分子指纹论文-王志奎

分子指纹论文-王志奎

导读:本文包含了分子指纹论文开题报告文献综述及选题提纲参考文献,主要关键词:水稻,杂种优势,分子标记,分子指纹

分子指纹论文文献综述

王志奎[1](2019)在《48对水稻分子指纹SSR标记与杂种优势相关性研究》一文中研究指出杂种优势是自然界中普遍存在的一种生物现象。自上世纪七十年代开始,中国开始快速推广应用水稻的杂种优势,这为我国的粮食增产和粮食安全做出了巨大贡献。然而水稻杂种优势的机理仍未完全阐述清楚,这导致在杂交水稻育种选配杂交组合时,很大程度上依赖育种者的育种经验。如何科学地预测水稻杂种优势是杂交水稻育种者迫切需要解决的问题。利用分子标记绘制的水稻分子指纹可以很好的展示水稻品种间的遗传差异,而这种遗传差异与水稻的杂种优势存在一定的相关性。本研究以农业部行业标准(NY/T1433-2014)中的33个参照品种和两个不育系T91S、培矮64S,以及配组的66个杂交组合为研究材料,研究水稻分子指纹48对SSR引物与杂种优势的关系,主要得到以下研究结果:1、对供试亲本水稻品种的主要经济性状分析,其经济性状变幅较大。籼型父本的变异系数变幅在7.11%~29.23%之间,粳稻父本的变异系数变幅在10.53%~28.10%之间。2、利用水稻分子指纹48对SSR引物对供试水稻品种绘制分子指纹,根据水稻分子指纹对供试品质进行遗传差异分析。结果显示,两个不育系之间遗传距离为0.351,基因杂合度0.468;不育系T91S、培矮64S与父本间遗传距离范围分别为0.269~0.456,0.322~0.423之间:表明亲本间存在着较大的遗传差异。依据遗传相似系数聚类分析将33个参照品种水稻品种分为叁大类:一类为19份籼稻材料,另一类为12份粳稻材料,第叁类为具有粳稻血缘的2个籼稻材料。3、遗传距离与杂交组合的杂种优势相关性分析表明,T91S与籼型父本配组的杂交组合亲本间遗传距离在0.269~0.300之间时,遗传距离与生育期、穗长超亲优势呈现正相关,与千粒重超亲优势负相关,且达到显着水平。培矮64S与籼型父本配组的杂交组合亲本间遗传距离在0.390~0.433之间时,生育期与遗传距离达到正向极显着相关性,穗长与遗传距离达到正相关。4、利用48对SSR引物绘制的水稻分子指纹计算杂交组合基因杂合度与杂种优势相关性分析表明,T91S与籼稻父本杂交组合中基因杂合度在0.532~0.744之间,生育期、株高、穗长超亲优势相关性达到显着;T91S与粳稻父本杂交组合中基因杂合度在0.800~0.893之间,穗长、每穗总粒数、每穗实粒数、单株产量超亲优势相关性达到显着水平;培矮64S与籼稻父本杂交组合中基因杂合度在0.447~0.691之间,每穗总粒数、单株产量超亲优势相关系数达到极显着;培矮64S与粳稻父本杂交组合中基因杂合度在0.600~0.691之间,每穗总粒数超亲优势相关性达到极显着水平。其余农艺学性状与基因杂合度相关性未达到显着水平。5、水稻分子指纹48对SSR引物与杂交组合的杂种优势关联分析表明,主要经济性状与一些特定引物对应的特定条带表现出较强杂种优势,分子指纹带型可以为杂种优势的预测提供一定的指导意义。(本文来源于《湖南师范大学》期刊2019-08-01)

孙利娜,周群,黄妹平,周长品,徐世松[2](2019)在《基于SSR标记构建宝巾花品种的分子指纹》一文中研究指出【目的】针对宝巾花(Bougainvillea)品种繁多、同物异名和同名异物多有发生的现象,利用可靠的分子标记技术进行品种的有效分类。【方法】基于15个简单重复序列(SSR)位点,利用荧光标记的引物对131个宝巾花品种进行PCR扩增,扩增产物经毛细管电泳检测,分析品种多样性和遗传距离,并构建品种聚类图和指纹图谱。【结果】15个SSR位点共扩增出85个等位基因,平均每个位点的等位片段数5.60个,Shannon's信息指数、观测杂合度和期望杂合度的变化范围分别为0.38~1.53、0.11~0.94和0.16~0.73,平均值分别为1.04、0.50和0.57,位点的多态性信息量介于0.15~0.69之间,平均0.51。宝巾花品种的遗传距离为0.00~0.65,平均0.33;聚类分析表明,同一种的品种大多数聚在一类,但同一个种仍有品种未聚在一类或亚类,也有多个种的品种聚在一类;有多对品种存在同物异名或同名异物的现象;基于11个位点可有效鉴别131个品种,建立了各品种的分子指纹图谱。【结论】对同物异名或同名异物的品种,需要进一步确认品种中文名或拉丁名;基于SSR标记的宝巾花品种的指纹图谱为宝巾花品种登记、注册和知识产权保护提供了可靠技术,也为品种鉴定提供了有效手段。(本文来源于《南京林业大学学报(自然科学版)》期刊2019年06期)

