分子标记分析论文-刘勇,艾均文,唐芸,薛宏,何行健

分子标记分析论文-刘勇,艾均文,唐芸,薛宏,何行健

导读:本文包含了分子标记分析论文开题报告文献综述及选题提纲参考文献,主要关键词:家蚕核型多角体病毒(BmNPV),抗性基因,荧光定量PCR,表达水平

分子标记分析论文文献综述

刘勇,艾均文,唐芸,薛宏,何行健[1](2019)在《家蚕抗核型多角体病毒(BmNPV)相关基因的表达分析及其实用性分子标记的筛选》一文中研究指出家蚕核型多角体病毒(Bombyx mori nucleopolyhedrovirus, BmNPV)是一种对家蚕具有高致病性的病毒,会导致蚕业生产上的严重经济损失。迄今已在家蚕中发现了几种对BmNPV有抑制作用的蛋白,但各基因的表达水平与家蚕不同遗传类型材料BmNPV抗性的相关程度仍不清晰。本研究以高抗材料(highly resistant parent, R)和高感材料(highly susceptible parent, S)组配成F1、F2及回交等不同遗传类型材料,利用添毒实验与荧光定量PCR技术,检测家蚕不同遗传类型材料在不同感染条件下对BmNPV的抵抗能力及其相应的5个抗性相关基因(家蚕脂肪酶Ⅰ基因(Bmlipase-1),家蚕丝氨酸蛋白酶Ⅱ基因(serine proteaseⅡ, BmSP-2),家蚕核糖体蛋白S3A基因(ribosomal protein S3A, BmS3A),家蚕抑制蛋白酶Ⅱ基因(suppressor of profilin 2, BmSop2),家蚕烟酰胺腺嘌呤二核苷酸磷酸氧化还原酶基因(nicotinamide adenine dinucleotide phosphate oxidoreductase, BmNOX)的相对表达量,分析其与抗性的关联性。结果表明:Bmlipase-1和BmSP-2在家蚕中肠特异表达,其他基因没有组织表达特异性;Bmlipase-1、BmSP-2、BmNOX和BmSop2四个基因在不同遗传类型材料中肠的相对表达量之间均存在明显差异,且抗性越强的遗传类型材料的相对表达量也越高,各基因的相对表达量与材料抗性呈正相关性。而BmS3A基因的表达差异在各遗传类型材料间没有呈现出一定的相关性;Bmlipase-1在不同遗传类型材料的相对表达量与其抗性水平的一致性最高,该基因的相对表达水平可以在家蚕育种过程中作为抗核型多角体病毒材料选择与鉴定的依据之一。(本文来源于《农业生物技术学报》期刊2019年12期)

史灵燕,张云龙,刘保卫,郑素月[2](2019)在《基于SRAP分子标记的24个黑木耳栽培菌株遗传分析》一文中研究指出以24个北方地区主栽的黑木耳菌株为材料,采用相关序列扩增多态性SRAP分子标记,对24个黑木耳菌株进行遗传分析。结果表明,从48对引物中筛选出了稳定性好、可重复性高、多态性稳定并能扩增出清晰明亮条带的25对引物,扩增出133条多态性条带,片段大小在0.1~1.5 kb,平均每个引物扩增出6条多态性条带。基于非加权组平均法(UPGMA)的聚类分析结果表明:遗传相似系数变化范围为0.56~1.0,在遗传相似系数为0.56时,将24个黑木耳菌株划分为2大类群,第一类包括黑山等18个菌株;第二类包括黑29等6个菌株。(本文来源于《食用菌》期刊2019年06期)

