克隆策略论文-熊科,崔晓亭,王小艺,赵峙尧,柳佳芸

克隆策略论文-熊科,崔晓亭,王小艺,赵峙尧,柳佳芸

导读:本文包含了克隆策略论文开题报告文献综述及选题提纲参考文献,主要关键词:土壤微生物,宏基因组文库,木聚糖酶,酶学性质

克隆策略论文文献综述

熊科,崔晓亭,王小艺,赵峙尧,柳佳芸[1](2019)在《基于宏基因策略的新颖木聚糖酶基因cbxynA克隆及其重组酶酶学性质》一文中研究指出研究构建了库容量约为1.3×104个克隆子且外源片段的总长为30 Mb的土壤宏基因组文库。基于功能策略,从文库中筛选到分解木聚糖底物的阳性克隆子。该克隆经序列分析发现一个822 bp的潜在的编码木聚糖酶基因(cbxynA)的开放阅读框,其编码的氨基酸序列与来自古细菌属编码的木聚糖酶的相似度最高仅为45%,说明该序列为一条未知的新序列。cbxynA在大肠杆菌中的重组表达产物的分子质量为29 ku,与预测结果一致。对其原核表达条件进行优化,结果表明:质粒在培养5 h后加入0.7 mmol/L IPTG,23℃下诱导25 h后表达,木聚糖酶活力为52 U/mL,较初始值提高4.3倍。而重组酶(CBXYNA)最适pH和最适温度分别为5.2和55℃。金属离子Na+、K+、Li+、Ca2+能提高该酶的酶活,而另外一些金属离子如Mg2+、Mn2+、Zn2+、Fe3+、Al3+、Cu2+能抑制其活性。该酶以水溶性玉米芯木聚糖、燕麦木聚糖、水不溶性木聚糖为底物时,其相对酶活力分别为162%,139%,74%。(本文来源于《中国食品学报》期刊2019年09期)

焦亮,刘雪蕊,王圣杰,董小刚[2](2019)在《敦煌阳关湿地芦苇克隆构件空间拓展策略及其对土壤环境因子的响应》一文中研究指出空间拓展是克隆植物响应环境的生态适应和权衡维度,以内陆盐沼湿地典型代表敦煌阳关国家级自然保护区内的芦苇(Phragmites australis)为研究对象,基于水库距离远近和芦苇种群的密度与盖度,设置了近水区(500 m)、过渡区(1500 m)、荒漠区(2500 m)3个不同的采样梯度,研究了环境异质条件下芦苇克隆构件空间拓展策略及其对土壤环境因子的响应。结果表明:(1)芦苇克隆构件在异质环境条件下差异显着,初级根茎条数、根茎节间长、间隔子长、分枝角度呈现"同增同涨"的协同进化关系(P<0.01),而与分株数呈现"此消彼长"的权衡关系(P<0.01)。(2)且随着种群的密度降低,芦苇在空间拓展过程中呈现从"密集型"转"游击型"的生存策略。(3)冗余分析显示土壤水分、pH值、盐分是克隆构件空间拓展的主要驱动力,其中各层土壤水分、深层土壤pH值和盐分是芦苇空间拓展最重要的环境因子。明晰内陆河湿地芦苇克隆构件空间拓展策略及主要的环境驱动力,能为干旱脆弱敏感区湿地保护和生态恢复提供借鉴意义。(本文来源于《生态学报》期刊2019年14期)

翟志波,宋光婕[3](2019)在《基于双种群进化策略的教与学-免疫克隆多目标进化算法》一文中研究指出目的用基于双种群进化策略的教与学-免疫克隆多目标进化算法(multi-objective teaching-learning-based optimization with immune clone algorithm, MTLBO-ICA),解决无约束多目标优化问题。方法将局部搜索能力强的免疫克隆算法(immune clone algorithm, ICA)与全局搜索能力强的教与学优化算法(teaching-learning-based optimization,TLBO)算法相结合;采用Pareto交叉算子,使得优秀个体基因尽可能得到保留;采用Pareto支配的策略,将种群分为非支配个体和支配个体。结果相比于经典的多目标优化算法NSGA-II,SPEA2以及MOTLBO,MTLBO-ICA算法得到的Pareto曲线与真实Pareto曲线拟合的比较好。结论 MTLBO-ICA在收敛性和分散性方面都有很好的表现,能有效解决无约束多目标进化问题。(本文来源于《宝鸡文理学院学报(自然科学版)》期刊2019年02期)

