导读:本文包含了菌落原位杂交论文开题报告文献综述及选题提纲参考文献，主要关键词:菌落原位杂交,环境微生物,检测
菌落原位杂交论文文献综述
丁海燕,冯伟,李凌智,黄永红,张虹[1]（2015）在《菌落原位杂交技术在环境微生物检测中的应用》一文中研究指出微生物技术在处理环境污染物等方面具有成本低、无二次污染、反应条件温和等优点。为从根本上解决环境问题,就环境中微生物的检测为主题,介绍了菌落原位杂交的原理以及在环境微生物检测中的应用。(本文来源于《安徽农业科学》期刊2015年14期）
刘超兰,王海英,李文芳,张文学,赖登燡[2]（2013）在《菌落原位杂交法筛选特定菌种的方法初探》一文中研究指出菌落原位杂交法是重组DNA技术中最常用的方法之一,但该方法存在着杂交背景复杂及杂交结果不稳定性等缺点,所以进一步优化杂交体系显得尤为迫切。本研究通过优化杂交体系,最终确定利用溶菌酶处理杂交膜和采用非严紧型洗脱方式洗膜,不仅使得杂交体系的杂交结信号清晰,而且杂交背景较干净。研究结果表明,在探针特异性好的基础上,采用优化的菌落原位杂交体系筛选特定菌种是可行的。(本文来源于《酿酒科技》期刊2013年08期）
吕欣,彭霞薇,呼庆,马安周,江泽平[3]（2013）在《利用DGGE-菌落原位杂交法分离土壤中精喹禾灵降解菌》一文中研究指出从自然环境中分离到的可降解农药的土着微生物,因其对环境的友好性及原位修复的可行性,受到了高度关注.为从土壤中筛选精喹禾灵降解菌株,首先利用PCR-DGGE技术分析了除草剂精喹禾灵胁迫下土壤细菌群落结构及多样性的变化.结果表明,添加精喹禾灵后,土壤细菌群落结构发生了明显的改变.精喹禾灵使细菌多样性呈现出增加-减少-增加的变化趋势,其中第9 d变化最大,后期趋于稳定.根据DGGE图谱条带的测序结果推断,Pseudomonas、Massilia、Burkholderia等属中的细菌对精喹禾灵具有耐受性或降解潜力,这些微生物类群可作为减少农药残留的土着微生物资源进行分离筛选.根据条带的测序结果,合成了地高辛(Digoxigenin)标记的探针,并进行了菌落原位杂交,筛选到了3株具有降解潜力的菌株,其中L1可以利用精喹禾灵作为唯一碳源生长,经16S rRNA基因鉴定该菌株属于假单胞菌属(Pseudomonas sp.).利用高效液相色谱法测定了菌株L1在无机盐培养基中降解精喹禾灵的效果.结果表明,培养7 d后,精喹禾灵的含量减少了近50%,且随着精喹禾灵含量的降低,L1菌体数量增加,证实了菌株L1具有降解精喹禾灵的能力.这一结果为今后研究菌株L1降解精喹禾灵的机制、功能基因等奠定了基础.(本文来源于《环境科学》期刊2013年01期）
卢超,包振民,彭薇,鄢婧婧,吕雅萌[4]（2010）在《富集文库-菌落原位杂交法筛选仿刺参微卫星标记》一文中研究指出应用微卫星富集文库—菌落原位杂交的方法,筛选得到了33个仿刺参的微卫星标记。富集文库中900个重组克隆经过菌落原位杂交后,415个(46.1%)为阳性克隆。随机挑取100个阳性克隆进行测序,结果显示这些克隆都含有微卫星位点。设计了57对特异性PCR引物,33对能扩增出清晰的条带。利用48个野生仿刺参个体对33个微卫星位点进行评价,结果显示位点都具有多态性。33个多态位点共获得222个等位基因,平均每个位点获得6.7个等位基因。观测杂合度(Ho)和期望杂合度(He)的范围分别为0.050 0~1.000 0和0.203 2~0.915 9。结果表明,富集文库—菌落原位杂交法筛选微卫星标记比较高效,获得的微卫星标记可以用于仿刺参的分子遗传学研究。(本文来源于《中国海洋大学学报(自然科学版)》期刊2010年S1期）
刘元元[5]（2010）在《利用菌落原位杂交技术进行乳酸杆菌SLP基因的筛选》一文中研究指出乳酸杆菌作为益生菌,给人们带来了很大的福利,它对肠道黏膜表面的黏附被公认为是使乳酸杆菌定植在肠道和发挥益生菌功能最重要的前提之一,其中S层蛋白(S-layer Protein, SLP)是使乳酸杆菌具有黏附功能的主要物质之一。SLP是位于细胞壁或细胞膜表面的一层由蛋白或糖蛋白亚单位组成的晶格状结构。乳酸杆菌SLP是已知SLP中分子量最小的一类,分子量在25-71KDa之间,均为碱性蛋白。本试验对已被报道的乳酸杆菌的SLP基因序列进行比对分析,从中找出了一段具有特异性的基因序列,通过探针设计,以地高辛标记,制备了特异性的寡核苷酸探针,5'-AGACTATTAT GGACAACGCT TACTTCTACG-3'。