高通量鉴定论文-李帆,阮继伟

高通量鉴定论文-李帆,阮继伟

导读:本文包含了高通量鉴定论文开题报告文献综述及选题提纲参考文献,主要关键词:减数分裂,重组抑制突变体,荧光标记,高通量可视分析法

高通量鉴定论文文献综述

李帆,阮继伟[1](2019)在《利用荧光标记高通量鉴定减数分裂重组抑制突变体》一文中研究指出正向遗传学突变体筛选被广泛用于揭示减数分裂中涉及的遗传基因,如调控减数分裂II型交叉形成途径的重组抑制基因。该研究利用拟南芥(Arabidopsis thaliana)花粉荧光标记系进行EMS突变体的正向遗传学筛选,鉴定拟南芥野生型Col遗传背景下的重组抑制突变体,共获得18个重组率显着提高3倍以上的重组抑制突变体,其中包括显性和隐性遗传突变。研究表明,基于荧光标记高通量鉴定重组抑制突变体是可行的,可为植物减数分裂重组调控分子机制研究提供新方法和突变材料。(本文来源于《植物学报》期刊2019年04期)

林少华,罗红霞,贾红亮,句荣辉,王建[2](2019)在《高通量测序技术结合传统方法筛选及鉴定奶酒中曲霉菌》一文中研究指出奶酒含有丰富的营养,且具有驱寒活血、开胃消食等保健功效。但由于传统的可培养方法对其微生物全貌的认识具有一定的局限性。因此,本文采用高通量测序技术,对奶酒的真菌生物多样性进行检测。结果表明,酵母菌属(Saccharomyces)和曲霉属(Aspergillus)是奶酒最主要的真菌群落,其中,酵母菌属为第一丰度的真菌,丰度约为62%。第二丰度的真菌为曲霉属,丰度为33%。通过进一步分离并采用16S鉴定出了一株曲霉菌,这可为奶酒发酵剂的开发提供依据。(本文来源于《中国奶牛》期刊2019年06期)

蔡芳,任繁栋,任达兵,刘韶,易伦朝[3](2019)在《整合定性策略用于大黄素代谢物的高通量靶向鉴定》一文中研究指出采用超高效液相色谱-四极杆-轨道阱质谱联用技术,使用Thermo scientific Hypersil GLOD色谱柱,以0.1%甲酸-乙腈为流动相,应用梯度洗脱程序对肾间质纤维化大鼠血清中的大黄素及其代谢物进行了分析。将质量亏损、中性丢失、诊断碎片离子过滤等技术互相融合,提出了一种可高通量靶向鉴定药物有效成分在体内的代谢物的方法,并将本方法应用到大黄素大鼠血液代谢物的鉴定中,鉴定出大黄素在大鼠体内的11种代谢物及39种可能的代谢物,并证明大黄素在大鼠体内的Ι相代谢途径主要是氧化和羟基化,Ⅱ相代谢途径主要是硫酸酯化和葡萄糖醛酸化。本方法有效减少了定性分析过程中基质和干扰离子的影响,提高了代谢物定性分析的效率和准确性。(本文来源于《分析化学》期刊2019年08期)

