导读:本文包含了周期素依赖性论文开题报告文献综述及选题提纲参考文献，主要关键词:2-氨基噻唑,抑制剂,AutoDock,分子对接
周期素依赖性论文文献综述
徐焱,刘中婷,华炳乾,庄文昌,朱文友[1]（2019）在《细胞周期素依赖性激酶活性中心残基与其抑制剂相互作用机制研究》一文中研究指出以16个2-氨基噻唑衍生物抑制剂为研究对象,利用AutoDock4.2软件进行了分子对接,分析抑制剂分子和细胞周期素依赖性激酶(CDK2)的结合情况。研究结果显示,活性中心残基Leu83主干上的羰基和氨基分别与抑制剂分子C9原子上的氨基和噻唑环上的N原子形成氢键,Glu81主干上的羰基和抑制剂分子C8上的氨基形成氢键,Phe80侧链上苯基和抑制剂母体分子上的苯基形成了π-π堆积作用,CDK2通过与抑制剂分子之间形成的氢键网络和π-π堆积作用将小分子固定在CDK2的活性中心。(本文来源于《化工设计通讯》期刊2019年10期）
仲彪,孙巍巍,仲华,王友华[2]（2019）在《细胞周期蛋白依赖性激酶7在骨性关节炎软骨中的表达及其意义》一文中研究指出目的:探讨细胞周期蛋白依赖性激酶7(CDK7)在骨性关节炎(OA)软骨组织中的表达及其意义。方法:取10例行全膝关节置换术的OA患者(实验组)和3例行下肢截肢手术患者(对照组)的软骨组织,通过番红O染色、免疫组化及Western blotting检测CDK7在两组软骨中的表达。用体外培养的人软骨肉瘤细胞(SW1353)建立不同病变程度的OA细胞模型,通过Western blotting检测CDK7及炎症因子白细胞介素-6(IL-6)、诱导型一氧化氮合酶(iNOS)的表达变化。用CDK7 siRNA来抑制OA细胞模型中CDK7的表达,Western blotting检测此时IL-6、iNOS的表达变化以及核因子κB(NF-κB)通路活性因子p-p65、p-IκBα、IκBα的表达变化。结果:CDK7在OA软骨中的表达高于正常软骨(P<0.05)。随着OA细胞模型病理程度加重,CDK7、IL-6、iNOS的表达呈现增高趋势(P<0.05)。当CDK7的表达受到抑制时,IL-6、iNOS的表达降低(P<0.05),提示炎症反应减弱;p-p65、p-IκBα的表达降低(P<0.05),IκBα的表达升高(P<0.05),提示NF-κB活性减弱。结论:OA患者关节软骨CDK7的表达较正常人升高,提示CDK7在OA的病理过程中可能起重要作用。CDK7可能是通过促进NF-κB通路的活化来促进OA软骨的炎症反应。(本文来源于《东南大学学报(医学版)》期刊2019年05期）
王海权[3]（2019）在《周期情形下两分支Camassa-Holm系统解对初值的不一致依赖性》一文中研究指出利用近似解方法和解的局部适定性结果,讨论了一个周期情形下两分支Camassa-Holm系统Cauchy问题解在Besov空间B■(T)×B■(T)中对初值的不一致连续依赖性。该方法还可以用来讨论其他非线性发展方程解对初值的不一致连续依赖性。(本文来源于《山东大学学报(理学版)》期刊2019年08期）
陈建安[4]（2019）在《细胞周期蛋白依赖性激酶11在肝癌组织中的表达及其临床意义》一文中研究指出研究背景肝细胞肝癌(Hepatocellular carcinoma,HCC)具有高度的侵袭性和转移性,发病率和死亡率均居高不下,是我国最常见的恶性肿瘤之一。目前最主要的治疗方式为外科手术切除,但由于其早期无明显临床症状,患者感觉不适被确诊时已是肝癌晚期,失去了最佳的手术时机。即使手术治疗后,肝癌患者的预后也是不尽人意,因为肝癌极易复发并发生远处转移。肝癌的发病原因及发病的分子机制尚不完全清楚,目前认为肝癌的发生是一种多因素、多步骤的复杂过程。在我国的主要致病因素为乙型肝炎病毒或丙型肝炎病毒感染,而在发达国家,酒精为主要致病原因;除此之外,还有性激素、黄曲霉素、亚硝胺类物质和微量元素等致病因素。近年来随着放、化疗技术的进步以及分子靶向药物的上市,使得中晚期肝癌患者的生活质量和生存时间得以提高,然而大多数患者不能耐受药物治疗伴随的副作用,同时也可能会导致肝癌产生耐药性,降低药物的治疗效果。