陈芳,王兰,张左兵[4](2019)在《基于密码子优化策略的斑马鱼FOXP3A分子的原核表达及多克隆抗血清制备》一文中研究指出目的:构建斑马鱼FOXP3A融合蛋白的原核表达系统,诱导表达并制备多克隆抗血清。方法:选取斑马鱼foxp3a基因cDNA的894 bp特异区段(s-foxp3a),对该片段进行密码子优化后构建原核表达载体pET-32a-s-foxp3a,转化大肠杆菌BL21(DE3),诱导表达斑马鱼S-FOXP3A-His融合蛋白并纯化,纯化后的蛋白免疫家兔,制备斑马鱼FOXP3A蛋白的多克隆抗血清,4次免疫后取血清,采用间接ELISA法检测抗血清效价。结果:在16℃经0.5 mmol/LIPTG诱导10 h的条件下,SDS-PAGE分析表明斑马鱼S-FOXP3A-His融合蛋白以包涵体形式产生;间接ELISA检测结果显示,FOXP3A蛋白多克隆抗血清的效价在1.6×10~5以上。结论:制备了高效价的斑马鱼FOXP3A多克隆抗血清,为进一步解析斑马鱼FOXP3A蛋白的功能提供了基础工具。(本文来源于《生物技术通讯》期刊2019年01期)

窦怀乾,李仰平,吕佳,窦锦壮,李语丽[5](2019)在《基于WGP物理作图法的虾夷扇贝Fosmid克隆混池策略及解码率研究》一文中研究指出利用全基因组解析(Whole genome profiling,WGP)法进行物理图谱构建时,克隆混池策略及克隆解码率的高低是影响物理图谱构建效果的关键性因素。如何通过调控混合克隆数目,来平衡克隆解码率和测序的成本,是利用WGP法构建物理图谱的亟需解决的问题。本研究利用虾夷扇贝Fosmid文库的部分克隆,使用序列特异性标签的WGP方法,对虾夷扇贝物理图谱构建方法的混池策略及克隆解码率进行了初步研究。通过计算机分别模拟了384 N(N=1,2…24)孔培养板内的克隆混合,计算出了对应混合尺度下BsaXI和FspEI两种酶的克隆解码率。以该模拟数据作为参照,最终分别以4、8、12、16张384孔培养板内的克隆混合构建了克隆超级池;并利用2b-RAD技术构建了基于BsaXI和FspEI两种限制性内切酶的测序文库。通过对酶切标签数据的分析,成功实现了混合池内的克隆解码,且在利用两种酶对应的酶切标签联合解码后,联合解码率达到84%以上。本研究最终确定了由8张384孔培养板混合的混池策略及利用BsaXI和FspEI两种酶切标签进行联合克隆解码,为后期利用WGP方法构建虾夷扇贝物理图谱提供了参考方案。(本文来源于《中国海洋大学学报(自然科学版)》期刊2019年02期)

刘燕茹,石继飞,罗利霞[6](2018)在《一种基于均匀设计原理的自适应克隆选择分子对接构像搜索策略》一文中研究指出为提高分子对接精度与速度,设计且实现了基于均匀设计原理的自适应克隆选择自动分子对接搜索策略。该策略首先引入抗体浓度,用抗体浓度和最低结合自由能共同衡量抗体品质;并利用均匀设计原理设计了克隆选择算法各参数的组合式样;然后利用自适应的克隆增殖、自适应的变异以及自适应的重组算子替代了克隆选择、高频变异以及简单重组算子。为验证该对接方法的有效性,用此方法对布克海文蛋白质数据库中的6种蛋白质—配体复合物进行实验测试,并将实验结果与拉马克遗传算法、模拟退火算法、免疫遗传算法和简单克隆选择算法进行比较,实验表明该对接策略具有更快的收敛速度和更好的寻优能力。(本文来源于《中国医学物理学杂志》期刊2018年07期)