宫文龙,王赞,赵桂琴,马琳,韦宝[3](2019)在《沙打旺EST-SSR分子标记开发及其遗传多样性分析》一文中研究指出沙打旺是一种高产优质、抗逆性强的多年生异花授粉豆科牧草,但分子标记的缺乏限制了其在遗传育种等方面的研究和利用。本研究旨在开发大量沙打旺EST-SSR分子标记,为沙打旺种质改良和遗传多样性分析提供参考资源。首先利用De novo转录组测序技术对两个沙打旺种质(CF019650, CF020070)进行RNA-seq测序,并对测序数据进行拼接获得总长度为190587631 bp的151516个unigenes。进一步在其中的30262个unigenes中检测到39163个EST-SSR位点,SSRs分布频率为25.85%。其中6635 (21.93%)条unigenes含有两个及以上SSR位点,复合SSRs有3514个(11.61%)。对所有EST-SSR位点进行引物设计,共得到22367对特异性引物。利用两个沙打旺种质(CF019650, CF020070)对随机合成的100对引物进行初步筛选,其中90对可扩增出目的特异性条带。随机选择其中51对引物对27个沙打旺种质的遗传多样性进行评估,结果表明:51对引物的平均等位基因数、平均多态性信息含量(PIC)、平均期望杂合度(He)和平均观测杂合度(Ho)分别为8.750、0.682、0.719和0.730。主成分及聚类分析结果揭示不同生态型(匍匐或直立)沙打旺种质的遗传分布具有明显的种质特异性,且聚类结果与其地理来源之间具有较高的相关性。新开发的EST-SSR分子标记可促进沙打旺遗传改良和基因组学研究,有助于沙打旺分子标记辅助育种、QTL定位和遗传变异分析。(本文来源于《草业学报》期刊2019年11期)

林丽,张敏,杜争,朱田田,孙少伯[4](2019)在《基于ISSR分子标记对黑河流域中下游黑果枸杞16个居群的遗传多样性分析》一文中研究指出目的研究黑河流域中下游黑果枸杞16个野生居群的遗传多样性,为黑果枸杞的遗传育种及保护机制研究提供依据。方法在建立ISSR分子标记的基础上,人工读带确定引物位点,利用Popgen32软件分析黑果枸杞的多态性、遗传相似系数及遗传距离。使用NTSYS软件建立黑果枸杞的遗传距离聚类图。结果采用6个ISSR引物对16个黑果枸杞居群的基因组DNA进行扩增后共检测到126个位点,多态位点百分率为92.86%,不同居群间的多态位点百分率范围为6.35%~50.00%。Nei’s基因多样性指数H为0.2228,Shannon信息指数I为0.3459,分析得出居群间的变异为41.85%。聚类的遗传距离介于0.03~0.16,大体聚为2类。结论黑河流域中下游黑果枸杞在种群水平上遗传多样性丰富,对环境的适应能力较强;黑果枸杞有复杂的遗传背景,且与地理来源相关性不强。(本文来源于《中国中医药信息杂志》期刊2019年11期)

魏小星,阿启兰,张燕,刘勇,刘文辉[5](2019)在《基于ISSR分子标记的早熟禾种质资源遗传多样性分析》一文中研究指出本研究以青海和西藏不同地理位置的60份早熟禾种质资源为材料,通过ISSR分子标记进行遗传多样性分析,以期了解青藏高原主体地区早熟禾种质资源间遗传关系,为种质创新及新品种选育提供理论依据。结果表明,在30条ISSR引物中共扩增出297条谱带,其中多态性谱带296条,多态性比率达到99.66%;等位基因平均值(na*)为1.996 6,有效等位基因平均值(ne*)为1.539 3,Nei's基因指数平均值(h*)为0.320 1,shannon's信息指数平均值(I*)为0.484 7;遗传相似系数阈值范围在0.525 3~0.878 8之间;根据UPGMA聚类分析,在遗传相似系数0.61处,60份早熟禾种质材料被聚为4大类,其中A大类、B大类和C大类分别占总量的76.7%、5%、16.7%,D大类只有一份材料单独聚为一类;整个聚类分析中,大部分来自相近或者相同地理区域的种质材料聚于同一类或者亚类,但种质材料间也有交叉现象。(本文来源于《分子植物育种》期刊2019年20期)

夏春阳,杜吉到,韩毅强,孙浩月,李明[6](2019)在《基于SSR分子标记的普通菜豆种质遗传多样性分析》一文中研究指出建立SSR-PCR反应体系对69份菜豆种质资源进行遗传多样性分析,并利用UPGMA法进行聚类分析及类群划分。17对SSR标记共检测获得等位变异位点55个,变幅2~5个,平均每对检测到标记3.24个;17对引物的多态性位点数17个,多态性百分含量100%。根据聚类分析结果:材料间遗传相似性系数(GS)变异范围0.392~0.963,平均值为0.659;在遗传相似系数0.67水平上将69份菜豆种子材料分为4个类群,说明普通菜豆种质遗传多样性丰富。(本文来源于《食品与机械》期刊2019年10期)

