史晓丽:中国对虾甘氨酸脱羧酶的基因克隆、表达及其与抗WSSV的关联分析论文

史晓丽:中国对虾甘氨酸脱羧酶的基因克隆、表达及其与抗WSSV的关联分析论文

本文主要研究内容

作者史晓丽,张莹雪,孟宪红,孔杰,栾生,罗坤,曹宝祥,曹家旺,陈宝龙(2019)在《中国对虾甘氨酸脱羧酶的基因克隆、表达及其与抗WSSV的关联分析》一文中研究指出:本研究采用RACE技术克隆获得中国对虾(Fenneropenaeuschinensis)甘氨酸脱羧酶基因(Fc GLDC)的全长cDNA及DNA序列,并对其进行生物信息学分析。结果显示,FcGLDC基因的cDNA全长为3481 bp,其中,ORF为2829 bp,5¢UTR长17 bp,3¢UTR长86 bp。完整的阅读框编码942个氨基酸,分子量为104.66 kDa,预测的理论等电点为6.51。FcGLDC基因DNA序列全长共4964bp,包含12个外显子和11个内含子。同源性及系统进化分析显示,FcGLDC基因与节肢动物的GLDC基因聚为一类;氨基酸序列比对发现,Fc GLDC基因的蛋白序列与节肢动物的相似度最高,与内华达白蚁(Zootermopsis nevadensis)、体虱(Pediculus humanus corporis)和白纹伊蚊(Aedes albopictus)的相似度分别为71%、68%和68%。在鳃、肝胰腺和肌肉中的荧光定量PCR结果显示,FcGLDC在肌肉中的相对表达量最高,鳃中最低。WSSV感染后,该基因在鳃、肝胰腺和肌肉中呈现出了不同的时空表达特点。使用直接测序法结合质谱法,在该基因内部发现4个SNP位点,但是各位点与抗WSSV性状均不相关(P>0.05)。本研究表明,FcGLDC基因在对虾感染WSSV后的应答反应中或起一定作用。

Abstract

ben yan jiu cai yong RACEji shu ke long huo de zhong guo dui ha (Fenneropenaeuschinensis)gan an suan tuo suo mei ji yin (Fc GLDC)de quan chang cDNAji DNAxu lie ,bing dui ji jin hang sheng wu xin xi xue fen xi 。jie guo xian shi ,FcGLDCji yin de cDNAquan chang wei 3481 bp,ji zhong ,ORFwei 2829 bp,5¢UTRchang 17 bp,3¢UTRchang 86 bp。wan zheng de yue dou kuang bian ma 942ge an ji suan ,fen zi liang wei 104.66 kDa,yu ce de li lun deng dian dian wei 6.51。FcGLDCji yin DNAxu lie quan chang gong 4964bp,bao han 12ge wai xian zi he 11ge nei han zi 。tong yuan xing ji ji tong jin hua fen xi xian shi ,FcGLDCji yin yu jie zhi dong wu de GLDCji yin ju wei yi lei ;an ji suan xu lie bi dui fa xian ,Fc GLDCji yin de dan bai xu lie yu jie zhi dong wu de xiang shi du zui gao ,yu nei hua da bai yi (Zootermopsis nevadensis)、ti shi (Pediculus humanus corporis)he bai wen yi wen (Aedes albopictus)de xiang shi du fen bie wei 71%、68%he 68%。zai sai 、gan yi xian he ji rou zhong de ying guang ding liang PCRjie guo xian shi ,FcGLDCzai ji rou zhong de xiang dui biao da liang zui gao ,sai zhong zui di 。WSSVgan ran hou ,gai ji yin zai sai 、gan yi xian he ji rou zhong cheng xian chu le bu tong de shi kong biao da te dian 。shi yong zhi jie ce xu fa jie ge zhi pu fa ,zai gai ji yin nei bu fa xian 4ge SNPwei dian ,dan shi ge wei dian yu kang WSSVxing zhuang jun bu xiang guan (P>0.05)。ben yan jiu biao ming ,FcGLDCji yin zai dui ha gan ran WSSVhou de ying da fan ying zhong huo qi yi ding zuo yong 。

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  • 论文详细介绍

    论文作者分别是来自渔业科学进展的史晓丽,张莹雪,孟宪红,孔杰,栾生,罗坤,曹宝祥,曹家旺,陈宝龙,发表于刊物渔业科学进展2019年02期论文,是一篇关于中国对虾论文,甘氨酸脱羧酶论文,基因克隆论文,表达论文,关联分析论文,渔业科学进展2019年02期论文的文章。本文可供学术参考使用,各位学者可以免费参考阅读下载,文章观点不代表本站观点,资料来自渔业科学进展2019年02期论文网站,若本站收录的文献无意侵犯了您的著作版权,请联系我们删除。

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