施蕾,林洁平,廖淑珍,招春飞,刘华锋[7](2018)在《从鼠源到全人源单克隆抗体制备技术及改造策略的研究进展》一文中研究指出单克隆抗体(单抗)因其专一性、高效价、低耐药性等显着优势,已成为生物制药业行业发展最快的领域之一,并成功用于治疗多种癌症、自身免疫病和其他疾病等。从最初的鼠源性单抗发展至现今的全人源单抗,新的制备技术不断涌现,如单细胞分选和测序技术等。同时,通过改变全人源单抗的糖基化水平、优化单抗亲和力成熟技术等,有助于进一步提高其稳定性、亲和力。目前,全人源单抗的疗效和安全性仍受到行业关注,也面临很多挑战,如何平衡在降低其免疫原性的同时,进一步提高其亲和力等,仍寄希望于新的技术或策略。(本文来源于《中国实验动物学报》期刊2018年04期)

权佳馨[8](2018)在《异质性铅污染环境中克隆植物的生境选择策略》一文中研究指出克隆植物是植物界中的一大类群。生境选择行为是物种在长期的进化适应过程中与环境互作的产物。前人的一些研究表明异质性环境中的克隆植物能够对其生境做出选择,从而更有效的利用资源并克服斑块环境的胁迫,提高其整体适合度。但大多数的相关研究侧重于资源环境中克隆植物的生境选择模式,且其选择的机制仍不清楚,而异质的毒性环境中克隆植物生境选择研究有助于我们充分了解克隆植物选择性定植模式的机制。本研究将克隆植物蛇莓置于不同异质性的铅污染环境中,通过两组实验,在弄清“Pb污染环境中克隆整合对蛇莓生长作用”的基础上,探索“异质性Pb污染的毒性环境中克隆植物的生境选择策略”。实验通过在叁种不同程度的pb污染环境(低、中、高度)以及2种异质程度(低和高异质性)的中度Pb污染环境下,在不同生长时期对蛇莓的生长指标(匍匐茎长度、分株数、生物量、开花比例)以及母株和子株不同器官的Pb含量进行比较分析,从生长构型、劳动分工策略、有性繁殖与无性繁殖比例、以及风险分摊策略等角度分析异质性Pb污染环境中蛇莓生境选择的模式。研究结果首先证明了克隆整合有利于Pb污染环境中蛇莓的生长。此外,生境选择实验结果显示在中度Pb污染水平下,特别是高异质性程度的环境中,克隆植物表现出最佳生长状态。其表现出以下特征:通过扩张生长模式以逃避有毒环境;将更多的分株生根定植在未受污染的生境斑块中;更多的生物量分配到地上部分以减少地下部分对Pb的吸收;并且子代分株将更多的Pb积累在根部以阻止其向上运输;以及产生更多的分株将毒害风险分摊。我们的研究结果表明,通过以上策略,克隆植物蛇莓在异质性Pb污染环境中,尤其是高异质性的生境中完成了对异质性生境的选择,这将有利于克隆植物规避不利的生境斑块,获取有利生境斑块中的资源,从而提高其整体适合度。此外,蛇莓可以作为一种Pb污染环境中有效的生态修复物种。(本文来源于《西北大学》期刊2018-06-01)

杨发誉,杨云彭,霍毅欣[9](2018)在《合成生物学中不依赖限制性内切酶的分子克隆策略》一文中研究指出随着合成生物学的兴起和发展,基因克隆和DNA大片段组装成为了常规操作。利用人工智能和液体操作机器人进行高通量的DNA组装和功能筛选已被广泛应用。传统的依赖于限制性内切酶识别位点的克隆技术对序列有选择性、步骤繁琐、实验人员的培训周期长,不利于以流水线形式进行工程化使用,已经逐步在生物工程领域内被淘汰。文中论述了一系列适于机械化操作的新一代分子克隆技术,即不依赖基因序列和连接反应克隆方法、Gibson组装、聚合酶环形延伸克隆、细胞裂解物体外无痕连接和细胞体内组装克隆。对这些方法的建立、基本原理及应用前景等方面进行了总结,并对其优缺点进行了比较。(本文来源于《中国生物化学与分子生物学报》期刊2018年04期)