因此,积极探索发现新的能够早期预测肝癌的分子标志物,对于提高肝癌的检出率以及肝癌患者的生活质量具有非常重要的意义。细胞周期是各种生物体内细胞增殖的一个必要的过程,它受到细胞周期蛋白和细胞周期蛋白依赖性激酶的调控。已有大量的文献报道在多种肿瘤的发生发展中,细胞周期蛋白和细胞周期蛋白依赖性激酶起着非常重要的作用。CDK11是丝氨酸/苏氨酸激酶家族的一员,对转录、细胞自噬和细胞凋亡等有着重要的作用,同时在多种肿瘤中高度表达,对其发生发展具有重要的调控作用。然而CDK11在肝癌中的表达水平和作用目前尚未报道,在本篇研究中,我们首先利用TCGA数据库和基因富集分析发现CDK11在肝癌组织中高表达,且和TNM分期正相关,高表达的CDK11预示着较差的生存预后。随后采用免疫组化技术发现CDK11蛋白在肝癌组织中的表达水平也显着高于正常组织,Cox回归分析结果表明CDK11是一个影响肝癌患者预后的独立危险因素,同时具有CDK11高表达的肝癌患者生存预后较差。目的本课题拟利用组织免疫组化技术联合多种网络在线肿瘤数据库,如(TCGA,HPA等),分析在各种人类实体瘤中CDK11的表达情况,并着重分析其在肝癌中的表达水平,对肝癌患者的生存预后是否有预示作用。方法1.借助本课题组搭建的基于TCGA数据库的在线分析网站CAAT分析CDK11在泛癌组织和对应的癌旁组织中的表达情况;2.利用TCGA-LIHC数据集分析CDK11在肝癌中表达情况,并分析其与肝癌患者生存预后的关系;3.使用组织芯片免疫组化实验验证CDK11在肝癌组织和癌旁组织中的蛋白表达情况,与肝癌患者临床特征及生存预后的关系;4.生物学数据统计分析利用R语言、Graph Pad Prism 6.0和SPSS 23.0软件进行。所有数据均以Mean±SD来表示。采用Kaplan-Meier方法绘制CDK11表达与患者预后的生存曲线图并进行log-rank检验。应用Cox风险回归分析方法进行单因素和多因素分析。两组数据间的比较应用两独立样本t检验。α=0.05作为检验水准。结果1.CDK11 m RNA在多种肿瘤中表达均有明显的差异。2.CDK11 m RNA的表达水平在肝癌组织中显着高于癌旁组织,差异具有统计学意义,且高表达的CDK11和TNM分期成正相关关系;K-M生存曲线分析结果表明在肝癌患者中,高表达CDK11的生存时间要比低表达CDK11的患者明显缩短。3.CDK11蛋白的表达水平在肝癌组织中显着升高(P=0.0002),TNM分期Ⅰ-Ⅱ期肝癌患者的CDK11表达水平要比Ⅲ-Ⅳ期患者的低,差异有统计学意义(P=0.0149)。生存预后分析结果显示高表达CDK11的肝癌患者生存时间较CDK11低表达的患者短(HR=1.837,P=0.0005)。单因素分析结果表明CDK11的表达与TNM分期(P=0.003)、肝硬化(P=0.015)呈正相关的关系,而与年龄(P=0.706)、性别(P=0.871)、肿瘤大小(P=0.247)、病理分化程度(P=0.747)无明显的相关关系。Cox单因素和多因素分析结果显示CDK11表达(HR=1.997,P=0.024)及TNM分期(HR=2.514,P=0.003)是肝癌预后的独立危险因素。结论1.CDK11在多肿瘤中表达有差异,肝癌中CDK11表达升高。2.CDK11的高表达预示着肝癌患者的恶性临床特征及更差的生存预后,可能成为一个能够早期诊断肝癌的分子,具有靶向治疗的潜在价值。(本文来源于《郑州大学》期刊2019-05-01）
隰成林,刘风玲[5]（2019）在《细胞周期蛋白依赖性激酶12在肿瘤中作用的研究进展》一文中研究指出细胞周期蛋白依赖性激酶12(CDK12)属于丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶家族,其主要功能是调节转录和转录后过程,从而调控多种细胞的功能。早期研究认为CDK12是一种转录型CDK,它与cyclin K形成复合物,通过磷酸化RNA聚合酶Ⅱ介导基因转录。最近的研究表明,CDK12还参与DNA复制,影响发育。CDK12被证明能特异性地上调DNA损伤、应激和热激反应中相关基因的表达,目前已在食管癌、胃癌、乳腺癌、子宫内膜癌、卵巢癌、膀胱癌、结直肠癌和胰腺癌中被检测到CDK12基因发生改变,占被检测病例的5%～15%。越来越多的研究显示,检测CDK12能够预测肿瘤的治疗反应,包括聚ADP核糖聚合酶(PARP)抑制和PD-1抑制治疗。CDK12抑制是抑制肿瘤生长的有效策略,特定的遗传或细胞背景能够使CDK12抑制的敏感性增强,包括PARP和CHK1抑制、MYC依赖和EWS/FLI重排。多种不同化学结构和作用范围的CDK12抑制剂已经被用于临床前研究,CDK12有望成为肿瘤治疗的新靶点。(本文来源于《中国肿瘤生物治疗杂志》期刊2019年04期）