为了鉴定探针的特异性,以实验室现有的含SLP基因的短乳杆菌(L. brevis) C、短乳杆菌(L. brevis) M和瑞士乳杆菌(L. helveticus) ATCC15009 3株乳酸杆菌为标本进行菌落原位杂交。试验结果表明,设计的寡核苷酸探针具有一定的特异性,能很好的检测乳酸杆菌中SLP基因。利用SL培养基从自制的泡菜水、自制的酸肉、光明奶酪以及动物肠道等不同生境中,分离得到45株菌,通过镜检和过氧化氢酶测定初步确认为乳酸杆菌。将45株菌通过裂解的方法使DNA暴露于硝酸纤维素滤膜上,通过烘烤的方法固定DNA,使用制备的探针与之杂交,显色观察结果。试验证明在这45株菌中有8株含SLP基因,将这8株菌进行SDS-PAGE蛋白电泳,结果显示,这8株菌都具有不同分子量的SLP,对有些较单一的条带,可考虑将其纯化,进行下一步的研究。从这8株菌中选取了具有不同分子量SLP的3个菌株进行16S rRNA鉴定,通过同源性比对可知,这3株菌其中有2株为罗伊氏乳杆菌(Lactobacillus reuteri),另外一株为植物乳杆菌(Lactobacillus plantarum)。关于罗伊氏乳杆菌(Lactobacillus reuteri)和植物乳杆菌(Lactobacillus plantarum)产生SLP还鲜见相关报道。(本文来源于《湖南农业大学》期刊2010-06-01）
陶小平,李磊,李强,韩小霞,邢俊杰[6]（2008）在《优化菌落原位杂交体系筛选野生稻基因组文库》一文中研究指出菌落原位杂交仍是当今筛选基因组文库的重要方法之一,但难以保持背景清晰和阳性杂交点明显的稳定的杂交体系.通过对杂交膜不同处理方法的对比,表明利用溶菌酶处理杂交体系进行菌落原位杂交筛选,其杂交结果背景较干净,且能根据杂交信号的强弱很清晰地显色阳性黑点.采用该法筛选野生稻基因组文库,已筛选出22个阳性克隆,并测序分析均为阳性克隆.(本文来源于《生命科学研究》期刊2008年04期）
战爱斌,胡景杰,胡晓丽,王明玲,彭薇[7]（2008）在《富集文库—菌落原位杂交法筛选栉孔扇贝的微卫星标记》一文中研究指出应用微卫星富集文库—菌落原位杂交法,筛选得到了40个栉孔扇贝的微卫星标记。用固定了(AG)15和(AC)15探针的尼龙膜(Hybond N+)捕捉含有微卫星DNA的片段,经洗脱、PCR扩增和TA克隆,构建栉孔扇贝的微卫星富集文库。利用ECL试剂盒(Amersham公司)标记的(AG)15和(AC)15探针进行菌落原位杂交筛选微卫星富集文库,阳性克隆经测序获得微卫星DNA。富集文库中1200个重组克隆经过菌落原位杂交后,532个(44.3%)为阳性克隆。任意挑选100个克隆测序,结果显示所有的克隆都至少含有一个微卫星位点。利用软件设计了65对特异性PCR引物,40对能扩增出清晰的带谱;利用48个栉孔扇贝个体评价微卫星位点,分析表明37个位点具有多态性。不同的位点获得的等位基因数目为2~14个不等,37个多态性位点共获得258个等位基因,平均每个位点获得7.0个等位基因。观测杂合度(Ho)、期望杂合度(He)及多态性信息含量值(PIC)的范围分别为0.1000~1.0000、0.1197~0.9831和0.1172~0.9782。结果表明,富集文库—菌落原位杂交法适合大规模筛选目标物种的微卫星标记。(本文来源于《水产学报》期刊2008年03期）
戴蕾,沈瀚,宁明哲[8]（2008）在《菌落原位杂交法检测Ⅰ类整合子的影响因素研究》一文中研究指出目的探讨菌落原位杂交法检测革兰阴性菌中Ⅰ类整合子的影响因素,并优化该方法。方法制备Ⅰ型整合酶基因的特异性探针,采用不同试验条件下的菌落原位杂交法检测革兰阴性菌中的型整合酶基因,并与PCR扩增法的检测结果比较。结果不同试验条件下的菌落原位杂交法检测整合子的结果不一致。结论载体膜的选择,封闭剂的选用,杂交的时间和温度的设定等均对菌落原位杂交法检测整合子结果产生影响,应根据试验要求优化杂交体系,保证试验的准确性。(本文来源于《现代检验医学杂志》期刊2008年03期）