于海飞,王丽娜,韩玉林,杜晓宇,邹少奎[7](2019)在《我国主产区小麦品种重要性状分子标记分析》一文中研究指出明确我国主产区小麦生育期、粒重和面粉颜色相关基因的分布,有助于小麦高产稳产和品质性状的改良。利用已报道的春化(vernalization,Vrn)、光周期(photoperiod,Ppd)、粒重、黄色素含量(yellow pigment content,YPC)和多酚氧化酶(polyphenol oxidase,PPO)相关分子标记,对102份小麦品种(系)进行检测,以分析不同等位基因在品种中的分布并为品种改良提供指导。结果表明,所选材料在VRN-A1和VRN-B3位点均为隐性等位基因,在VRN-B1位点仅有2个品种携带显性等位基因;VRN-D1位点有32.4%的品种(系)携带显性等位基因,该位点可能是影响我国主产区小麦冬春性的主要位点。除邯6172外,其它品种(系)均携带光周期不敏感型等位基因Ppd-D1a。分别有65.7%和39.2%的品种(系)携带高粒重等位基因TaCwi-A1a和TaGS-D1a,且24.5%的品种(系)同时携带这两个高粒重等位基因,说明粒重在两个位点仍有较大改良空间。高YPC等位基因Psy-A1a(69.6%)分布频率显着高于低YPC等位基因Psy-A1b(30.4%)。分别有54.9%和39.2%的品种(系)携带高PPO活性等位基因Ppo-A1a和Ppo-D1b,有10.8%的品种(系)同时携带这两个高PPO活性等位基因。综上所述,我国主产区小麦生育期、粒重和面粉颜色等性状仍有较大改良空间,应加强光周期敏感型新品种的选育。(本文来源于《山东农业科学》期刊2019年10期)

苏在兴,高闰飞,易媛,王波,常勇[8](2019)在《小麦穗发芽抗性分析及相关分子标记检测》一文中研究指出小麦成熟期遭遇穗发芽会严重影响小麦的产量和品质。为了解徐州主要栽培品种的穗发芽抗性及其分子机制,用整穗发芽法、籽粒发芽法考察了5个徐州地区主要推广小麦品种的籽粒休眠和发芽特性,并用10个分子标记对其穗发芽性状进行解析。结果表明,供试品种间整穗发芽率、发芽率和萌发指数均存在不显着、显着或极显着差异。徐农029的整穗发芽率最低,为3.02%,烟农19的整穗发芽率最高,达68.80%。徐农029的发芽率和萌发指数分别为41.00%和21.43%,均极显着低于其父本矮抗58(71.67%、53.10%)和母本淮麦20(89.67%、61.00%),周麦18和烟农19的发芽率均为99.33%,而烟农19的萌发指数(83.95%)高于周麦18的萌发指数(81.43%)。分子标记检测发现,徐农029和淮麦20属于Vp1Bc型抗穗发芽; Xgwm282标记在5个品种中呈2种带型,与穗发芽抗性关系密切。另外,8个抗穗发芽相关分子标记不能很好区分上述5个品种的抗穗发芽特性。(本文来源于《麦类作物学报》期刊2019年10期)

杨贞,蔡友铭,张永春,杨柳燕,王艺程[9](2019)在《基于SRAP分子标记的铁皮石斛遗传多样性分析》一文中研究指出利用SRAP分子标记法对13份来自中国不同产地的铁皮石斛品种的基因组DNA进行分析,从分子水平研究铁皮石斛的遗传多样性和亲缘关系。结果表明:从81对引物中筛选出15对引物,在13份材料中共扩增出238条清晰的多态性条带,占总条带数的96. 75%。13份材料间的遗传相似系数为0. 44—0. 79,在相似系数0. 46处13份材料被划分为3个类群。研究结果可为不同产地铁皮石斛品种亲缘关系的鉴定以及种质资源的利用与保护提供理论依据。(本文来源于《上海农业学报》期刊2019年05期)