柴贵娟[4](2019)在《基于高通量测序技术对喉癌相关长链非编码RNA的初步筛选及鉴定》一文中研究指出研究背景:喉癌(laryngeal carcinoma,LC)是头颈部常见的恶性肿瘤,在全身恶性肿瘤中约占5.7%~7.6%。在全球范围内,喉癌的发病率和死亡率分别为2.3/100 000和1.2/100 000~([1]),是严重威胁人类健康的一大杀手。然而,随着城市化、工业化以及人口老龄化的进程加快,高吸烟率和环境污染日益严重,我国喉癌的发病率有增高趋势~([2])。目前喉癌的诊断仍是通过患者的临床表现结合影像学特征、组织学检查结果等临床辅助检查手段来确诊,这些传统方式在一定程度上的局限性使得喉癌早期诊治变得困难。因此,通过揭示喉癌发病的分子机制,寻找可应用于临床的喉癌筛查和早期诊断的有效的肿瘤标记物,以提高喉癌早期诊断水平和防治效果已成为一项具有潜在临床价值的研究方向。以基因芯片及高通量测序技术(high-throughput sequencing)在近年来的迅猛发展,将转录组水平测序推向新台阶。研究发现占基因组95%以上的长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)以多种机制广泛参与到人类肿瘤肿瘤的发展变化的各个过程,具有成为恶性肿瘤早期诊断和预后判断的分子标记以及分子靶向治疗靶点的潜在临床研究价值。目前喉癌相关lncRNA的研究方兴未艾,逐步建立lncRNA表达谱,探索特异lncRNA在喉癌发病机制,已经成为肿瘤研究领域中的新热点。目的:基于高通量测序技术通过对喉癌组织及癌旁组织长链非编码RNA差异性比较,筛选与喉癌发生、发展相关lncRNA,寻找潜在的喉癌相关性分子标记物。研究方法:1.基于高通量测序获得喉癌相关lncRNA表达谱,采用生物信息学手段对差异表达的lncRNA进行分析,筛选出喉癌与癌旁组织差异性表达的lncRNA。2.对差异表达的lncRNA与其相关基因生物学功能与参与的信号通路进行富集;根据lncRNA差异性表达倍数,筛选有显着差异的6个目的lncRNA。3.选取2017年11月-2018年9月于在吉林大学第二医院确诊为喉癌并于耳鼻咽喉头颈外科行喉癌切除手术并经我院病理科确诊为喉鳞状细胞癌的患者喉癌、对应癌旁标本,采用逆转录-聚合酶链反应(Reverse Transcription-Polymerase Chain Reaction,RT-PCR)检测其中8例喉癌组织、癌旁组织6个目的lncRNA表达趋势,根据RT-PCR结果选择差异表达趋势最明显的2个lncRNA在15对喉癌及癌旁组织中进行荧光定量qPCR验证。结果:1.经高通量测序,喉癌及对应癌旁组织相比,共有593个lncRNA具有差异性,其中差异性表达在4倍及以上lncRNA为312个,8倍及以上lncRNA为228个。从中选择6个具有显着表达差异的lncRNA作为后续验证的目标lncRNA,分别为NONHSAT244419.1,NONHSAT185102.1,NONHSAT176191.1,NONHSAT176190.1,NONHSAT176189.1,NONHSAT149828.1。2.在8对喉癌及癌旁组织中行RT-PCR验证,结果显示在喉癌及相应癌旁组织中lncRNA NONHSAT176190.1,NONHSAT176189.1具有较明显差异表达趋势;在15对喉癌及癌旁组织中行对lncRNANONHSAT176190.1,NONHSAT176189.1行qPCR验证,并行统计学分析,显示NONHSAT176190.1,NONHSAT176189.1与高通量测序结果具备同质性,在喉癌组织中表达下调。结论:1.基于高通量测序技术对喉癌lncRNA表达谱初步建立,与癌旁组织相比,具有大量的差异性lncRNA。2.应用高通量测序技术对喉癌及癌旁组织测序,提供大量转录组水平的肿瘤相关数据,有助于发现新的喉癌标志物及相关发生机制。3.NONHSAT176190.1,NONHSAT176189.1在喉癌、癌旁组织中差异性表达,且在喉癌组织中表达下调,提示可能与喉癌肿瘤进程相关。(本文来源于《吉林大学》期刊2019-05-01)

张驰,胡成慧,邱静思,苏燕,邹承武[5](2019)在《基于高通量测序鉴定慈姑黄化病病原》一文中研究指出【目的】明确引致广西平乐县慈姑大面积黄化的主要病原物,为该病害的防治提供参考。【方法】从广西平乐县采集自然表现褪绿黄化症状的慈姑植株,分别提取其叶片和茎组织的总RNA,利用RNA-Seq高通量测序技术对其转录组进行测序,并对序列组装获得的重迭群(contigs)进行BLAST注释,筛选出注释为植原体16S rRNA序列的contigs,根据其序列设计引物Phy-F和Phy-R,以采集的褪绿黄化症状慈姑植株和无症状植株的叶片样本总DNA为模板,进行PCR鉴定。【结果】对扩增获得的长度为1.5 kb的DNA片段进行序列测定,从分子水平证实慈姑黄化病的病原为植原体(strain:AY-China)。将测序获得的植原体16S rRNA序列与GenBank收录的15个植原体分组代表菌株的16S rRNA序列进行比对分析并构建系统发育进化树,发现AY-China与翠菊黄化植原体16SrI组(Aster yellows group:16SrI)聚类在同一分支,且各组代表菌株的16S rRNA序列相似性在88.3%~96.0%。进一步将AY-China与16SrI不同亚组代表菌株的16S rRNA序列进行多重比对并构建系统发育进化树,发现AY-China与翠菊黄化植原体16SrI-B亚组聚类到在一分支,且与16SrI-B亚组代表菌株的16S rRNA序列相似性高达99.5%,说明AY-China应属于16SrI-B亚组。【结论】广西平乐县慈姑黄化病病原为植原体,其隶属于翠菊黄化植原体16SrI-B亚组。(本文来源于《南方农业学报》期刊2019年03期)

