玉米淀粉分支酶基因论文-周瑶

玉米淀粉分支酶基因论文-周瑶

导读:本文包含了玉米淀粉分支酶基因论文开题报告文献综述及选题提纲参考文献,主要关键词:玉米,序列变异,关联分析,籽粒理化特性

玉米淀粉分支酶基因论文文献综述

周瑶[1](2019)在《玉米淀粉去分支酶基因ISA与PUL的序列变异及其与籽粒理化特性的关联分析》一文中研究指出玉米淀粉去分支酶基因PUL与ISA在玉米淀粉生物合成过程中具有重要作用。对这些基因序列变异进行分析并挖掘相关的优异等位变异,有利于揭示淀粉去分支酶基因的演化规律,为开发分子功能标记提供有力依据。本研究以335份优良玉米自交系、68份玉米地方品种和32份大刍草为供试材料,对4个玉米淀粉去分支酶相关基因(ISA1、SA2、ISA3和PUL)进行重测序。然后对这些基因在叁个群体间和在自交系内部的序列变异进行了分析。最后对335份优良玉米自交系的12个籽粒理化特性相关性状(7个糊化特性参数、4个淀粉热力学特性参数和淀粉含量)进行了测定,将其与4个玉米淀粉去分支酶相关基因进行关联分析,筛选与籽粒淀粉理化特性相关的优异等位变异位点。主要研究结果如下:1.表型数据的分析结果表明:12个玉米籽粒理化特性相关性状在335份优良自交系中表现出广泛变异。糊化特性、淀粉热力学特性和淀粉含量等籽粒理化特性性状在自交系间均表现出极显着的差异。变异系数的范围为1.31%~67.53%,其中峰值温度的变异系数最小,崩解值的变异系数最大。这些淀粉籽粒理化特性的广义遗传率在65.80%到82.96%之间。同时,玉米淀粉糊化特性、热力学特性和淀粉含量间表现出显着的相关性。2.序列变异分析的结果表明:ISA1基因在335份玉米自交系中共检测到410个变异位点(356个SNP和54个InDel),平均每31.26bp存在一个SNP变异;每206.11bp就有一个InDel。ISA2基因检测到128个变异位点(118个SNP和10个InDel),平均每33.8bp有一个SNP变异;每398.8bp就有一个InDel。ISA3基因共检测到497个变异位点(429个SNP和68个InDel),平均每31.07bp有一个SNP变异;每196.03bp就有一个InDel。PUL基因共检测到1305个变异位点(1025 个 SNP 和 280 个 InDel),平均每 53.85bp 有一个 SNP 变异;197.15bp 就有一个InDel。在大刍草、地方品种和自交系中,4个相关基因的核苷酸多态性依次减小,受到了强烈选择。3.本研究对12个玉米籽粒理化特性相关性状进行候选基因的关联分析,共检测到16个显着位点。在ISA1基因上检测到与谷值粘度相关联的2个显着位点,分别与崩解值、淀粉含量和回复值相关的1个显着位点,解释了 5.20%和7.06%的表型变异,其中在7039bp的SNP(G/A)对谷值粘度的贡献率最大。在ISA2基因上分别定位到4个显着位点,其中3个SNP与热焓值显着关联,表型贡献率为7.35%~13.38%;1个InDel与峰值粘度关联,解释9.60%的表型变异。在ISA3基因上定位到5个显着位点,其中在10329bp处的SNP与峰值粘度显着关联,表型贡献率为8.42%~8.73%;有1个SNP与热焓值显着关联,表型贡献率为7.40%;有1个SNP与糊化温度显着关联,表型贡献率为7.29%。在PUL基因上关联到与峰值粘度、热焓值相关的2个显着位点。其中在32878bp处的SNP与峰值粘度显着关联,表型贡献率为9.74%;1个InDel与热焓值显着关联,表型贡献率为9.48%。(本文来源于《扬州大学》期刊2019-05-01)

