生物信息系统论文-夏苗芬,周双林

生物信息系统论文-夏苗芬,周双林

导读:本文包含了生物信息系统论文开题报告文献综述及选题提纲参考文献,主要关键词:生物信息学,系统药理学,斑蝥,药理分子机制

生物信息系统论文文献综述

夏苗芬,周双林[1](2019)在《基于生物信息学与系统药理学的斑蝥药理分子机制研究》一文中研究指出目的:通过生物信息学和系统药理学方法、数据库和工具初步探讨斑蝥有效成分的药理作用的分子机制。方法:利用中药系统药理学分析平台(TCMSP)数据库获取斑蝥中有效成分及其有效成分的潜在靶标,并进一步获取这些靶标对应的疾病;运用网络可视化软件,构建斑蝥有效成分-靶点-疾病相互作用网络;借助DAVID工具进行斑蝥靶标群作用的生物学功能(GO分析)和信号通路的富集分析(KEGG分析),并运用OmicShare网络工具进行可视化;制作并分析斑蝥靶标的蛋白质相互作用(PPI)网络,将其GO分析结果可视化。结果:斑蝥主要相关疾病有癌症/肿瘤、炎症与感染、神经系统类、心血管类和代谢类;GO分析结果表明斑蝥主要通过类固醇激素介导的信号通路、腺苷酸环化酶调节G蛋白偶联受体信号通路、细胞增殖等作用发挥生物学功能;信号通路富集结果表明斑蝥主要作用蛋白与神经活性配体-受体相互作用、钙信号通路、PI3K-Akt信号通路等多途径发挥其药理作用;通过蛋白质相互作用,斑蝥靶标还可以影响来自RNA聚合酶Ⅱ启动子的转录起始、细胞内受体信号通路等生物学过程。结论:本研究结果与已有的斑蝥药理机制和应用是一致的,且更丰富。这能为进一步揭示和完善斑蝥的分子药理作用机制、开发新药和发现可能的新用法等提供指导。(本文来源于《中医药导报》期刊2019年20期)

师舷,刘佳璐,董极靓,吴亚多,权春善[2](2019)在《解淀粉芽孢杆菌Q426双组分信号转导系统的生物信息学分析》一文中研究指出[目的]分析解淀粉芽孢杆菌(Bacillus amyloliquefaciens)双组分信号转导系统(Two-Component Signal Transduction System,TCS)的结构、功能和分布,为挖掘解淀粉芽孢杆菌的生物功能、开发其商业价值提供理论依据。[方法]采用生物信息学方法,系统分析了由笔者实验室分离得到并完成全基因组测序的解淀粉芽孢杆菌Q426的TCS。[结果]Q426菌株所携带的HKs和RRs分别为42和40,其中成对的TCS(HK-RR)数为19,杂合的TCS(Hybrid)为1,而HKs和RRs分别为22和20,并对19对TCS中15对的生物学功能做出预测。[结论]Q426菌株的TCS涉及杆菌肽、羊毛硫抗生素和多种抗菌肽的合成,为深入研究解淀粉芽孢杆菌抗菌活性物质的合成与调控提供思路。(本文来源于《生物技术》期刊2019年04期)

刘欢,冀伟[3](2019)在《肿瘤生物信息管理系统的设计开发》一文中研究指出本文构建肿瘤生物信息管理系统,在线对癌症基因检测参数进行显示、检测、控制及网络监控,将准确、高效的全自动化高通测序数据作为生物信息管理系统的分析技术核心,同时结合好计算机管理系统、在线监控系统,实现为肿瘤患者提供最有效的科学诊疗方案的需求。(本文来源于《电子技术与软件工程》期刊2019年12期)

刘欢,刘志明[4](2019)在《癌症临床和生物信息管理系统的设计与运用》一文中研究指出癌症是威胁人体健康与寿命的重要因素,目前癌症临床和生物信息管理系统建设已成为国际医疗行业发展的重要趋势。以吉林建筑大学经济与管理学院数据处理和信息化工程建设项目为例,阐述癌症临床和生物信息管理系统设计要点,分析信息管理系统应用过程,期望有利于癌症临床和生物信息管理系统建设,推动现代医疗行业的进一步发展。(本文来源于《信息与电脑(理论版)》期刊2019年11期)

吴耀群[5](2019)在《关于微生物在线生物信息分析系统的开发及运用》一文中研究指出应用浏览器或者服务器创建微生物在线分析系统,可以用于传染病的预防与控制,系统开发中将分析软件、远程桌面以及分布式运算等运行方案结合,使系统无需本地安装,能够通过浏览器直接使用。文章分析了微生物在线分析系统开发时需要的软件资料和应用技术,结合实际情况探究系统实践与应用的有效结果。(本文来源于《无线互联科技》期刊2019年11期)