柴阿丽,陈利达,曹金强,康华军,石延霞[6](2019)在《利用siRNA高通量测序和RT-PCR技术鉴定引起茄子斑驳紫花病的病毒种类》一文中研究指出为了明确引起茄子斑驳紫花病的病毒种类,利用小干扰RNA(si RNA)高通量测序技术,结合生物信息学方法寻找茄子样本中的病毒序列,发现存在烟草轻型绿花叶病毒(Tobacco mild green mosaic virus,TMGMV)和番茄斑驳花叶病毒(Tomato mottle mosaic virus,ToMMV)。为了验证该结果,对待测样品中TMGMV和ToMMV的外壳蛋白(coatprotein,CP)全长基因进行RT-PCR扩增和系统进化分析,分别得到500bp的TMGMV-CP和482bp的ToMMV-CP特异性条带,与GenBank中TMGMV和ToMMV序列相似性分别达到98%~100%和100%,说明待测样品中确实存在TMGMV和ToMMV。对采自山东、河南、辽宁、河北等地的23份疑似斑驳紫花病茄子样品,分别采用特异性引物524-F/R和ToMMV-F/R进行检测。结果显示,所有样品中均含有TMGMV,20份样品中含有ToMMV,复合侵染检出率为86.96%。对茄子、番茄和辣椒幼苗的致病性检测显示,接种后茄子花表现出与田间相同的症状,茄子、番茄和辣椒的叶片表现典型的病毒侵染症状,在接种发病组织中检测到病毒ToMMV和TMGMV。结果表明,茄子斑驳紫花病样中鉴定出TMGMV和ToMMV两种病毒。(本文来源于《园艺学报》期刊2019年03期)

张佩,邵先锋,王振山,贾辰熙[7](2019)在《高通量质谱法用于小鼠器官内源性肽的鉴定》一文中研究指出内源性肽以细胞因子、生长激素、激素肽等形式在人体的内分泌、神经、细胞生长和生殖各个领域发挥功能。神经肽是一种内源性肽,与痛觉、睡眠、情绪、学习与记忆等生理活动相关,不但存在于脑部神经细胞,也存在于其他体液和器官内并发挥重要作用。目前对器官内源性肽的研究仍不足,尤其是其中的神经肽。文中应用液质联用串联质谱高通量鉴定胰腺、心脏、肝脏和肾脏中内源性肽的分布以及神经肽的种类。鉴定结果显示,在肝脏中内源性肽和神经肽的数目最多,而胰腺中最少;所鉴定到的内源性肽具有器官特异性,在4个器官中分别呈现不同的动态分布;4个器官中神经肽的LPV(最长肽变异体)数目差异较大,而且基因家族的分布也各不相同,比如胰腺中的神经肽多属于Glucagon家族,心脏中的神经肽分别属于ACBD7、Granins、PEBP等几个家族。鉴定结果将为疾病的机制研究和治疗药物的研发提供参考。(本文来源于《生物工程学报》期刊2019年04期)