杨天天[2](2019)在《玉米淀粉分支酶基因SBE的遗传演化及其与籽粒理化特性的关联分析》一文中研究指出玉米是世界叁大作物之一,且淀粉含量丰富,约占世界淀粉量的80%以上。淀粉品质相关性状是复杂的数量性状,研究淀粉合成相关基因与淀粉品质性状的关系对于选育优良玉米品种以及改善玉米淀粉品质具有重要意义。淀粉分支酶(SBE)是淀粉合成中四类关键酶之一,主要参与了淀粉支链的合成。本研究首先对335份自交系、68份地方品种以及32份大刍草中的SBE基因进行重测序,分析4个SBE基因在叁类群体中的序列变异;同时结合335份自交系的基因型和淀粉品质相关表型(峰值粘度PV、谷值粘度TV、终值粘度FV、崩解值BD、回复值SB、糊化时间PT、糊化温度PTP、起始温度To、峰值温度Tp、终值温度Tc、热焓值△H-g、粗淀粉含量SC)进行候选基因关联分析并挖掘优异等位变异,相关结果如下:1、表型分析结果表明:12个淀粉品质性状在335份优良自交系中存在广泛的变异,其中崩解值的变异系数最大,峰值温度的变异系数最小。12个性状之间存在一定的相关性。谷值粘度的广义遗传率最高,糊化时间的广义遗传率最低。12个性状中有9个性状在不同年份间存在极显着差异,所有性状在不同品系间以及品系和年份互作均存在极显着差异。2、SBE基因序列变异分析结果表明:在叁类群体中,BEI基因共发现1102个位点,其中有916个SNP(平均9.9bp一个)和186个InDel(平均50bp一个);EⅡa基因共发现1519个位点,其中有 1302个SNP(平均9.7bp一个)和217个InDel(平均58.8bp一个)BEⅡb基因共发现1616个位点,其中有1353个SNP(平均14.5bp一个)和263个InDel(平均76.9bp一个)BEⅢ基因共发现了 1044个位点,其中有903个SNP(平均7.6bp一个)和141个InDel(平均47.6bp一个)核苷酸多态性π值的范围在0.00711~0.01467之间。根据4个基因在叁类群体中π值与基因各位点间LD值的变化情况,发现BⅡb基因在玉米驯化和改良过程中受到的选择最大,BEⅢ受到的选择最小。3、基于候选基因的关联分析结果发现:一共关联到21个与淀粉品质相关的显着位点,BEⅡa基因中共检测到4个和热焓值显着关联的位点,其中在5969bp处的InDel(-/C)对热焓值的解释率最大,为4.28%。根据变异位点在叁类群体中的比例和其周围核苷酸多态性大小情况,发现InDel5969、SNP403和InDel5967在玉米驯化和改良过程中受到强烈选择;BEⅡ基因中共检测到4个与回复值显着关联的位点,其中在8152bp处的SNP(A/G)对回复值的贡献率最大,达3.95%。另外,发现位点SNP17249、SNP8152和SNP17786在玉米驯化和改良过程中受到了强烈的选择;BEⅢ中共检测到13个与热焓值和淀粉含量显着关联的位点,其中在-830bp处的InDel(G/-)对淀粉含量的解释率最大,达4.88%。位点 InDel-830、SNP-356、SNP3918、SNP4867、SNP4868 和 SNP4817 在玉米驯化和改良过程中受到强烈选择。(本文来源于《扬州大学》期刊2019-05-01)

李楠,赵吉元,尹悦佳,柳青,郭嘉[3](2015)在《玉米淀粉分支酶基因SBEⅡ b高效沉默表达载体的构建及转化表达》一文中研究指出淀粉分支酶(starch branching enzyme,SBE)是淀粉合成的限速酶。为了进一步研究SBEⅡb沉默对玉米生长及直链淀粉合成的影响,克隆了玉米(Zea mays)淀粉分支酶SBEⅡb基因片段,构建了SBEⅡb的发卡结构表达载体p TFU-SBEⅡb hairpin,用农杆菌介导法将其导入玉米HiⅡ幼胚中,经除草剂筛选获得了194株转化再生植株,其中4株结实,获得转基因种子35粒。T1代植株经PCR及试纸条检测获得3株阳性材料,半定量RT-PCR结果得出SBEⅡb的表达量降低,推断出基因表达水平降低对直链淀粉的合成具有正效应。(本文来源于《生物技术进展》期刊2015年02期)