徐志平,许峰[10](2018)在《基于环境策略的免疫克隆约束多目标进化算法》一文中研究指出在常规免疫克隆约束多目标进化算法中,优秀不可行解易被淘汰,且无法直接学习进化经验。针对该问题,提出了基于环境策略的免疫克隆约束多目标进化算法。其基本思想是,在约束处理前,通过环境策略用Pareto支配形成初始抗体群,利用一个精英种群对初始抗体群进行存储;约束处理后,用环境策略变异替换克隆变异。数值实验结果表明,新算法不仅可以有效地处理约束条件,而且解的多样性和均匀性均得到一定程度改进。(本文来源于《软件导刊》期刊2018年01期)

克隆策略论文开题报告

(1)论文研究背景及目的

此处内容要求:

首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景,再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题,并提出你的论文准备的观点或解决方法。

写法范例:

空间拓展是克隆植物响应环境的生态适应和权衡维度,以内陆盐沼湿地典型代表敦煌阳关国家级自然保护区内的芦苇(Phragmites australis)为研究对象,基于水库距离远近和芦苇种群的密度与盖度,设置了近水区(500 m)、过渡区(1500 m)、荒漠区(2500 m)3个不同的采样梯度,研究了环境异质条件下芦苇克隆构件空间拓展策略及其对土壤环境因子的响应。结果表明:(1)芦苇克隆构件在异质环境条件下差异显着,初级根茎条数、根茎节间长、间隔子长、分枝角度呈现"同增同涨"的协同进化关系(P<0.01),而与分株数呈现"此消彼长"的权衡关系(P<0.01)。(2)且随着种群的密度降低,芦苇在空间拓展过程中呈现从"密集型"转"游击型"的生存策略。(3)冗余分析显示土壤水分、pH值、盐分是克隆构件空间拓展的主要驱动力,其中各层土壤水分、深层土壤pH值和盐分是芦苇空间拓展最重要的环境因子。明晰内陆河湿地芦苇克隆构件空间拓展策略及主要的环境驱动力,能为干旱脆弱敏感区湿地保护和生态恢复提供借鉴意义。

(2)本文研究方法

调查法:该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。

观察法:用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。

实验法:通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。

文献研究法:通过调查文献来获得资料,从而全面的、正确的了解掌握研究方法。

实证研究法:依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。

定性分析法:对研究对象进行“质”的方面的研究,这个方法需要计算的数据较少。

定量分析法:通过具体的数字,使人们对研究对象的认识进一步精确化。

跨学科研究法:运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。

功能分析法:这是社会科学用来分析社会现象的一种方法,从某一功能出发研究多个方面的影响。

模拟法:通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。

克隆策略论文参考文献

[1].熊科,崔晓亭,王小艺,赵峙尧,柳佳芸.基于宏基因策略的新颖木聚糖酶基因cbxynA克隆及其重组酶酶学性质[J].中国食品学报.2019

[2].焦亮,刘雪蕊,王圣杰,董小刚.敦煌阳关湿地芦苇克隆构件空间拓展策略及其对土壤环境因子的响应[J].生态学报.2019

[3].翟志波,宋光婕.基于双种群进化策略的教与学-免疫克隆多目标进化算法[J].宝鸡文理学院学报(自然科学版).2019

[4].陈芳,王兰,张左兵.基于密码子优化策略的斑马鱼FOXP3A分子的原核表达及多克隆抗血清制备[J].生物技术通讯.2019

[5].窦怀乾,李仰平,吕佳,窦锦壮,李语丽.基于WGP物理作图法的虾夷扇贝Fosmid克隆混池策略及解码率研究[J].中国海洋大学学报(自然科学版).2019

[6].刘燕茹,石继飞,罗利霞.一种基于均匀设计原理的自适应克隆选择分子对接构像搜索策略[J].中国医学物理学杂志.2018

[7].施蕾,林洁平,廖淑珍,招春飞,刘华锋.从鼠源到全人源单克隆抗体制备技术及改造策略的研究进展[J].中国实验动物学报.2018

[8].权佳馨.异质性铅污染环境中克隆植物的生境选择策略[D].西北大学.2018

[9].杨发誉,杨云彭,霍毅欣.合成生物学中不依赖限制性内切酶的分子克隆策略[J].中国生物化学与分子生物学报.2018

[10].徐志平,许峰.基于环境策略的免疫克隆约束多目标进化算法[J].软件导刊.2018

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克隆策略论文-熊科,崔晓亭,王小艺,赵峙尧,柳佳芸
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