导读:本文包含了转录序列的选择性捕获论文开题报告文献综述及选题提纲参考文献，主要关键词:SCOTS,病原菌,差异表达基因
转录序列的选择性捕获论文文献综述
张飞,曹玉琴,曹叁杰,文心田,黄小波[1]（2015）在《选择性捕获转录序列(SCOTS)技术在病原菌差异表达基因筛选中的应用》一文中研究指出病原菌在进入宿主机体的过程中,需要调节自身基因的表达以适应宿主多变的内环境并最终定植。筛选病原菌体外培养与感染过程中差异表达的基因,可以在分子层面解析感染过程。已有的研究表明,差异表达基因在病原菌致病过程中发挥着重要作用~([1]),这些基因被广泛用于疫苗的研究~([2])、疾病的诊断~([3-4])等。分子生物学的发展以及各学科的交叉衍生出了多种差异表达基因筛选方法,如基因芯片(DNA microarray)~([5])、实时荧光定量RT-PCR、体内诱导抗原(本文来源于《中国兽医学报》期刊2015年12期）
方丽君[2]（2010）在《选择性捕获鸡白痢沙门菌在巨噬细胞内的转录序列》一文中研究指出鸡白痢沙门菌呈世界范围分布。目前,在西方部分发达国家鸡白痢已经被消灭或基本消灭,而在国内该病的危害仍严重。鸡白痢沙门菌多造成2-3周龄雏鸡死亡,成年鸡则可带菌而无临床症状。感染后存活的鸡常表现生殖系统病变,引起蛋鸡产蛋量下降,并污染种蛋,造成巨大的经济损失。该病既可垂直传播,又可水平传播,造成严重的危害。探究鸡白痢沙门菌潜在的致病基因,了解其致病机理,对于寻求新的有效防治措施具有重要的意义。随着各种分子生物学和免疫学研究手段的出现,人们对病原体在感染宿主过程中转录的基因序列的研究也逐渐深入。选择性捕获转录序列(selective capture of transcribed sequences,SCOTS)技术在研究病原体体内转录序列方面有着独特的优势。本研究比较了鸡白痢沙门菌在鸡体内和体外巨噬细胞系中的存活消亡趋势,以鸡巨噬细胞系HD-11为侵染模型,用SCOTS技术捕获该菌在巨噬细胞中的转录序列,并初步分析了其中一个序列在侵染细胞过程中的转录水平。1鸡白痢沙门菌体内外侵染实验为了探究鸡白痢沙门菌S06004在与鸡体单核吞噬细胞系统和体外巨噬细胞系的相互作用的过程中,细菌定殖、复制的变化趋势,进行了细菌的体内侵染实验和体外巨噬细胞侵染实验。体内侵染实验中,以口服和肌注两种方式感染9日龄非免疫海兰白蛋鸡,感染后第叁天吞噬细胞中的细菌量都达到最高点,第九天下降到每克组织中带菌量不足500 cfu,且这种状态能够持续至少5天。在体内侵染实验中,细菌的定殖趋势为先发生复制增殖、后消减至很低水平,并且低水平的带菌状态会维持一段时间。同时在体外侵染实验中,不论给予细菌1h还是2.5h的作用时间,进入巨噬细胞内的细菌量在增殖3h左右时都达到最高点,消减到较低的水平后,能够维持一段时间。在体外实验中胞内的细菌同样具有先增殖后消减,并维持一段低水平细菌携带率的平台期的存活趋势。鸡白痢沙门菌S06004株对鸡巨噬细胞系HD-11的体外侵染实验结果和体内吞噬细胞侵染实验结果基本吻合,故采用鸡白痢沙门菌侵染鸡巨噬细胞系HD-11可以在一定程度上模拟细菌体内感染时与内脏器官吞噬细胞系统的相互作用。2选择性捕获鸡白痢沙门菌在巨噬细胞内的转录序列应用SCOTS方法鉴定鸡白痢沙门菌S06004株在感染鸡巨噬细胞系HD-11过程中细菌表达的基因。根据细菌体内和体外侵染实验的研究结果,选用鸡白痢沙门菌S06004侵染鸡巨噬细胞系HD-11,以模拟细菌体内侵染吞噬细胞过程,通过SCOTS技术对转录序列cDNAs的选择性捕获,检测了细菌在与巨噬细胞相互作用过程中毒力基因以及相关调控基因的表达,共得到16个序列。除了一个未知序列,这些体内转录序列包括毒力相关的III型分泌系统中分泌素蛋白和Ⅰ型分泌系统中外膜蛋白的编码基因、代谢相关的敏感激酶和核苷水解酶的编码基因、运输功能基因、一些质粒编码基因以及环境适应性功能基因等。3实时荧光定量PCR动态分析鸡白痢沙门菌体内转录序列7-6在侵染过程中的转录水平根据SCOTS技术捕获得到的体内转录序列7-6,设计了针对其特异性检测的一对引物,同时设计鸡白痢沙门菌16sRNA基因的引物作为内参。提取鸡白痢沙门菌S06004株在侵染细胞过程中各个阶段的总RNA,反转录成cDNAs,利用荧光定量PCR比较基因在不同阶段的表达水平的差异。结果表明:捕获序列7-6在体外培养时不表达;在侵染初期表达量最高;在细菌胞内增殖阶段,基因的表达量先上升后下降,在增殖3h时表达量最高,在增殖5h后,7-6序列的表达下降到很低的水平。基因的转录变化与细菌的巨噬细胞侵染过程密切关联。(本文来源于《扬州大学》期刊2010-05-01）