游颜杰,王红红,马玉红,冶正财[6]（2019）在《周期素依赖性激酶10在胃癌组织中的表达及其临床意义》一文中研究指出目的研究分析胃癌组织中周期素依赖性激酶10(CDK10)表达的临床意义。方法应用免疫组织化学EnVision法检测128例胃癌石蜡标本中CDK10的表达状态并结合临床病理资料进行统计分析,用Kaplan-Meier生存期分析研究CDK10同胃癌患者预后的相关性。结果胃癌组织中CDK10表达缺失率50.8%(65/128),同胃癌临床分期(P<0.05)、淋巴结转移(P<0.05)、远处转移(P<0.05)、病理分化程度(P<0.05)有相关性。结论 CDK10表达下调同胃癌临床病理特征密切相关,可能是参与胃癌发展的重要分子事件。(本文来源于《宁夏医学杂志》期刊2019年06期）
郑皓,景嘉楠,董慧,轩阁,李铁鹏[7]（2019）在《细胞周期蛋白依赖性激酶16(CDK16)与细胞增殖指标Ki67在食管鳞癌中的表达及意义》一文中研究指出目的探讨细胞周期蛋白依赖性激酶16(CDK16)及细胞增殖指标Ki67在人食管鳞癌组织中的表达及其生物学意义,并探讨二者在食管鳞癌中表达的相关性。方法采用免疫组织化学方法检测CDK16、Ki67蛋白在75例食管鳞癌/癌旁组织中的表达,使用数学统计分析软件分析这两种蛋白的表达与食管鳞癌临床病理特征之间的关系。结果 CDK16在食管鳞癌组织中的表达显着高于癌旁组织中的表达(P<0.05),CDK16的表达与食管鳞癌的分化程度、淋巴结转移及TNM临床分期密切相关(P<0.05),而与食管鳞癌患者的性别、年龄、肿瘤部位、肿瘤最大径及肿瘤的病理形态均无关(P>0.05)。另外,在食管鳞癌组织中,Ki67的表达与食管鳞癌的分化程度、淋巴结转移及TNM临床分期之间存在显着的相关性(P<0.05),且相关性分析显示,食管鳞癌中CDK16与Ki67二者的表达呈显着正相关(χ~2=24.36,P<0.001, Pearson列联系数=0.518)。结论 CDK16蛋白和Ki67蛋白在食管鳞癌中的表达明显升高,联合检测CDK16与Ki67的表达,可作为判断食管鳞癌恶性程度及评估患者预后水平的重要参考指标。(本文来源于《西安交通大学学报(医学版)》期刊2019年03期）
刘华梅,李宗恒,刘俊才[8]（2019）在《外阴上皮内非瘤样病变女性患者细胞周期蛋白D1、周期素依赖性蛋白激酶4和周期素依赖性蛋白激酶抑制因子P27的表达及意义》一文中研究指出目的探讨外阴上皮内非瘤样病变(NNEDV)女性患者细胞周期蛋白D1 (Cyclin D1)、周期素依赖性蛋白激酶4(CDK4)和周期素依赖性蛋白激酶抑制因子P27 (P27)的表达及意义,为临床诊治提供参考依据。方法采用免疫组织化学(SP)法研究NNEDV患者皮损中Cyclin D1,CDK4及P27蛋白的表达。结果①NNEDV组织的3组病理类型[外阴鳞状上皮增生(SH)组、外阴硬化性苔癣(LS)组、SH合并LS组]中Cyclin D1、CDK4蛋白阳性表达率明显高于正常组,差异有统计学意义(均P<0. 05),P27蛋白阳性表达率低于正常组,但差异无统计学意义(均P>0. 05);而病变的3组病理类型之间Cyclin D1、CDK4及P27蛋白阳性表达率差异无统计学意义(均P>0. 05)。②Cyclin D1和CDK4在NNEDV组中棘细胞层/基底细胞层阳性表达率的比值高于正常组,差异有统计学意义(均P<0. 01); P27的棘细胞层/基底细胞层阳性表达率比值在两组中差异无统计学意义(P>0. 05)。结论①Cyclin D1及CDK4蛋白的高表达可能是NNEDV发病的原因之一。②NNEDV的3种病理类型可能具有共同的或相似的发病机制。③NNEDV组织各层上皮细胞增殖不平衡说明NNEDV存在恶变的可能性。④本研究认为在NNEDV的随访中P27蛋白作为随访病变恶变的指标比Cyclin D1及CDK4的意义更大。(本文来源于《中国妇幼保健》期刊2019年06期）