张颖君,高慧敏,刘茜,胡梦芸,李辉[4](2012)在《玉米淀粉分支酶SBEⅠ基因RNAi干扰载体的构建》一文中研究指出淀粉分支酶(SBE)催化葡萄糖以α-(1,6)糖苷键连接,形成分支结构。SBE有3种同工酶形式:SBEⅠ、SBEⅡa和SBEⅡb,目前的研究主要集中在SBEⅡb上,而对于SBEⅠ在淀粉合成的作用报道极少。为了明确SBEⅠ在玉米淀粉合成中的作用,扩增了玉米SBEⅠ基因的337bp片段,以pMD19-T为中间载体,pCambia3301为目标载体,构建玉米SBEⅠ基因的RNAi载体,命名为pC3301-SBEⅠ。通过限制性内切酶酶切鉴定,表明pC3301-SBEⅠ载体构建正确,可用于农杆菌介导的玉米自交系转化工作。(本文来源于《中国农学通报》期刊2012年24期)

崔喜艳,刘晶,刘忠野,韩琳[5](2012)在《玉米淀粉分支酶SBEⅡb基因片段酵母双杂交诱饵载体的构建及检测》一文中研究指出为探寻玉米淀粉分支酶(starch branching enzyme,SBEⅡb)与其互作蛋白的作用位点,构建了酵母双杂交诱饵载体。根据CDD和NCBI对SBEⅡb蛋白氨基酸序列的分析,确定玉米SBEⅡb的功能域及非功能域,PCR扩增功能域及非功能域基因的目的片段,经回收纯化,用相同的限制性内切酶将其与载体pGBKT7进行双酶切后,分别将目的基因片段与载体pGBKT7进行连接。构建了酵母双杂交诱饵载体pGBKT7-SBEⅡb-X(X=1,2,3,4,5,6),转化酵母菌AH109的菌液,OD600值在0.8以上,证明诱饵载体pGBKT7-SBEⅡb-X对酵母菌AH109没有毒性作用;转化诱饵载体后的酵母菌AH109,在SD/-Trp/X-α-Gal平板上长出白色菌落,在SD/-His/-Trp/X-α-Gal、SD/-Ade/-Trp/X-α-Gal平板上不能生长,排除了pGBKT7-SBEⅡb-X具有自激活宿主菌AH109的作用。构建的酵母双杂交诱饵载体pGBKT7-SBEⅡb-X(X=1,2,3,4,5,6),其表达对酵母细胞无毒性及对报告基因无自激活作用,可为下一步分析SBEⅡb与其互作蛋白的作用位点奠定基础。(本文来源于《中国农学通报》期刊2012年15期)

范亚丽,阮颖,刘春林[6](2012)在《马铃薯遗传转化体系的优化及玉米淀粉分支酶基因SBEⅡb的导入》一文中研究指出以马铃薯脱毒试管苗茎段为转化受体材料,建立并优化了农杆菌介导的马铃薯遗传转化体系。通过农杆菌介导法将玉米淀粉分支酶基因(Starch branching enzyme b,SBEⅡb)的过表达载体转化马铃薯,接种762个茎段,共获得35株抗性植株。经PCR检测获得了4株转基因阳性植株;对转基因植株进一步进行GUS活性组织化学染色,发现转基因植株的茎段与试管薯均被染上蓝色,表明外源SBEⅡb基因已整合到马铃薯基因组,且正常表达。(本文来源于《广西植物》期刊2012年02期)

车昕明,郭新梅,裴玉贺,高学艳,宋希云[7](2011)在《玉米淀粉分支酶SBEIIb基因遗传转化玉米自交系的研究》一文中研究指出以玉米自交系丹黄25为试材,用农杆菌介导法将玉米淀粉分支酶SBEIIb基因转入玉米中,探讨了农杆菌介导玉米愈伤组织转化的影响因素。结果表明:愈伤组织经过9 d的继代,菌液中乙酰丁香酮(AS)浓度为10 mg/L,侵染时间为20 min,共培养60 h为最佳转化条件。获得的4株再生植株经PCR分析鉴定,其中3株表现阳性,证明外源基因已经整合到玉米基因组中。(本文来源于《华北农学报》期刊2011年05期)