胡军勇,金卉,谢启运,万云,楚杰[3]（2009）在《应用反向斑点杂交技术从转录序列的选择性捕获中筛选副猪嗜血杆菌表达差异基因》一文中研究指出通过对靶DNA的种类和浓度、探针浓度、紫外交联时间等反向斑点杂交条件优化,建立了一种从选择性捕获的转录序列(selective capture of transcribed sequences,SCOTS)库中筛选副猪嗜血杆菌在体内、外差异表达的基因的方法。通过反向斑点杂交技术从10个样品中筛选出的6个样品被证明是副猪嗜血杆菌(Haemophilus parasuis)在体内上调表达或者是特异表达的基因。结果表明:SCOTS技术能够有效地获得一个可能存在差异表达基因的cDNA文库,而反向斑点杂交技术可以有效地从中筛选到差异表达基因。(本文来源于《农业生物技术学报》期刊2009年02期）
陈祥,高崧,王晓泉,焦新安,刘秀梵[4]（2007）在《选择性捕获禽病原性大肠杆菌体内转录序列》一文中研究指出采用选择性捕获转录序列(SCOTS)方法鉴定禽病原性大肠杆菌E037株(血清型O78)在感染SPF鸡过程中的转录表达基因。通过总RNA分离、cDNAs合成、PCR扩增和SCOTS对cDNAs选择和致病性特异转录序列的富集,致病性特异的cDNAs被分离鉴定,共获得31个转录序列(命名为aec),其中分别有2、1、4、14、2和8个aec序列与黏附素、LPS的合成、铁的摄取系统、质粒编码基因、噬菌体编码基因和一些其它功能基因相关;从气囊中分离到16个aec序列,心包膜中分离到15个aec序列;有3种与质粒编码基因相关序列在气囊和心包膜中都被分离到。结果显示APEC致病性特异序列包括黏附素、LPS的合成、铁的转运、质粒编码基因、噬菌体编码基因和一些其它功能基因等。通过SCOTS方法建立了一种体内表达致病性特异基因的方法和APEC在自然宿主感染模型中致病性相关基因的表达谱的筛选方法。(本文来源于《微生物学报》期刊2007年03期）
转录序列的选择性捕获论文开题报告
（1）论文研究背景及目的
此处内容要求：
首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景，再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题，并提出你的论文准备的观点或解决方法。
写法范例：
鸡白痢沙门菌呈世界范围分布。目前,在西方部分发达国家鸡白痢已经被消灭或基本消灭,而在国内该病的危害仍严重。鸡白痢沙门菌多造成2-3周龄雏鸡死亡,成年鸡则可带菌而无临床症状。感染后存活的鸡常表现生殖系统病变,引起蛋鸡产蛋量下降,并污染种蛋,造成巨大的经济损失。该病既可垂直传播,又可水平传播,造成严重的危害。探究鸡白痢沙门菌潜在的致病基因,了解其致病机理,对于寻求新的有效防治措施具有重要的意义。随着各种分子生物学和免疫学研究手段的出现,人们对病原体在感染宿主过程中转录的基因序列的研究也逐渐深入。选择性捕获转录序列(selective capture of transcribed sequences,SCOTS)技术在研究病原体体内转录序列方面有着独特的优势。本研究比较了鸡白痢沙门菌在鸡体内和体外巨噬细胞系中的存活消亡趋势,以鸡巨噬细胞系HD-11为侵染模型,用SCOTS技术捕获该菌在巨噬细胞中的转录序列,并初步分析了其中一个序列在侵染细胞过程中的转录水平。1鸡白痢沙门菌体内外侵染实验为了探究鸡白痢沙门菌S06004在与鸡体单核吞噬细胞系统和体外巨噬细胞系的相互作用的过程中,细菌定殖、复制的变化趋势,进行了细菌的体内侵染实验和体外巨噬细胞侵染实验。