技术综述》一文中研究指出介绍蛋白质质谱鉴定领域的串联质谱谱库搜索技术,分析谱库搜索技术的基本原理,从多个角度阐述当前主流的谱库搜索方法,并对其优缺点进行比较,针对目前蛋白质质谱鉴定技术所存在的优缺点,设计其改进思路,论述目前谱库搜索技术所面临的问题以及未来的研究趋势。(本文来源于《计算机工程》期刊2012年07期）
缪佳铮[2]（2010）在《基于质谱数据分析的蛋白质鉴定—断裂模型、磷酸化肽段以及谱库搜索方法的研究》一文中研究指出串联质谱(Tandem Mass Spectrometry)已成为蛋白质序列鉴定的重要方法,生物实验和质谱技术结合能在短时间内产生大量的质谱数据,远超过了人工分析的能力,因此需要借助计算机对质谱数据进行分析。目前基于串联质谱数据的蛋白质鉴别方法主要有数据库搜索(database search)方法、De Novo方法和肽段序列标签(peptide sequence tag)方法。其目标是从实验质谱推断未知肽段的氨基酸序列,其中理论图谱预测是关键一步。但仅仅有对肽段断裂机制的定性认识对理论质谱预测是不够的,还必须定量分析影响断裂的因素,如断裂肽键位置和断裂肽键种类等,从而提高理论图谱预测的精确度,进而提高蛋白质鉴定的准确度。蛋白质磷酸化是生物体内一种最重要的翻译后修饰,控制着大量的生命活动。因此,对磷酸化的研究具有一定的现实意义,而研究磷酸化肽段的断裂规律有助于磷酸化肽段的鉴定和磷酸化位点的确认。鉴于理论质谱预测的复杂性,质谱数据库(mass spectrum library)鉴定方法逐步应用于蛋白质鉴定领域,该方法避开了蛋白质鉴定中理论图谱预测这一难点,而是采用直接的谱-谱比较,但存在搜索速度慢、匹配不够精确以及存储图谱所需的内存空间较大等一些列问题,影响蛋白质鉴定的效率。针对上述问题,本研究进行了如下尝试：1.提出了肽段断裂的新模型：在理论质谱预测中,为克服估计b/y离子比例的困难,本研究提出了一个肽段断裂的新模型-断裂模型,即不去具体估计b/y等离子的强度,而是直接估计各个肽键断裂的可能性。该模型同时考虑肽键位置和肽键种类的影响。采用迭代算法对多组质谱数据集合进行了测试。实验结果表明：迭代算法学习出的参数和已有定性观察有很好的吻合；预测的理论图谱更为精确。2.探索磷酸化肽段的断裂规律：将断裂模型应用于标注好的磷酸化肽段质谱数据集,通过迭代算法鉴定磷酸化肽段,同时学习磷酸化肽段的断裂规律。实验结果表明：应用断裂模型的迭代算法能较好地鉴定磷酸化肽段,并揭示出磷酸化肽段与非磷酸化肽段在断裂规律上的不同。3.建立了一套基于谱库搜索的蛋白质鉴定新方法：我们对收集到的大量质谱图进行分类和标注,然后对可能为同一肽段的图谱进行合并,生成合理的合成谱,然后建立有效的索引,即所谓的图谱“指纹”技术,最后通过精确打分从谱库中找到与输入图谱最相似的匹配。实验结果表明：该方法具有搜索速度快、存储空间小和计算复杂度低等特点；在单个CPU下每秒可搜索107张图谱。(本文来源于《浙江工商大学》期刊2010-01-01）
林艳,董建军,樊伟[3]（2006）在《ERIC-RAPO指纹技术用于野生酵母鉴定和标准谱库的构建》一文中研究指出开发了ERIC-RAPD指纹技术,建立了酵母种的ERIC-DNA“指纹”,组成野生酵母的标准图谱库。对未知酵母种进行遗传聚类分析,确定其分类地位。并将该技术应用于生产样品分离野生酵母的菌种鉴定。(本文来源于《啤酒科技》期刊2006年03期）
赵凤仪,王巨存,王缬秀,赵德福,白人骁[4]（2004）在《我国临床可遇见18种分枝杆菌霉菌酸指纹谱库构建及种型鉴定的研究》一文中研究指出霉菌酸(Mycolic acid,MA)分析快速鉴定分枝杆菌是一种有效的色谱化学分析方法,近年来被国外越来越多的结核病实验室所采用。它通过对分枝杆菌样品的皂化、提取、柱前衍生、色谱梯度洗脱所获得的MA指纹图,进行分析比较达到种间鉴定的目的。(本文来源于《2004年中国防痨协会临床基础专业委员会学术会议论文集》期刊2004-06-30）
蔡锡兰[5]（1998）在《药物红外谱库的建立与鉴定》一文中研究指出用高纯度的生物检村中提取的药物，在一定的测试条件下测得其红外光谱图，按照一定规则编码，将光谱信息转变为计算机可读形式，存放在计算机存贮设备中建立药物红外光谱库。本实验对常见生物检材中的药物片剂直接进样、检索、解析，确定药物成分。此法操作简便、快速、定性准确。(本文来源于《南京师范专科学校学报》期刊1998年04期）
陈月[6]（1998）在《毒品红外光谱库的建立与检索鉴定》一文中研究指出用高纯度毒品在一定测试条件下测得其红外光谱图,按照一定规则编码,将光谱信息转变为计算机可读形式建立毒品红外光谱库.本实验研究建立了对常见缴获毒品直接进样、快速定性、确定其主要成分的方法,应用效果良好.(本文来源于《江苏公安专科学校学报》期刊1998年01期）
谱库鉴定论文开题报告