汪昊,牛玉蓉,荣成博,刘宇,王守现[10](2019)在《19个香菇菌株基于ISSR、SRAP和TRAP分子标记的遗传多样性分析》一文中研究指出利用简单重复序列间扩增(inter-simple sequence repeat,简称ISSR)、相关序列扩增多态性(sequencerelated amplified polymorphism,简称SRAP)和目标区域扩增多态性(target region amplified polymorphism,简称TRAP)分子标记对19个香菇栽培菌株进行遗传多样性分析。结果显示,共筛选出34对(条)多态性丰富的引物,获得303条数据条带,其中多态性条带254条,多态性比例为83. 83%,在遗传相似系数为0. 75的水平上,将19个菌株分为6类。3种标记的多态性比例排序如下:TRAP(91. 14%)> ISSR(83. 15%)> SRAP(80. 00%)。由结果可知,综合不同分子标记进行香菇的遗传多样性分析,可更加准确地反映菌株间的亲缘关系。(本文来源于《江苏农业科学》期刊2019年17期)

分子标记分析论文开题报告

(1)论文研究背景及目的

此处内容要求:

首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景,再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题,并提出你的论文准备的观点或解决方法。

写法范例:

以24个北方地区主栽的黑木耳菌株为材料,采用相关序列扩增多态性SRAP分子标记,对24个黑木耳菌株进行遗传分析。结果表明,从48对引物中筛选出了稳定性好、可重复性高、多态性稳定并能扩增出清晰明亮条带的25对引物,扩增出133条多态性条带,片段大小在0.1~1.5 kb,平均每个引物扩增出6条多态性条带。基于非加权组平均法(UPGMA)的聚类分析结果表明:遗传相似系数变化范围为0.56~1.0,在遗传相似系数为0.56时,将24个黑木耳菌株划分为2大类群,第一类包括黑山等18个菌株;第二类包括黑29等6个菌株。

(2)本文研究方法

调查法:该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。

观察法:用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。

实验法:通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。

文献研究法:通过调查文献来获得资料,从而全面的、正确的了解掌握研究方法。

实证研究法:依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。

定性分析法:对研究对象进行“质”的方面的研究,这个方法需要计算的数据较少。

定量分析法:通过具体的数字,使人们对研究对象的认识进一步精确化。

跨学科研究法:运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。

功能分析法:这是社会科学用来分析社会现象的一种方法,从某一功能出发研究多个方面的影响。

模拟法:通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。

分子标记分析论文参考文献

[1].刘勇,艾均文,唐芸,薛宏,何行健.家蚕抗核型多角体病毒(BmNPV)相关基因的表达分析及其实用性分子标记的筛选[J].农业生物技术学报.2019

[2].史灵燕,张云龙,刘保卫,郑素月.基于SRAP分子标记的24个黑木耳栽培菌株遗传分析[J].食用菌.2019

[3].宫文龙,王赞,赵桂琴,马琳,韦宝.沙打旺EST-SSR分子标记开发及其遗传多样性分析[J].草业学报.2019

[4].林丽,张敏,杜争,朱田田,孙少伯.基于ISSR分子标记对黑河流域中下游黑果枸杞16个居群的遗传多样性分析[J].中国中医药信息杂志.2019

[5].魏小星,阿启兰,张燕,刘勇,刘文辉.基于ISSR分子标记的早熟禾种质资源遗传多样性分析[J].分子植物育种.2019

[6].夏春阳,杜吉到,韩毅强,孙浩月,李明.基于SSR分子标记的普通菜豆种质遗传多样性分析[J].食品与机械.2019

[7].于海飞,王丽娜,韩玉林,杜晓宇,邹少奎.我国主产区小麦品种重要性状分子标记分析[J].山东农业科学.2019

[8].苏在兴,高闰飞,易媛,王波,常勇.小麦穗发芽抗性分析及相关分子标记检测[J].麦类作物学报.2019

[9].杨贞,蔡友铭,张永春,杨柳燕,王艺程.基于SRAP分子标记的铁皮石斛遗传多样性分析[J].上海农业学报.2019

[10].汪昊,牛玉蓉,荣成博,刘宇,王守现.19个香菇菌株基于ISSR、SRAP和TRAP分子标记的遗传多样性分析[J].江苏农业科学.2019

标签:;  ;  ;  ;  

分子标记分析论文-刘勇,艾均文,唐芸,薛宏,何行健
下载Doc文档

猜你喜欢