徐亚维,王丕武,柴晓杰[8](2010)在《玉米淀粉分支酶sbeⅡb基因启动子的克隆与特异表达》一文中研究指出[目的]构建玉米淀粉分支酶sbeⅡb基因种子特异表达启动子。[方法]LA-PCR扩增了玉米淀粉分支酶sbeⅡb基因启动子序列,并克隆到pMD18-TVector上。再将启动子克隆到pBI121载体上,构建植物表达载体pBI121-sbeⅡb。把GUS基因连到pBI121-sbeⅡb上构建pSBE-GUS后利用农杆菌介导法转化烟草。分别进行PCR和Southern杂交检测,并对经基因枪轰击和农杆菌介导的烟草种子、根、茎及叶进行GUS组织化学分析和荧光检测。[结果]测序结果与GenBank中发表的玉米sbeⅡb基因启动子同源性达98.52%。共培养和筛选培养后获得4株转pSBE-GUS植株,叶片仅有少量蓝斑出现,而根和茎部未见蓝斑,但烟草种子有大量蓝斑显出,初步推断sbeⅡb基因启动子能启动GUS在种子中特异表达。[结论]成功构建了玉米淀粉分支酶sbeⅡb基因种子特异表达启动子。(本文来源于《安徽农业科学》期刊2010年36期)

徐亚维,王丕武,柴晓杰[9](2010)在《玉米淀粉分支酶sbeⅡb基因启动子的克隆与特异表达(英文)》一文中研究指出[目的]构建玉米淀粉分支酶sbeⅡb基因种子特异表达启动子。[方法]LA-PCR扩增了玉米淀粉分支酶sbeⅡb基因启动子序列,并克隆到pMD18-TVector上。再将启动子克隆到pBI121载体上,构建植物表达载体pBI121-sbeⅡb。把GUS基因连到pBI121-sbeⅡb上构建pSBE-GUS后利用农杆菌介导法转化烟草。分别进行PCR和Southern杂交检测,并对经基因枪轰击和农杆菌介导的烟草种子、根、茎及叶进行GUS组织化学分析和荧光检测。[结果]测序结果与GenBank中发表的玉米sbeⅡb基因启动子同源性达98.52%。共培养和筛选培养后获得4株转pSBE-GUS植株,叶片仅有少量蓝斑出现,而根和茎部未见蓝斑,但烟草种子有大量蓝斑显出,初步推断sbeⅡb基因启动子能启动GUS在种子中特异表达。[结论]成功构建了玉米淀粉分支酶sbeⅡb基因种子特异表达启动子。(本文来源于《Agricultural Science & Technology》期刊2010年Z2期)

关淑艳,王丕武,刘广娜,刘慧婧,赵丽娜[10](2009)在《玉米淀粉分支酶sbe2a基因反义载体的构建及其转基因初步研究》一文中研究指出应用PCR技术克隆了玉米淀粉分支酶sbe2a基因片段,并将其克隆到pMD18-T载体,对重组子进行PCR检测和限制性内切酶分析,并进行序列比对。结果表明:克隆片段长度为562 bp。将该基因反向插入到pWGLL载体Actin-pro启动子下游,构建高效反义表达载体,通过花粉管通道法将其导入玉米自交系"铁7922",经PCR检测初步证明外源基因已整合到玉米基因组中。(本文来源于《吉林农业大学学报》期刊2009年04期)

玉米淀粉分支酶基因论文开题报告

(1)论文研究背景及目的

此处内容要求:

首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景,再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题,并提出你的论文准备的观点或解决方法。

写法范例:

