本文主要研究内容
作者肖亮,尚小红,曹升,谢向誉,曾文丹,严华兵（2019）在《基于转录组测序的葛根SSR标记研究与利用（英文）》一文中研究指出：该研究以‘桂粉葛1号’为材料,通过转录组测序的方法测得8.9Gb clean reads,组装成137 629个转录本,最终得到83 811个Unigene序列。进化树分析表明,葛根和苜蓿、花生聚为一支。用MISA软件在83 811个序列中检测到25 452个简单重复序列(SSR)位点,三核苷酸重复的SSR数量最多,其次是二核苷酸重复。三核苷酸重复中,(AAG)n是最普遍的重复单元(27.87%)。共设计了229对SSR引物,其中28对引物可以产生清晰的条带和丰富的多态性,被用于检测44份葛根资源的遗传多样性。在44个葛根资源的基因组DNA中共扩增出90个片段,其中89个条带有多态性,平均等位基因数为3.178 6。多态性信息量范围为0.083 0～0.774 2(平均数为0.4557)。聚类分析显示遗传相似性系数范围为0.266 7～1.000 0。这些结果提示所检测的葛根资源在DNA分子水平存在着丰富的遗传多样性。当阈值为0.58时,44个资源可以划分为2个类群,且44份资源的类群划分与地理来源之间没有直接关系,但这些标记将是葛根遗传多样性研究可用的基因组资源。
Abstract
gai yan jiu yi ‘gui fen ge 1hao ’wei cai liao ,tong guo zhuai lu zu ce xu de fang fa ce de 8.9Gb clean reads,zu zhuang cheng 137 629ge zhuai lu ben ,zui zhong de dao 83 811ge Unigenexu lie 。jin hua shu fen xi biao ming ,ge gen he mu xu 、hua sheng ju wei yi zhi 。yong MISAruan jian zai 83 811ge xu lie zhong jian ce dao 25 452ge jian chan chong fu xu lie (SSR)wei dian ,san he gan suan chong fu de SSRshu liang zui duo ,ji ci shi er he gan suan chong fu 。san he gan suan chong fu zhong ,(AAG)nshi zui pu bian de chong fu chan yuan (27.87%)。gong she ji le 229dui SSRyin wu ,ji zhong 28dui yin wu ke yi chan sheng qing xi de tiao dai he feng fu de duo tai xing ,bei yong yu jian ce 44fen ge gen zi yuan de wei chuan duo yang xing 。zai 44ge ge gen zi yuan de ji yin zu DNAzhong gong kuo zeng chu 90ge pian duan ,ji zhong 89ge tiao dai you duo tai xing ,ping jun deng wei ji yin shu wei 3.178 6。duo tai xing xin xi liang fan wei wei 0.083 0～0.774 2(ping jun shu wei 0.4557)。ju lei fen xi xian shi wei chuan xiang shi xing ji shu fan wei wei 0.266 7～1.000 0。zhe xie jie guo di shi suo jian ce de ge gen zi yuan zai DNAfen zi shui ping cun zai zhao feng fu de wei chuan duo yang xing 。dang yu zhi wei 0.58shi ,44ge zi yuan ke yi hua fen wei 2ge lei qun ,ju 44fen zi yuan de lei qun hua fen yu de li lai yuan zhi jian mei you zhi jie guan ji ,dan zhe xie biao ji jiang shi ge gen wei chuan duo yang xing yan jiu ke yong de ji yin zu zi yuan 。
论文参考文献
论文详细介绍
论文作者分别是来自西北植物学报的肖亮,尚小红,曹升,谢向誉,曾文丹,严华兵，发表于刊物西北植物学报2019年01期论文，是一篇关于标记论文,资源收集论文,遗传多样性论文,西北植物学报2019年01期论文的文章。本文可供学术参考使用，各位学者可以免费参考阅读下载，文章观点不代表本站观点，资料来自西北植物学报2019年01期论文网站，若本站收录的文献无意侵犯了您的著作版权，请联系我们删除。
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