体内侵染实验中,以口服和肌注两种方式感染9日龄非免疫海兰白蛋鸡,感染后第叁天吞噬细胞中的细菌量都达到最高点,第九天下降到每克组织中带菌量不足500 cfu,且这种状态能够持续至少5天。在体内侵染实验中,细菌的定殖趋势为先发生复制增殖、后消减至很低水平,并且低水平的带菌状态会维持一段时间。同时在体外侵染实验中,不论给予细菌1h还是2.5h的作用时间,进入巨噬细胞内的细菌量在增殖3h左右时都达到最高点,消减到较低的水平后,能够维持一段时间。在体外实验中胞内的细菌同样具有先增殖后消减,并维持一段低水平细菌携带率的平台期的存活趋势。鸡白痢沙门菌S06004株对鸡巨噬细胞系HD-11的体外侵染实验结果和体内吞噬细胞侵染实验结果基本吻合,故采用鸡白痢沙门菌侵染鸡巨噬细胞系HD-11可以在一定程度上模拟细菌体内感染时与内脏器官吞噬细胞系统的相互作用。2选择性捕获鸡白痢沙门菌在巨噬细胞内的转录序列应用SCOTS方法鉴定鸡白痢沙门菌S06004株在感染鸡巨噬细胞系HD-11过程中细菌表达的基因。根据细菌体内和体外侵染实验的研究结果,选用鸡白痢沙门菌S06004侵染鸡巨噬细胞系HD-11,以模拟细菌体内侵染吞噬细胞过程,通过SCOTS技术对转录序列cDNAs的选择性捕获,检测了细菌在与巨噬细胞相互作用过程中毒力基因以及相关调控基因的表达,共得到16个序列。除了一个未知序列,这些体内转录序列包括毒力相关的III型分泌系统中分泌素蛋白和Ⅰ型分泌系统中外膜蛋白的编码基因、代谢相关的敏感激酶和核苷水解酶的编码基因、运输功能基因、一些质粒编码基因以及环境适应性功能基因等。3实时荧光定量PCR动态分析鸡白痢沙门菌体内转录序列7-6在侵染过程中的转录水平根据SCOTS技术捕获得到的体内转录序列7-6,设计了针对其特异性检测的一对引物,同时设计鸡白痢沙门菌16sRNA基因的引物作为内参。提取鸡白痢沙门菌S06004株在侵染细胞过程中各个阶段的总RNA,反转录成cDNAs,利用荧光定量PCR比较基因在不同阶段的表达水平的差异。结果表明:捕获序列7-6在体外培养时不表达;在侵染初期表达量最高;在细菌胞内增殖阶段,基因的表达量先上升后下降,在增殖3h时表达量最高,在增殖5h后,7-6序列的表达下降到很低的水平。基因的转录变化与细菌的巨噬细胞侵染过程密切关联。
（2）本文研究方法
调查法：该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。
观察法：用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。
实验法：通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。
文献研究法：通过调查文献来获得资料，从而全面的、正确的了解掌握研究方法。
实证研究法：依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。
定性分析法：对研究对象进行“质”的方面的研究，这个方法需要计算的数据较少。
定量分析法：通过具体的数字，使人们对研究对象的认识进一步精确化。
跨学科研究法：运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。
功能分析法：这是社会科学用来分析社会现象的一种方法，从某一功能出发研究多个方面的影响。
模拟法：通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。
转录序列的选择性捕获论文参考文献
[1].张飞,曹玉琴,曹叁杰,文心田,黄小波.选择性捕获转录序列(SCOTS)技术在病原菌差异表达基因筛选中的应用[J].中国兽医学报.2015
[2].方丽君.选择性捕获鸡白痢沙门菌在巨噬细胞内的转录序列[D].扬州大学.2010
[3].胡军勇,金卉,谢启运,万云,楚杰.应用反向斑点杂交技术从转录序列的选择性捕获中筛选副猪嗜血杆菌表达差异基因[J].农业生物技术学报.2009
[4].陈祥,高崧,王晓泉,焦新安,刘秀梵.选择性捕获禽病原性大肠杆菌体内转录序列[J].微生物学报.2007