王明阳[9]（2019）在《使用多层虚拟筛选方法筛选细胞周期素依赖性激酶-2抑制剂》一文中研究指出目的:细胞周期素依赖性激酶(CDKS)是丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶家族的成员,能够通过调节G/S以及G2/M期而影响整个细胞周期进程。CDK2作为CDKS的催化亚基,对主要负责有丝分裂以及DNA复制的G1-S期的调控作用较强,多种癌症中均发现CDK2的异常表达而导致细胞周期紊乱的情况。现阶段已经研究出很多抗肿瘤CDK2抑制剂,但是仅有少数的几个进入了临床试验。本实验拟建立一种合理的虚拟筛选方案,筛选出具有新型母核结构,抗肿瘤活性强的CDK2抑制剂。方法:通过建立基于配体以及基于结构相结合的多层虚拟筛选方法来筛选出具有对CDK2蛋白有抑制活性的苗头化合物,再通过分子动力学以及MM/PBSA自由能计算选择其中对蛋白结合最稳定,亲和力最强的先导化合物。多层虚拟筛选方法主要建立并优化叁个模型:支持向量机(SVM),蛋白配体指纹图谱(PLIF)药效团以及分子对接。分子动力学主要包括RMSD结合稳定性分析,最后通过计算范德华能,静电能,极性溶剂化以及非极性溶剂化能来计算MM/PBSA结合自由能。结果:1、使用LibSVM建立的SVM模型再进行参数和描述符优化:在C=32,γ=0.125使用遗传算法优选的最佳描述符时,训练集和测试集的预测的总体准确率最好,分别为99.79%以及92.72%。2、PLIF方法显示了氨基酸残基Glu81以及Leu83与大部分配体生成相互作用,并据此生成了5个药效团,其中药效团3对训练集的产率以及命中率为89.6%以及12.5%,对测试集总体准确率为94.32%,因此被选中用于建立多层虚拟筛选法。3、NDCG的计算结果表明:GOLD对接中的Chemscore打分函数能够真实的反应CDK2与配体结合的真实情况,将Chemscore打分阈值设置成-7的时候,在该打分函数下能够对测试集拥有较低的假阳性率和较高的总体准确率。4、将建立的虚拟筛选模型对验证集375个抑制剂,155528个阴性化合物)进行测试,命中率为80.1%,富集因子为332.83,产率为73.8%,最终耗时为1.62 h,说明此多层虚拟筛选模型能够准确有效的在化学数据库中筛选CDK2抑制剂。5、使用此模型从BindingDB,Pubchem以及NCI数据库中筛选得到了6个苗头化合物,在进行分子动力学以及MM/PBSA自由能计算后,最终确定了2个与CDK2亲和力强,结合稳定并具有新型母核结构的化合物。结论:1、多层虚拟筛选方法由于将基于配体以及基于结构的虚拟筛选方法结合到一起,而同时考虑并利用到了受体和配体的信息,使其在筛选的效率和准确度上相比任何一个方法单独使用有了很大的提高。2、最终筛选得到的两个先导化合物MM/PBSA结合能计算结果和分子动力学结果与CDK2抑制剂Milciclib相似,说明这两个化合物与Milciclib有着相似的结合模式,稳定性以及亲和能力。3、本实验结果表明建立的多层虚拟筛选法能够用来筛选CDK2抑制剂,筛选得到的化合物具有新型母核以及对CDK2蛋白具有高度的结合稳定性以及亲和力,进一步开发该母核作为CDK2抑制剂具有很大的意义。(本文来源于《中国医科大学》期刊2019-03-01）
杨云鹏,何丽萍,鲍劲宵,戚逸飞,张增辉[10]（2019）在《细胞周期依赖性激酶2与其抑制剂的残基特异性结合的计算分析（英文）》一文中研究指出细胞周期依赖性激酶2(CDK2)是细胞周期调控中的关键大分子.在癌细胞中,CDK2常被过度表达,因此抑制CDK2的表达是治疗乳腺癌、白血病和淋巴瘤等多种癌症有效的方法,在分子水平上定量表征CDK2与其抑制剂之间的相互作用,可为药物开发提供更深入的蛋白质与抑制剂的相互作用机制和线索,本文采用计算丙氨酸扫描和相互作用熵方法,研究CDK2与13种抑制剂结合的微观机制,该方法得到的结合自由能与实验值之间的相关系数为0.76～0.83.计算结果揭示了这13种抑制剂中的两种结合模式,即范德华占优势和静电占优势.通过将总能量分解为每个残基的贡献,确定了结合过程中五个疏水残基为热点残基,同时发现了能够决定CDK2与抑制剂结合强度的残基.(本文来源于《Chinese Journal of Chemical Physics》期刊2019年01期）