徐勇,冀伟,刘欢[6](2019)在《探究生物信息资源管理系统的设计与实现》一文中研究指出随着经济的快速发展,科技不断进步。现代科技发展逐渐成熟的当代,信息平台日益增多的情况下,信息资源巨量增长,如何有效应用信息成为当前不断深化研究的命题。基于此,分析生物信息资源管理系统的设计及实现,阐述其在癌症基因检测与靶向诊疗多元信息管理系统项目中的应用,以期为未来各行业信息管理系统的构建提供借鉴。(本文来源于《信息与电脑(理论版)》期刊2019年10期)

岳雪,王帅,李大成,王勇健,董惠钧[7](2019)在《野野村放线菌ATCC 39727的双组份信号转导系统的生物信息学分析》一文中研究指出双组份信号转导系统是放线菌中重要的全局调控系统之一,参与细胞形态分化、氮磷代谢、次级代谢产物合成和其他生理代谢过程。本文采用生物信息学方法系统分析了Nonomuraea sp.中双组份信号转导系统(two-component signal transduction system, TCS)的分布、系统分类、结构与功能,初步构建了部分TCS调控网络,旨在揭示Nonomuraea sp.中次级代谢产物合成与TCS之间的关系,为提高糖肽抗生素A40926效价和发现新的潜在生物活性物质奠定基础。(本文来源于《中国抗生素杂志》期刊2019年04期)

高鹏彪[8](2019)在《人体生物信息的检测与健康监测系统的应用》一文中研究指出目前,我国人民对健康医疗方面的需求和没有良好的健康维护设备之间的矛盾是我国当代医疗领域的主要矛盾,因此开发一种智能、便捷的智慧医疗系统是非常迫切和必要的。人们能够通过此系统随时对身体健康状态进行检测,并及时将这些生理信息数据发送给医生进行身体健康评估。使用者通过可穿戴的便携式健康监测系统随时了解自身的健康状况并将健康状况实时分享,结合现代科技和医学有效预防、诊断常见疾病。智慧医疗的出现和发展正将医疗简单化、智能化和便携化,采用微型化设备并配备高效的数据运算处理能力,通过互联网技术将信息传递和共享给医疗信息平台,实现患者和医生的实时交互,使人们可以方便地进行身体健康信息检测并及时得到医生的诊断反馈。本文设计并实现了一种方便穿戴、检测精准、操作简便的健康监测系统。手机移动端通过蓝牙模块与检测设备之间进行无线通信,控制设备随时对人体血压、心率、体温、体脂率和腕部脉象等生物信息状态进行检测,检测结果经过系统处理后及时反馈至手机移动端。系统不仅实现自己对身体健康的实时监测,而且能为医生诊断病情提供准确有效的诊断依据。本文的独特性工作包括:1、检测功能集成化,可检测人体的血压、体温、心率、体脂率和脉象波形等生物信息参数。2、本系统可将检测到的人体生物信息上传至手机移动端,实现个人身体健康实时监测并为医生诊断病情提供准确的诊断依据。3、本系统中的人体脉象信息检测功能可以测量出中医脉象中的浮沉、力度等参数。4、本系统中的人体脉象信息检测功能和血压、心率检测功能共用一种可穿戴的柔性薄膜压力传感器,有效提取脉象波形并根据脉搏动态信息计算出人体血压和心率。5、体脂率检测功能中,在单频点小阻抗范围下采用标定电阻阻值与对应的阻抗模值的特定关系计算出人体的体脂率,较传统增益系数校准方式不仅减小体脂率检测误差而且提高系统的稳定性。经过理论分析和实验验证,本系统采集的人体血压、心率、体温、体脂率和腕部脉象等基本生物信息的结果误差范围小,具有测量精准、携带方便等特点并通过蓝牙与手机客户端通讯实现远程控制和监测,在未来医学检测领域可与云平台、大数据分析等无缝接轨,使传统医疗设备越来越智能化、微型化和简便化。另外,本系统的腕部脉搏动态信息检测技术可应用于判断人体脉象浮沉、力度、粗细、长短等特征,为实现中医自动诊脉技术和互联网医疗具有很强的理论研究价值和实际应用意义。(本文来源于《吉林大学》期刊2019-05-01)

王霞,王廷璞,王弋博,赵天宇[9](2019)在《肺炎克雷白杆菌Ⅱ型分泌系统GspD-k生物信息学分析》一文中研究指出Ⅱ型分泌系统(T2SS)广泛存在致病菌革兰氏阴性细菌中并负责周质到细胞外的蛋白分泌。肺炎克雷白杆菌(Klebsiella pneumoniae)属于肠杆菌科克雷白菌属,是一种常见的革兰氏阴性致病菌。本研究通过生物信息学的方法,对肺炎克雷白杆菌T2SS组分GspD-k基因及其蛋白序列进行一系列结构和功能分析。结果表明GspD-k为较稳定的蛋白,含有信号肽序列,是一种分泌蛋白,并存在于细胞外膜上。二级结构预测表明GspD-k蛋白中的二级结构主要有叁种,即α-螺旋,β-折迭和无规则Loop环。(本文来源于《天水师范学院学报》期刊2019年02期)