李国彬,王伟伟,史聪仙,白瑾琏,李灿辉[3](2019)在《云南省马铃薯品种资源鉴定及分子指纹图谱的建立》一文中研究指出云南省保存着丰富的马铃薯品种资源,本研究于2016-2017年在云南省采集79份马铃薯品种,以已知的24个主栽品种为对照,进行主要农艺性状的比较;以前期筛选的多态性较好的3对SSR引物和2对细胞质DNA引物,对待测品种进行品种鉴定、遗传多样性分析和构建DNA指纹图谱。结果表明,79份待测品种农艺性状多样化显着且能明显区分出野生型和普通栽培型特点;采集品种中细胞质DNA多态性丰富,具有W/α、W/β、T/α、T/β和W/γ五种类型,野生型比率占63.29%;利用3对SSR引物共扩增出29个等位位点,全部等位位点都具有多态性,多态性比率为100%,构建了待测品种的DNA分子指纹图谱,共鉴定出37个采集品种。结果还发现,79个采集品种间遗传多样性较丰富。(本文来源于《分子植物育种》期刊2019年14期)

鲁玉杰,袁园,刘凤杰,王争艳,何向楠[4](2018)在《利用DNA分子指纹图谱技术检测小麦粉中害虫的研究》一文中研究指出为开发快速检测我国成品粮中害虫的技术,研究了DNA分子指纹图谱技术检测小麦粉中主要害虫的碎片和虫卵的含量。结果表明,通过对害虫的延长因子EF1基因片段引物的筛选和PCR条件的选择,确定了有效地检测出来小麦粉中的赤拟谷盗、杂拟谷盗和锯谷盗的成虫碎片、幼虫和卵通用引物和PCR扩增条件。通过改良的PCR技术可在4 h内快速检测杂拟谷盗、锯谷盗的卵、幼虫和成虫碎片。最低检出限为可检测出小麦粉中0. 05%(m/m)卵和幼虫、1%成虫的碎片,灵敏度超过了国际标准。DNA指纹图谱中电泳条带亮度(Y)与被检测的不同害虫碎片含量(X)成正相关,回归方程为Y=858. 36X+74. 540相关系数R为0.961 9。利用该技术检测随机取样的小麦粉中成虫的碎片,检测的准确率最高可达80. 56%。结果说明了利用DNA分子指纹图谱技术可快速检测出小麦粉中害虫的碎片、幼虫和卵含量,并可预测小麦粉中害虫的感染程度。本研究为开发快速小麦粉中害虫的快速检测技术具有重要的参考意义。(本文来源于《中国粮油学报》期刊2018年11期)

何萌[5](2018)在《我区科研人员用分子指纹图谱库给薰衣草做“亲子鉴定”》一文中研究指出薰衣草是一种具有较高经济价值的天然香料,在我区伊犁河谷种植面积较大。然而在种植过程中,薰衣草缺乏系统的品系分类方法,使薰衣草品种存在命名不规范、同名异物或同物异名的现象,限制了薰衣草优良品种的创新和选育。如何给薰衣草的品种鉴定提供准确的依据呢?(本文来源于《新疆科技报(汉)》期刊2018-05-11)

何萌,朱彤[6](2018)在《分子指纹图谱库让薰衣草有了“亲子鉴定”》一文中研究指出科技日报乌鲁木齐5月8日电 (何萌 朱彤)风吹起一整片薰衣草田,宛如紫色的波浪上下起伏。每年6月上旬,一睹薰衣草花海的游客络绎不绝。游客谁说得清引进薰衣草50年后品种变异了吗?同样当过游客的新疆农业大学农学院副教授苏秀娟团队说得清。5月8日(本文来源于《科技日报》期刊2018-05-09)

张力,艾海新,陈稳,尹子墨,胡桓[7](2017)在《CarcinoPred-EL:使用分子指纹和集成学习方法预测化学物质致癌性的新模型》一文中研究指出化合物的致癌性作为一种严重的毒性效应,已经成为药物开发过程中的重要问题。化合物的致癌性通常使用长期动物实验来检验,而这些实验不仅耗时耗力,成本很高,且不能对大量化合物进行检验。因此,使用计算机方法依据化合物的结构预测其致癌性已成为近年来研究的焦点。本研究从CPDB等数据库中收集了1003个已知大鼠致癌活性的化合物(其中致癌化合物494个、(本文来源于《中国生理学会张锡钧基金第十四届全国青年优秀生理学学术论文综合摘要、中国生理学会第十二届全国青年生理学工作者学术会议论文摘要》期刊2017-10-20)

