郑小壮:基于线粒体COⅠ基因序列的掌肢新米虾7个自然群体遗传多样性分析论文

郑小壮:基于线粒体COⅠ基因序列的掌肢新米虾7个自然群体遗传多样性分析论文

本文主要研究内容

作者郑小壮,陈清华,陈文坚,郭照良(2019)在《基于线粒体COⅠ基因序列的掌肢新米虾7个自然群体遗传多样性分析》一文中研究指出:采用DNA条形码技术,对采自广东清远、惠州、韶关、广州与广西河池、南宁、崇左的7个掌肢新米虾(Neocaridinapalmata)野生群体的97个样本的线粒体COⅠ基因片段进行PCR扩增和测序分析,研究掌肢新米虾自然群体的遗传多样性及遗传结构。结果表明:掌肢新米虾在624 bp的COⅠ基因序列中A、T、C、G碱基的平均含量分别为26.98%、33.17%、20.99%、18.85%,AT含量(60.15%)高于CG含量(39.84%),表现出较强的AT偏倚性;基于COⅠ基因序列的总群体中共检测到4个核苷酸变异位点,定义了5种单倍型,平均核苷酸差异数(K)、单倍型多样性指数(Hd)以及核苷酸多样性指数(Pi)分别为0.611、(0.557±0.025)、(0.00098±0.00007),呈现出高单倍型多样性和低核苷酸多样性;7个自然群体的群体内遗传距离为0.000~0.001,群体间的遗传距离为0.000~0.002;分子方差分析(AMOVA)和遗传分化系数(Fst)结果揭示,掌肢新米虾的遗传变异主要来自于群体间;中性检验和核苷酸错配分布表明,掌肢新米虾7个自然群体遵循群体扩张模式,发生了历史扩张事件;系统发育分析显示,广东4群体与广西3群体形成姐妹支,表明不同地理区域具有一定的种群特征,可作为单独的管理单位进行保护,Hap1与Hap4分别是广东4群体与广西3群体和惠州群体的共享单倍型,其余单倍型为各群体所独享。

Abstract

cai yong DNAtiao xing ma ji shu ,dui cai zi an dong qing yuan 、hui zhou 、shao guan 、an zhou yu an xi he chi 、na ning 、chong zuo de 7ge zhang zhi xin mi ha (Neocaridinapalmata)ye sheng qun ti de 97ge yang ben de xian li ti COⅠji yin pian duan jin hang PCRkuo zeng he ce xu fen xi ,yan jiu zhang zhi xin mi ha zi ran qun ti de wei chuan duo yang xing ji wei chuan jie gou 。jie guo biao ming :zhang zhi xin mi ha zai 624 bpde COⅠji yin xu lie zhong A、T、C、Gjian ji de ping jun han liang fen bie wei 26.98%、33.17%、20.99%、18.85%,AThan liang (60.15%)gao yu CGhan liang (39.84%),biao xian chu jiao jiang de ATpian yi xing ;ji yu COⅠji yin xu lie de zong qun ti zhong gong jian ce dao 4ge he gan suan bian yi wei dian ,ding yi le 5chong chan bei xing ,ping jun he gan suan cha yi shu (K)、chan bei xing duo yang xing zhi shu (Hd)yi ji he gan suan duo yang xing zhi shu (Pi)fen bie wei 0.611、(0.557±0.025)、(0.00098±0.00007),cheng xian chu gao chan bei xing duo yang xing he di he gan suan duo yang xing ;7ge zi ran qun ti de qun ti nei wei chuan ju li wei 0.000~0.001,qun ti jian de wei chuan ju li wei 0.000~0.002;fen zi fang cha fen xi (AMOVA)he wei chuan fen hua ji shu (Fst)jie guo jie shi ,zhang zhi xin mi ha de wei chuan bian yi zhu yao lai zi yu qun ti jian ;zhong xing jian yan he he gan suan cuo pei fen bu biao ming ,zhang zhi xin mi ha 7ge zi ran qun ti zun xun qun ti kuo zhang mo shi ,fa sheng le li shi kuo zhang shi jian ;ji tong fa yo fen xi xian shi ,an dong 4qun ti yu an xi 3qun ti xing cheng jie mei zhi ,biao ming bu tong de li ou yu ju you yi ding de chong qun te zheng ,ke zuo wei chan du de guan li chan wei jin hang bao hu ,Hap1yu Hap4fen bie shi an dong 4qun ti yu an xi 3qun ti he hui zhou qun ti de gong xiang chan bei xing ,ji yu chan bei xing wei ge qun ti suo du xiang 。

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  • 论文详细介绍

    论文作者分别是来自湖南农业大学学报(自然科学版)的郑小壮,陈清华,陈文坚,郭照良,发表于刊物湖南农业大学学报(自然科学版)2019年05期论文,是一篇关于掌肢新米虾论文,自然群体论文,基因论文,遗传多样性论文,遗传结构论文,湖南农业大学学报(自然科学版)2019年05期论文的文章。本文可供学术参考使用,各位学者可以免费参考阅读下载,文章观点不代表本站观点,资料来自湖南农业大学学报(自然科学版)2019年05期论文网站,若本站收录的文献无意侵犯了您的著作版权,请联系我们删除。

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