方天逸,王宇夫,林轩,王志东,崔云甫[10](2019)在《常见消化系统肿瘤CD177及相关基因表达与意义的生物信息学分析》一文中研究指出目的探讨嗜中性粒细胞抗原CD177在常见消化系统恶性肿瘤(食管癌、结肠癌和胰腺癌)中的表达情况与患者预后的关系,并分析与其相关的基因和细胞通路。方法自公共数据库Gene Expression Omnibus(GEO)及The Cancer Genome Atlas(TCGA)中提取相应癌症数据集,以获取患者信息及mRNA表达数据,借助R2生物信息分析平台,以Kaplan-Meier法绘制生存曲线,分析CD177表达情况与患者预后的关系,筛选出与CD177表达显着相关的基因并进行Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes(KEGG)通路分析。结果在3种癌症数据集中(食管癌75例,结肠癌174例,胰腺癌132例),CD177的mRNA高表达患者的总体生存率均低于低表达患者(P=0.050,P=0.045,P=0.018)。此外,与CD177表达相关的基因在3个数据集中分别有11 927、4 100和7 493个。KEGG通路分析发现,CD177高表达时除正常消化功能的信号通路被激活外,还涉及多种炎性反应机制相关的信号通路。结论 CD177的表达水平与食管癌、结肠癌和胰腺癌患者的总体生存率相关,可能成为研究患者预后的潜在分子标志物。(本文来源于《实用肿瘤杂志》期刊2019年02期)

生物信息系统论文开题报告

(1)论文研究背景及目的

此处内容要求:

首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景,再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题,并提出你的论文准备的观点或解决方法。

写法范例:

[目的]分析解淀粉芽孢杆菌(Bacillus amyloliquefaciens)双组分信号转导系统(Two-Component Signal Transduction System,TCS)的结构、功能和分布,为挖掘解淀粉芽孢杆菌的生物功能、开发其商业价值提供理论依据。[方法]采用生物信息学方法,系统分析了由笔者实验室分离得到并完成全基因组测序的解淀粉芽孢杆菌Q426的TCS。[结果]Q426菌株所携带的HKs和RRs分别为42和40,其中成对的TCS(HK-RR)数为19,杂合的TCS(Hybrid)为1,而HKs和RRs分别为22和20,并对19对TCS中15对的生物学功能做出预测。[结论]Q426菌株的TCS涉及杆菌肽、羊毛硫抗生素和多种抗菌肽的合成,为深入研究解淀粉芽孢杆菌抗菌活性物质的合成与调控提供思路。

(2)本文研究方法

调查法:该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。

观察法:用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。

实验法:通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。

文献研究法:通过调查文献来获得资料,从而全面的、正确的了解掌握研究方法。

实证研究法:依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。

定性分析法:对研究对象进行“质”的方面的研究,这个方法需要计算的数据较少。

定量分析法:通过具体的数字,使人们对研究对象的认识进一步精确化。

跨学科研究法:运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。

功能分析法:这是社会科学用来分析社会现象的一种方法,从某一功能出发研究多个方面的影响。

模拟法:通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。

生物信息系统论文参考文献

[1].夏苗芬,周双林.基于生物信息学与系统药理学的斑蝥药理分子机制研究[J].中医药导报.2019

[2].师舷,刘佳璐,董极靓,吴亚多,权春善.解淀粉芽孢杆菌Q426双组分信号转导系统的生物信息学分析[J].生物技术.2019

[3].刘欢,冀伟.肿瘤生物信息管理系统的设计开发[J].电子技术与软件工程.2019

[4].刘欢,刘志明.癌症临床和生物信息管理系统的设计与运用[J].信息与电脑(理论版).2019

[5].吴耀群.关于微生物在线生物信息分析系统的开发及运用[J].无线互联科技.2019

[6].徐勇,冀伟,刘欢.探究生物信息资源管理系统的设计与实现[J].信息与电脑(理论版).2019

[7].岳雪,王帅,李大成,王勇健,董惠钧.野野村放线菌ATCC39727的双组份信号转导系统的生物信息学分析[J].中国抗生素杂志.2019

[8].高鹏彪.人体生物信息的检测与健康监测系统的应用[D].吉林大学.2019

[9].王霞,王廷璞,王弋博,赵天宇.肺炎克雷白杆菌Ⅱ型分泌系统GspD-k生物信息学分析[J].天水师范学院学报.2019

[10].方天逸,王宇夫,林轩,王志东,崔云甫.常见消化系统肿瘤CD177及相关基因表达与意义的生物信息学分析[J].实用肿瘤杂志.2019

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