张婷婷,梁勇满,许亮,杨燕云,邢艳萍[8](2018)在《基于高通量测序技术对五种白头翁药材混合样品的DNA分子鉴定研究》一文中研究指出中药白头翁应用历史悠久,药典收载为毛莨科植物白头翁Pulsatilla chinensis (Bge.) Regel的干燥根。市场流通中易混淆种有朝鲜白头翁、兴安白头翁、细叶白头翁、金县白头翁等,伪品众多,准确鉴定十分迫切。本研究采用宏基因组学的方法,基于高通量测序技术对5种白头翁药材混合样品的ITS2序列进行测序。首先对药材混合粉末中的总DNA进行提取,并对总DNA中ITS2片段进行PCR扩增,再利用Illumina MiSeq平台对DNA片段进行双端测序,最后采用FLASH、QIIME以及GraPhlAn等软件对序列进行整理分析并与本课题组前期上传至GenBank中的序列进行聚类分析。结果显示,混合样品中共得到53 024条ITS2序列,有效序列52 295条,白头翁属5种药材总计49 079条,其代表序列与本课题组前期上传至GenBank中的序列进行聚类分析后,5种白头翁分别聚为一支,呈单系性。结果表明,利用高通量测序技术,以ITS2序列作为DNA条形码,可以对5种白头翁药材的混合粉末进行有效鉴定,为混合中药材的基原鉴定提供新的方法和思路。(本文来源于《药学学报》期刊2018年11期)

齐耀程,丁舰舟,左晓龙,张玮,钱益亮[9](2018)在《玉米抗黄曲霉田间高通量鉴定方法构建及应用(英文)》一文中研究指出为构建快速有效的玉米抗黄曲霉菌的田间高通量鉴定方法,本研究分别对5个递增的黄曲霉菌孢子浓度和3种接种方式进行对比优化,建立病情级别与黄曲霉毒素B1积累量的相关模型。结果表明,不同抗性玉米自交系在孢子浓度为1.0×10~6 c/mL浓度的抗性能力最准确,使用螺旋定量接种法避免造成发病菌圈重迭等缺点,利用病情级别与黄曲霉毒素B1积累量的正相关模型有效预测玉米自交系对黄曲霉的抗性能力。螺旋定量鉴定出自育重组自交系后代群体中抗性自交系8个,中抗性自交系9个,实现了抗黄曲霉菌玉米自交系在田间环境的高通量鉴定,结果准确性高,有较好的稳定性和重复性。(本文来源于《Agricultural Science & Technology》期刊2018年05期)

杜雄明,何守朴,孙君灵,王省芬,张艳[10](2018)在《棉花种质资源高通量鉴定与优异等位基因发掘》一文中研究指出【研究背景】棉花全基因组框架图的完成及重测序等高通量技术的发展,为解码棉花基因组及表型遗传变异奠定了基础。相比芯片技术,重测序技术以其高效,可重复性好等特点,近年来广泛应用于基因组与表型变异研究。棉花核心种质重要性状表型、基因组变异鉴定为深化棉花基因组研究提供了重要依据,为棉花重要性状定向育种提供了较为精准的标记和基因资源。【材料与方法】为此,本研究2014-2015年对419份陆地棉核心种质在黄河流域、长江流域和西北内陆叁大棉区的6个地点共12个环境,鉴定了纤维长度、强度、铃重、衣分等13个纤维品质和产量性状,获得了近20万个表型数据。并进行了基因组深度6.55倍重测序。【结果与分析】本研究基于陆地棉核心种质3,665,030个SNP的全基因组关联分析,共鉴定出与13个性状显着关联的SNP共7,383个,并从中鉴定出5,753个优异位点。系统发育进化分析结果表明Wild、Modem和Early叁个群体群体间的优异位点频率(FEA)是有差异的。在驯化过程中,所有性状FEA显着增加,而在育种选择过程中,这些位点增加较少;Wild群体中优异SNP较少,且都延续在Early群体中,Modem群体特异优异SNP也较少,说明优异SNP大多数在早期群体中就已经存在;通过比较核心种质与陆地棉野生种系全基因组功能基因SNP变异,发现33.88%基因无任何SNP变异,40.10%和9.87%个基因分别表现为SNP变异数减少和增加。优异SNP位点或相关候选基因多集中于Dt亚基因组,体现了At与Dt的进化不平衡特点。明确了不同性状遗传位点分布的重点染色体,与纤维品质强关联的SNP及基因,大多集中于Dt亚组,主要集中在Dt11,Dt10,Dt07,At10,At07等染色体上,其中D11染色体富集大量与7个纤维品质相关性状的SNP位点,与纤维长度显着关联的SNP主要位于Dt11(45.5%)和At10(40.9%),纤维强度主要位于At07(53.2%)和Dt11(32.5%)。不同性状间的优异SNP位点也有很大差异。本研究得到与纤维品质相关的优异SNP位点3883个,发现与纤维品质关联的SNP数量远多于纤维产量SNP,FL特有的SNP占比例最高,达21.61%。该项研究共关联到4820个基因,MAT特有的基因占比例最高(26.48%)。在纤维发育的不同阶段,也存在基因优势表达差异。结合4个差异较大的棉花品种纤维发育不同时期的转录组分析,发现3,089个(64.1%)基因在纤维发育的不同阶段高表达,其中存在着许多与开花期(纤维起始)、纤维长度(伸长)和纤维强度(细胞壁加厚)有关的新基因。【结论】该研究首次对陆地棉核心种质群体的遗传多样性和群体结构进行了系统分析,利用全基因组关联分析(GWAS)发掘了一大批重要性状相关的优异位点和基因,为分子育种提供了资源和遗传信息。GWAS尽管得到广泛应用,但也存在一定局限性,需要进一步完善。(本文来源于《2018中国作物学会学术年会论文摘要集》期刊2018-10-14)