李青燕,陈向东,董娜,李淦,茹振钢[8](2016)在《利用分子标记建立杂交小麦亲本分子指纹图谱》一文中研究指出表达序列标签-微卫星DNA(EST-SSR)、序列标志位点(STS)是基于特异引物PCR技术的分子标记,具有共显性遗传、位点数量多、多态性高、稳定性好等优点,广泛地应用于指纹图谱构建、品种鉴定等方面。选用小麦低温敏雄性不育系BNS和来自不同生态区的7个小麦品种(系),从192对引物中筛选出条带清晰、多态性丰富、覆盖小麦所有染色体的21对引物,在8个小麦品种(系)中扩增出72个等位位点,每个引物扩增出的位点数2~7个,平均3.43个;基因多样性指数变幅为0.218 8~0.843 8,平均值为0.544 3;每个引物的多态性信息含量(PIC值)的变化范围在0.194 8~0.824 7之间,平均值0.495 7。由结果可以看出,引物SWES33、CFE11、CFE188、CFE138扩增出来的带型多,易于进行品种的鉴定和区分,其中引物SWES33和CFE11结合起来,可以将这8个小麦品种区分开,这为BNS型杂交小麦品种的鉴定工作提供了依据。(本文来源于《江苏农业科学》期刊2016年09期)

王玉红,金关荣,陶爱芬,祁建民,张杨文[9](2016)在《利用SRAP标记绘制中国芥菜基因源分子指纹图谱》一文中研究指出以中国9个省份和地区的86份芥菜种质资源为供试材料,利用SRAP分子标记和DNA指纹图谱分析软件,绘制芥菜遗传资源基因组DNA指纹图谱。从270对SRAP引物中筛选出40对多态性明显、条带清晰的引物组合,对86份供试材料基因组DNA分子进行扩增,共扩增出632条谱带,其中多态性条带427条,多态性比率为67.56%,表明芥菜种质资源遗传多样性较丰富。以供试的86份芥菜种质资源的SRAP扩增条带为基础,建立供试材料扩增条带指纹数据库的Excel文件,然后利用自主开发的DNA指纹图谱软件,构建86份芥菜种质资源的DNA指纹图谱,获得了所有芥菜种质资源的分子"身份证"。结果表明,SRAP分子标记非常适合芥菜DNA指纹图谱的构建。(本文来源于《热带作物学报》期刊2016年09期)

刘洪伟[10](2016)在《茶树gSSR分子指纹开发及其在商品茶品种鉴别中的应用》一文中研究指出分子指纹是运用相关的分子标记技术(如RAPD、AFLP、SSR、SNP等)反映生物个体或群体间基因组中具有差异性的DNA序列,即基因型在DNA水平上的表现形式,具有稳定性好、准确率高、快速方便等优点。分子指纹已经普遍应用于品种真实性和纯度鉴定、新品种保护和推广以及品种间亲缘关系鉴定等研究领域。近年来,一些叶色变异的茶树品种不断出现,例如“白叶茶”、“黄金茶”、“紫娟”等,但是由特色品种做成的商品茶往往会被其它类似的品种所替代,特别是不同品种做成干茶后更难以分清,很难利用形态差异去区别茶树品种。因此,需要从DNA分子水平上将不同品种区分开,有必要进行gSSR分子指纹开发。本研究采用SSR分子标记技术,以“舒茶早”品种全基因组为参考序列进行gSSR引物设计,经过gSSR位点多态性筛选,确定5对核心引物构建80个茶树品种DNA分子指纹图谱,并建立一套快速、准确的茶树优良品种鉴定技术体系,对优良品种权益保护和推广提供关键技术支持。本研究中gSSR分子标记筛选方法和主要结果如下:(1)有研究表明gSSR等位位点的多态性与重复单元长度呈反比,根据这一结论我们在“舒茶早”基因组序列中选择含有重复单元长度为2~5碱基的gSSR序列为参考,最终设计了415对gSSR引物。(2)用上述引物以“舒茶早”DNA为模板进行PCR扩增,其中306对引物有扩增产物。选取扩增条带单一清晰的PCR产物进行测序验证,若测序结果与参考序列一致,则其扩增引物为有效引物。经测序比对有181对引物通过验证,合格率为43.6%。用初步筛选出的181对引物对6个茶树品种进行gSSR多态性分析,聚丙烯酰氨凝胶电泳检测出其中131对引物的扩增产物具有多态性。(3)复筛出的131对引物对80个茶树品种进行核心引物的确定,对这131对引物等位位点及多态性信息进行统计,筛选出36对扩增条带较为清晰易判读且扩增产物具有较高多态性的引物,共获得535个等位位点,平均每个位点能够检测到14.9个等位位点,平均gSSR位点多态性(PIC值)为0.86。根据36个引物不同组合后指纹鉴定概率(PI和PIsibs值),选出5对引物作为构建80个茶树品种的分子指纹核心引物。(4)根据5对核心引物对80个茶树品种扩增电泳图谱信息,把每个品种的信息进行数字化处理,再通过软件转化成二维码形式,构建80个茶树品种分子指纹图库,然后将这一套分子指纹技术应用到“黄魁”和“舒茶早”商品茶的鉴别上,赋予这两个品种一个独特的指纹身份证,对茶树优良品种的保护和推广有着重要的意义。(本文来源于《安徽农业大学》期刊2016-06-01)