沈瀚,童明庆,戴蕾,顾兵,宁明哲[9]（2006）在《菌落原位杂交法检测革兰阴性菌Ⅰ类整合子的研究》一文中研究指出目的用菌落原位杂交法检测革兰阴性菌中Ⅰ类整合子。方法制备Ⅰ型整合酶基因的特异性探针,采用菌落原位杂交法检测革兰阴性菌中的Ⅰ型整合酶基因,并与PCR的检测结果比较。结果40株多重耐药的革兰阴性菌中,经菌落原位杂交法检测出有18株含Ⅰ类整合子,另外22株杂交结果阴性,与PCR法检测结果一致。结论菌落原位杂交法可替代PCR法检测革兰阴性菌Ⅰ型整合酶基因。(本文来源于《临床检验杂志》期刊2006年05期）
胡永浩,汪清,赵晋军,宗瑞谦,蒋正军[10]（1998）在《改良菌落原位杂交技术快速筛选NDVF基因阳性克隆株》一文中研究指出应用从表达型质粒载体构建的ＮＤＶＦ基因文库中筛选阳性克隆株的改良融合蛋白质抗体蛋白质原位杂交技术，可使菌落在硝酸纤维素薄膜上增殖，经适当处理后，即可用特异性抗体探针进行原位筛选，获得含目的基因编码的特异抗原蛋白的阳性克隆株。(本文来源于《中国兽医科技》期刊1998年11期）
菌落原位杂交论文开题报告
（1）论文研究背景及目的
此处内容要求：
首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景，再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题，并提出你的论文准备的观点或解决方法。
写法范例：
菌落原位杂交法是重组DNA技术中最常用的方法之一,但该方法存在着杂交背景复杂及杂交结果不稳定性等缺点,所以进一步优化杂交体系显得尤为迫切。本研究通过优化杂交体系,最终确定利用溶菌酶处理杂交膜和采用非严紧型洗脱方式洗膜,不仅使得杂交体系的杂交结信号清晰,而且杂交背景较干净。研究结果表明,在探针特异性好的基础上,采用优化的菌落原位杂交体系筛选特定菌种是可行的。
（2）本文研究方法
调查法：该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。
观察法：用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。
实验法：通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。
文献研究法：通过调查文献来获得资料，从而全面的、正确的了解掌握研究方法。
实证研究法：依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。
定性分析法：对研究对象进行“质”的方面的研究，这个方法需要计算的数据较少。
定量分析法：通过具体的数字，使人们对研究对象的认识进一步精确化。
跨学科研究法：运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。
功能分析法：这是社会科学用来分析社会现象的一种方法，从某一功能出发研究多个方面的影响。
模拟法：通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。
菌落原位杂交论文参考文献
[1].丁海燕,冯伟,李凌智,黄永红,张虹.菌落原位杂交技术在环境微生物检测中的应用[J].安徽农业科学.2015
[2].刘超兰,王海英,李文芳,张文学,赖登燡.菌落原位杂交法筛选特定菌种的方法初探[J].酿酒科技.2013
[3].吕欣,彭霞薇,呼庆,马安周,江泽平.利用DGGE-菌落原位杂交法分离土壤中精喹禾灵降解菌[J].环境科学.2013
[4].卢超,包振民,彭薇,鄢婧婧,吕雅萌.富集文库-菌落原位杂交法筛选仿刺参微卫星标记[J].中国海洋大学学报(自然科学版).2010
[5].刘元元.利用菌落原位杂交技术进行乳酸杆菌SLP基因的筛选[D].湖南农业大学.2010
[6].陶小平,李磊,李强,韩小霞,邢俊杰.优化菌落原位杂交体系筛选野生稻基因组文库[J].生命科学研究.2008
[7].战爱斌,胡景杰,胡晓丽,王明玲,彭薇.富集文库—菌落原位杂交法筛选栉孔扇贝的微卫星标记[J].水产学报.2008
[8].戴蕾,沈瀚,宁明哲.菌落原位杂交法检测Ⅰ类整合子的影响因素研究[J].现代检验医学杂志.2008
[9].沈瀚,童明庆,戴蕾,顾兵,宁明哲.菌落原位杂交法检测革兰阴性菌Ⅰ类整合子的研究[J].临床检验杂志.2006
[10].胡永浩,汪清,赵晋军,宗瑞谦,蒋正军.改良菌落原位杂交技术快速筛选NDVF基因阳性克隆株[J].中国兽医科技.1998