周期素依赖性论文开题报告
（1）论文研究背景及目的
此处内容要求：
首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景，再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题，并提出你的论文准备的观点或解决方法。
写法范例：
目的:探讨细胞周期蛋白依赖性激酶7(CDK7)在骨性关节炎(OA)软骨组织中的表达及其意义。方法:取10例行全膝关节置换术的OA患者(实验组)和3例行下肢截肢手术患者(对照组)的软骨组织,通过番红O染色、免疫组化及Western blotting检测CDK7在两组软骨中的表达。用体外培养的人软骨肉瘤细胞(SW1353)建立不同病变程度的OA细胞模型,通过Western blotting检测CDK7及炎症因子白细胞介素-6(IL-6)、诱导型一氧化氮合酶(iNOS)的表达变化。用CDK7 siRNA来抑制OA细胞模型中CDK7的表达,Western blotting检测此时IL-6、iNOS的表达变化以及核因子κB(NF-κB)通路活性因子p-p65、p-IκBα、IκBα的表达变化。结果:CDK7在OA软骨中的表达高于正常软骨(P<0.05)。随着OA细胞模型病理程度加重,CDK7、IL-6、iNOS的表达呈现增高趋势(P<0.05)。当CDK7的表达受到抑制时,IL-6、iNOS的表达降低(P<0.05),提示炎症反应减弱;p-p65、p-IκBα的表达降低(P<0.05),IκBα的表达升高(P<0.05),提示NF-κB活性减弱。结论:OA患者关节软骨CDK7的表达较正常人升高,提示CDK7在OA的病理过程中可能起重要作用。CDK7可能是通过促进NF-κB通路的活化来促进OA软骨的炎症反应。
（2）本文研究方法
调查法：该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。
观察法：用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。
实验法：通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。
文献研究法：通过调查文献来获得资料，从而全面的、正确的了解掌握研究方法。
实证研究法：依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。
定性分析法：对研究对象进行“质”的方面的研究，这个方法需要计算的数据较少。
定量分析法：通过具体的数字，使人们对研究对象的认识进一步精确化。
跨学科研究法：运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。
功能分析法：这是社会科学用来分析社会现象的一种方法，从某一功能出发研究多个方面的影响。
模拟法：通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。
周期素依赖性论文参考文献
[1].徐焱,刘中婷,华炳乾,庄文昌,朱文友.细胞周期素依赖性激酶活性中心残基与其抑制剂相互作用机制研究[J].化工设计通讯.2019
[2].仲彪,孙巍巍,仲华,王友华.细胞周期蛋白依赖性激酶7在骨性关节炎软骨中的表达及其意义[J].东南大学学报(医学版).2019
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[10].杨云鹏,何丽萍,鲍劲宵,戚逸飞,张增辉.细胞周期依赖性激酶2与其抑制剂的残基特异性结合的计算分析（英文）[J].ChineseJournalofChemicalPhysics.2019