（1）论文研究背景及目的
此处内容要求：
首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景，再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题，并提出你的论文准备的观点或解决方法。
写法范例：
串联质谱(Tandem Mass Spectrometry)已成为蛋白质序列鉴定的重要方法,生物实验和质谱技术结合能在短时间内产生大量的质谱数据,远超过了人工分析的能力,因此需要借助计算机对质谱数据进行分析。目前基于串联质谱数据的蛋白质鉴别方法主要有数据库搜索(database search)方法、De Novo方法和肽段序列标签(peptide sequence tag)方法。其目标是从实验质谱推断未知肽段的氨基酸序列,其中理论图谱预测是关键一步。但仅仅有对肽段断裂机制的定性认识对理论质谱预测是不够的,还必须定量分析影响断裂的因素,如断裂肽键位置和断裂肽键种类等,从而提高理论图谱预测的精确度,进而提高蛋白质鉴定的准确度。蛋白质磷酸化是生物体内一种最重要的翻译后修饰,控制着大量的生命活动。因此,对磷酸化的研究具有一定的现实意义,而研究磷酸化肽段的断裂规律有助于磷酸化肽段的鉴定和磷酸化位点的确认。鉴于理论质谱预测的复杂性,质谱数据库(mass spectrum library)鉴定方法逐步应用于蛋白质鉴定领域,该方法避开了蛋白质鉴定中理论图谱预测这一难点,而是采用直接的谱-谱比较,但存在搜索速度慢、匹配不够精确以及存储图谱所需的内存空间较大等一些列问题,影响蛋白质鉴定的效率。针对上述问题,本研究进行了如下尝试：1.提出了肽段断裂的新模型：在理论质谱预测中,为克服估计b/y离子比例的困难,本研究提出了一个肽段断裂的新模型-断裂模型,即不去具体估计b/y等离子的强度,而是直接估计各个肽键断裂的可能性。该模型同时考虑肽键位置和肽键种类的影响。采用迭代算法对多组质谱数据集合进行了测试。实验结果表明：迭代算法学习出的参数和已有定性观察有很好的吻合；预测的理论图谱更为精确。2.探索磷酸化肽段的断裂规律：将断裂模型应用于标注好的磷酸化肽段质谱数据集,通过迭代算法鉴定磷酸化肽段,同时学习磷酸化肽段的断裂规律。实验结果表明：应用断裂模型的迭代算法能较好地鉴定磷酸化肽段,并揭示出磷酸化肽段与非磷酸化肽段在断裂规律上的不同。3.建立了一套基于谱库搜索的蛋白质鉴定新方法：我们对收集到的大量质谱图进行分类和标注,然后对可能为同一肽段的图谱进行合并,生成合理的合成谱,然后建立有效的索引,即所谓的图谱“指纹”技术,最后通过精确打分从谱库中找到与输入图谱最相似的匹配。实验结果表明：该方法具有搜索速度快、存储空间小和计算复杂度低等特点；在单个CPU下每秒可搜索107张图谱。
（2）本文研究方法
调查法：该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。
观察法：用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。
实验法：通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。
文献研究法：通过调查文献来获得资料，从而全面的、正确的了解掌握研究方法。
实证研究法：依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。
定性分析法：对研究对象进行“质”的方面的研究，这个方法需要计算的数据较少。
定量分析法：通过具体的数字，使人们对研究对象的认识进一步精确化。
跨学科研究法：运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。
功能分析法：这是社会科学用来分析社会现象的一种方法，从某一功能出发研究多个方面的影响。
模拟法：通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。
谱库鉴定论文参考文献
[1].王耀君,孙世伟,卜东波,刘金刚.串联质谱谱库搜索鉴定技术综述[J].计算机工程.2012
[2].缪佳铮.基于质谱数据分析的蛋白质鉴定—断裂模型、磷酸化肽段以及谱库搜索方法的研究[D].浙江工商大学.2010
[3].林艳,董建军,樊伟.ERIC-RAPO指纹技术用于野生酵母鉴定和标准谱库的构建[J].啤酒科技.2006
[4].赵凤仪,王巨存,王缬秀,赵德福,白人骁.我国临床可遇见18种分枝杆菌霉菌酸指纹谱库构建及种型鉴定的研究[C].2004年中国防痨协会临床基础专业委员会学术会议论文集.2004
[5].蔡锡兰.药物红外谱库的建立与鉴定[J].南京师范专科学校学报.1998
[6].陈月.毒品红外光谱库的建立与检索鉴定[J].江苏公安专科学校学报.1998