玉米是世界叁大作物之一,且淀粉含量丰富,约占世界淀粉量的80%以上。淀粉品质相关性状是复杂的数量性状,研究淀粉合成相关基因与淀粉品质性状的关系对于选育优良玉米品种以及改善玉米淀粉品质具有重要意义。淀粉分支酶(SBE)是淀粉合成中四类关键酶之一,主要参与了淀粉支链的合成。本研究首先对335份自交系、68份地方品种以及32份大刍草中的SBE基因进行重测序,分析4个SBE基因在叁类群体中的序列变异;同时结合335份自交系的基因型和淀粉品质相关表型(峰值粘度PV、谷值粘度TV、终值粘度FV、崩解值BD、回复值SB、糊化时间PT、糊化温度PTP、起始温度To、峰值温度Tp、终值温度Tc、热焓值△H-g、粗淀粉含量SC)进行候选基因关联分析并挖掘优异等位变异,相关结果如下:1、表型分析结果表明:12个淀粉品质性状在335份优良自交系中存在广泛的变异,其中崩解值的变异系数最大,峰值温度的变异系数最小。12个性状之间存在一定的相关性。谷值粘度的广义遗传率最高,糊化时间的广义遗传率最低。12个性状中有9个性状在不同年份间存在极显着差异,所有性状在不同品系间以及品系和年份互作均存在极显着差异。2、SBE基因序列变异分析结果表明:在叁类群体中,BEI基因共发现1102个位点,其中有916个SNP(平均9.9bp一个)和186个InDel(平均50bp一个);EⅡa基因共发现1519个位点,其中有 1302个SNP(平均9.7bp一个)和217个InDel(平均58.8bp一个)BEⅡb基因共发现1616个位点,其中有1353个SNP(平均14.5bp一个)和263个InDel(平均76.9bp一个)BEⅢ基因共发现了 1044个位点,其中有903个SNP(平均7.6bp一个)和141个InDel(平均47.6bp一个)核苷酸多态性π值的范围在0.00711~0.01467之间。根据4个基因在叁类群体中π值与基因各位点间LD值的变化情况,发现BⅡb基因在玉米驯化和改良过程中受到的选择最大,BEⅢ受到的选择最小。3、基于候选基因的关联分析结果发现:一共关联到21个与淀粉品质相关的显着位点,BEⅡa基因中共检测到4个和热焓值显着关联的位点,其中在5969bp处的InDel(-/C)对热焓值的解释率最大,为4.28%。根据变异位点在叁类群体中的比例和其周围核苷酸多态性大小情况,发现InDel5969、SNP403和InDel5967在玉米驯化和改良过程中受到强烈选择;BEⅡ基因中共检测到4个与回复值显着关联的位点,其中在8152bp处的SNP(A/G)对回复值的贡献率最大,达3.95%。另外,发现位点SNP17249、SNP8152和SNP17786在玉米驯化和改良过程中受到了强烈的选择;BEⅢ中共检测到13个与热焓值和淀粉含量显着关联的位点,其中在-830bp处的InDel(G/-)对淀粉含量的解释率最大,达4.88%。位点 InDel-830、SNP-356、SNP3918、SNP4867、SNP4868 和 SNP4817 在玉米驯化和改良过程中受到强烈选择。

(2)本文研究方法

调查法:该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。

观察法:用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。

实验法:通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。

文献研究法:通过调查文献来获得资料,从而全面的、正确的了解掌握研究方法。

实证研究法:依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。

定性分析法:对研究对象进行“质”的方面的研究,这个方法需要计算的数据较少。

定量分析法:通过具体的数字,使人们对研究对象的认识进一步精确化。

跨学科研究法:运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。

功能分析法:这是社会科学用来分析社会现象的一种方法,从某一功能出发研究多个方面的影响。

模拟法:通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。

玉米淀粉分支酶基因论文参考文献

[1].周瑶.玉米淀粉去分支酶基因ISA与PUL的序列变异及其与籽粒理化特性的关联分析[D].扬州大学.2019

[2].杨天天.玉米淀粉分支酶基因SBE的遗传演化及其与籽粒理化特性的关联分析[D].扬州大学.2019

[3].李楠,赵吉元,尹悦佳,柳青,郭嘉.玉米淀粉分支酶基因SBEⅡb高效沉默表达载体的构建及转化表达[J].生物技术进展.2015

[4].张颖君,高慧敏,刘茜,胡梦芸,李辉.玉米淀粉分支酶SBEⅠ基因RNAi干扰载体的构建[J].中国农学通报.2012

[5].崔喜艳,刘晶,刘忠野,韩琳.玉米淀粉分支酶SBEⅡb基因片段酵母双杂交诱饵载体的构建及检测[J].中国农学通报.2012

[6].范亚丽,阮颖,刘春林.马铃薯遗传转化体系的优化及玉米淀粉分支酶基因SBEⅡb的导入[J].广西植物.2012

[7].车昕明,郭新梅,裴玉贺,高学艳,宋希云.玉米淀粉分支酶SBEIIb基因遗传转化玉米自交系的研究[J].华北农学报.2011

[8].徐亚维,王丕武,柴晓杰.玉米淀粉分支酶sbeⅡb基因启动子的克隆与特异表达[J].安徽农业科学.2010

[9].徐亚维,王丕武,柴晓杰.玉米淀粉分支酶sbeⅡb基因启动子的克隆与特异表达(英文)[J].AgriculturalScience&Technology.2010

[10].关淑艳,王丕武,刘广娜,刘慧婧,赵丽娜.玉米淀粉分支酶sbe2a基因反义载体的构建及其转基因初步研究[J].吉林农业大学学报.2009

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