高通量鉴定论文开题报告

(1)论文研究背景及目的

此处内容要求:

首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景,再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题,并提出你的论文准备的观点或解决方法。

写法范例:

奶酒含有丰富的营养,且具有驱寒活血、开胃消食等保健功效。但由于传统的可培养方法对其微生物全貌的认识具有一定的局限性。因此,本文采用高通量测序技术,对奶酒的真菌生物多样性进行检测。结果表明,酵母菌属(Saccharomyces)和曲霉属(Aspergillus)是奶酒最主要的真菌群落,其中,酵母菌属为第一丰度的真菌,丰度约为62%。第二丰度的真菌为曲霉属,丰度为33%。通过进一步分离并采用16S鉴定出了一株曲霉菌,这可为奶酒发酵剂的开发提供依据。

(2)本文研究方法

调查法:该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。

观察法:用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。

实验法:通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。

文献研究法:通过调查文献来获得资料,从而全面的、正确的了解掌握研究方法。

实证研究法:依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。

定性分析法:对研究对象进行“质”的方面的研究,这个方法需要计算的数据较少。

定量分析法:通过具体的数字,使人们对研究对象的认识进一步精确化。

跨学科研究法:运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。

功能分析法:这是社会科学用来分析社会现象的一种方法,从某一功能出发研究多个方面的影响。

模拟法:通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。

高通量鉴定论文参考文献

[1].李帆,阮继伟.利用荧光标记高通量鉴定减数分裂重组抑制突变体[J].植物学报.2019

[2].林少华,罗红霞,贾红亮,句荣辉,王建.高通量测序技术结合传统方法筛选及鉴定奶酒中曲霉菌[J].中国奶牛.2019

[3].蔡芳,任繁栋,任达兵,刘韶,易伦朝.整合定性策略用于大黄素代谢物的高通量靶向鉴定[J].分析化学.2019

[4].柴贵娟.基于高通量测序技术对喉癌相关长链非编码RNA的初步筛选及鉴定[D].吉林大学.2019

[5].张驰,胡成慧,邱静思,苏燕,邹承武.基于高通量测序鉴定慈姑黄化病病原[J].南方农业学报.2019

[6].柴阿丽,陈利达,曹金强,康华军,石延霞.利用siRNA高通量测序和RT-PCR技术鉴定引起茄子斑驳紫花病的病毒种类[J].园艺学报.2019

[7].张佩,邵先锋,王振山,贾辰熙.高通量质谱法用于小鼠器官内源性肽的鉴定[J].生物工程学报.2019

[8].张婷婷,梁勇满,许亮,杨燕云,邢艳萍.基于高通量测序技术对五种白头翁药材混合样品的DNA分子鉴定研究[J].药学学报.2018

[9].齐耀程,丁舰舟,左晓龙,张玮,钱益亮.玉米抗黄曲霉田间高通量鉴定方法构建及应用(英文)[J].AgriculturalScience&Technology.2018

[10].杜雄明,何守朴,孙君灵,王省芬,张艳.棉花种质资源高通量鉴定与优异等位基因发掘[C].2018中国作物学会学术年会论文摘要集.2018

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