分子指纹论文开题报告

(1)论文研究背景及目的

此处内容要求:

首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景,再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题,并提出你的论文准备的观点或解决方法。

写法范例:

【目的】针对宝巾花(Bougainvillea)品种繁多、同物异名和同名异物多有发生的现象,利用可靠的分子标记技术进行品种的有效分类。【方法】基于15个简单重复序列(SSR)位点,利用荧光标记的引物对131个宝巾花品种进行PCR扩增,扩增产物经毛细管电泳检测,分析品种多样性和遗传距离,并构建品种聚类图和指纹图谱。【结果】15个SSR位点共扩增出85个等位基因,平均每个位点的等位片段数5.60个,Shannon's信息指数、观测杂合度和期望杂合度的变化范围分别为0.38~1.53、0.11~0.94和0.16~0.73,平均值分别为1.04、0.50和0.57,位点的多态性信息量介于0.15~0.69之间,平均0.51。宝巾花品种的遗传距离为0.00~0.65,平均0.33;聚类分析表明,同一种的品种大多数聚在一类,但同一个种仍有品种未聚在一类或亚类,也有多个种的品种聚在一类;有多对品种存在同物异名或同名异物的现象;基于11个位点可有效鉴别131个品种,建立了各品种的分子指纹图谱。【结论】对同物异名或同名异物的品种,需要进一步确认品种中文名或拉丁名;基于SSR标记的宝巾花品种的指纹图谱为宝巾花品种登记、注册和知识产权保护提供了可靠技术,也为品种鉴定提供了有效手段。

(2)本文研究方法

调查法:该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。

观察法:用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。

实验法:通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。

文献研究法:通过调查文献来获得资料,从而全面的、正确的了解掌握研究方法。

实证研究法:依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。

定性分析法:对研究对象进行“质”的方面的研究,这个方法需要计算的数据较少。

定量分析法:通过具体的数字,使人们对研究对象的认识进一步精确化。

跨学科研究法:运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。

功能分析法:这是社会科学用来分析社会现象的一种方法,从某一功能出发研究多个方面的影响。

模拟法:通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。

分子指纹论文参考文献

[1].王志奎.48对水稻分子指纹SSR标记与杂种优势相关性研究[D].湖南师范大学.2019

[2].孙利娜,周群,黄妹平,周长品,徐世松.基于SSR标记构建宝巾花品种的分子指纹[J].南京林业大学学报(自然科学版).2019

[3].李国彬,王伟伟,史聪仙,白瑾琏,李灿辉.云南省马铃薯品种资源鉴定及分子指纹图谱的建立[J].分子植物育种.2019

[4].鲁玉杰,袁园,刘凤杰,王争艳,何向楠.利用DNA分子指纹图谱技术检测小麦粉中害虫的研究[J].中国粮油学报.2018

[5].何萌.我区科研人员用分子指纹图谱库给薰衣草做“亲子鉴定”[N].新疆科技报(汉).2018

[6].何萌,朱彤.分子指纹图谱库让薰衣草有了“亲子鉴定”[N].科技日报.2018

[7].张力,艾海新,陈稳,尹子墨,胡桓.CarcinoPred-EL:使用分子指纹和集成学习方法预测化学物质致癌性的新模型[C].中国生理学会张锡钧基金第十四届全国青年优秀生理学学术论文综合摘要、中国生理学会第十二届全国青年生理学工作者学术会议论文摘要.2017

[8].李青燕,陈向东,董娜,李淦,茹振钢.利用分子标记建立杂交小麦亲本分子指纹图谱[J].江苏农业科学.2016

[9].王玉红,金关荣,陶爱芬,祁建民,张杨文.利用SRAP标记绘制中国芥菜基因源分子指纹图谱[J].热带作物学报.2016

[10].刘洪伟.茶树gSSR分子指纹开发及其在商品茶品种鉴别中的应用[D].安徽农业大学.2016

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