基因的分离论文-彭斌,张晓玲,张晓红,姚刚

基因的分离论文-彭斌,张晓玲,张晓红,姚刚

导读:本文包含了基因的分离论文开题报告文献综述及选题提纲参考文献,主要关键词:空肠弯曲菌,定点屠宰场,污染率,肉牛养殖场

基因的分离论文文献综述

彭斌,张晓玲,张晓红,姚刚[1](2019)在《牛源空肠弯曲菌的污染调查及分离株毒力基因检测分析》一文中研究指出[研究目的]了解牛肉产业链主要环节空肠弯曲菌的污染状况及空肠弯曲菌分离株毒力相关基因携带情况,为空肠弯曲菌的风险评估和致病机理研究提供基础。[方法]从新疆库尔勒市肉牛养殖场、牛定点屠宰场和牛肉销售市场分别采集牛肛拭子、牛胴体拭子和牛肉样品共459份,采用传统培养基培养、生化鉴定与PCR相结合的方法进行空肠弯曲菌的分离鉴定,并对分离株16S rDNA扩增片段测序,测序结果序列与NCBI中的BLAST比对,并对确认为空肠弯曲菌的分离菌株进行6种毒力相关基因(cadF、racR、cheY、peb1A、neuB1、cdtA)的检测。[结果]459份样品中检测出9株空肠弯曲菌,总污染率为1.9%(9/459),肉牛养殖场、定点屠宰场和零售牛肉污染率分别为1.9%(9/459)、1.4%(3/218)和0.9%(1/112);6种毒力相关基因(cadF、racR、cheY、peb1A、neuB1、cdtA)携带率分别为100.0%、55.6%、33.3%、33.3%、22.2%、33.3%。[结论]库尔勒市肉牛从养殖到销售环节存在不同程度的空肠弯曲菌污染,其中养殖场污染率最高,毒力相关基因广泛存在于空肠弯曲菌分离株中,不同菌株毒力相关基因的携带率差异大。(本文来源于《中国畜牧兽医学会兽医食品卫生学分会第十五次学术交流会论文集》期刊2019-12-12)

冯家伟,赵月,彭忠,王湘如,张凡[2](2019)在《临床分离的鸡源产气荚膜梭菌的耐药性及毒素基因检测》一文中研究指出[目的]鸡坏死性肠炎由A型产气荚膜梭菌引起,随着其耐药性的增加,养禽业中控制与预防该病的成本在逐渐增加,因此了解该菌的耐药性和毒力情况可对临床用药提供科学依据与指导。本研究以分离自健康鸡和病鸡的74株A型产气荚膜梭菌为研究对象,测定不同药物对其最小抑菌浓度,同时检测耐药基因与毒素基因,探索是否有菌株产生耐药的同时又携带较为重要的毒素基因。[方法]本试验使用磺胺嘧啶、磺胺甲恶唑、青霉素、氨苄西林、泰乐菌素、红霉素、金霉素、土霉素、多西环素、杆菌肽、杆菌肽锌、林可霉素、克林霉素、庆大霉素、甲硝唑、恩诺沙星共16种药物测定对菌株的最小抑菌浓度,药敏试验方法依据CLSI (2018)文件推荐使用的琼脂稀释法进行。将药物采用合适的溶剂溶解配制成5120μg/mL储存液于-20℃保存,试验时使用灭菌肉汤或生理盐水倍比稀释,添加至绵羊血琼脂混匀制成终浓度在0.03-512μg/mL之间的含药平板。利用多点接种仪将稀释至0.5麦氏比浊度的菌液接种于含药平板,厌氧环境下培养18-24h后判定结果,根据CLSI (2018)文件给出的耐药折点值和MIC_(90)判断是否耐药。利用PCR检测菌株是否携带毒素基因cpb2、cpe与netB,耐药基因lnu(A)、lnu(B)、tet(M)、tet(L)、tet(K)、tetB(P)、tetP(B)、mef(A)、ermB和ermQ,扩增产物采用1%琼脂糖凝胶电泳,回收目的片段经测序比对分析确定。[结果]在测得的药敏试验结果中,青霉素、氨苄西林最为敏感,磺胺类药物耐药率最高,其余药物呈现不同的耐药率,这可能与养殖场药物使用情况有关。杆菌肽、杆菌肽锌耐药率分别为12.16%、6.76%,这两种药物常作为饲料添加剂来预防坏死性肠炎等疾病,但根据MIC_(90)判断测试菌株中对两者耐药的并不多,我们推测可能在菌株来源的养殖场中两种药物的使用量少,还可能与菌株数量比较少有关,其余无耐药折点值的药物均是如此。另外对菌株的耐药谱统计分析发现,耐3种药物或3种以上药物的菌株达66株,占比达89%,其中有1株同时对12种被检药物耐药。毒素基因的扩增结果表明,在所有菌株中未扩增到cpe毒素基因,cpb2、netB毒素基因检出率分别为71.6%(53株)与9.5%(7株)。在检出neB毒素基因的菌株中,其中6株同时检出cpb2毒素基因。有文献报道两种毒素都可位于质粒,但本研究中同时包含两种毒素基因的菌株所携带的毒素基因是否位于质粒还有待进一步验证。在携带netB毒素基因的菌株中,有1株对6种药物耐药,这提示我们如果在未了解菌株耐药背景的情况下盲目、错误地使用药物治疗,将有很大可能错过最佳治疗时期,造成更多的损失。此外,我们测定了44株菌株(42株多耐菌株与2株仅对磺胺类药物耐药菌株)中已有文献报道的部分耐药基因,其中检出含四环素类耐药基因tetA(P)29株、tetB(P)23株、tetP(B)9株、tet(K)1株,含大环内酯类耐药基因ermQ 20株、ermB 1株,林可酰胺类耐药基因lnu(A)1株、lnu(B)2株。另外我们还发现,在一些不存在耐药表型的菌株中也扩增到了耐药基因,如在对四环素类药物敏感的菌株中扩增到了tetA (P)和tetB(P)基因,推测可能是由于该基因表达量低不足以引起耐药表型;也有存在耐药表型但未扩增到相应耐药基因的菌株,如林可酰胺类,推测可能是由于其它耐药基因或基因突变所造成的。[结论]临床分离的产气荚膜梭菌耐药情况较为严重,部分菌株虽无耐药表型但存在耐药基因,在一定程度上会增加耐药性的传播风险。毒素基因检测结果表明含有多种毒素基因的菌株中存在着多重耐药性,增加了临床治疗失败的风险,因此养殖环节中对疾病的防治应在了解致病菌耐药背景后有针对性地选择药物使用。(本文来源于《中国畜牧兽医学会兽医食品卫生学分会第十五次学术交流会论文集》期刊2019-12-12)

张小龙,岳常丽,刘红刚[3](2019)在《头颈部横纹肌肉瘤P-cadherin和AP2β的表达与FOXO1基因分离的研究》一文中研究指出目的以荧光原位杂交(FISH)技术检测FOXO1基因分离阳性的横纹肌肉瘤(RMS)为金标准,探讨免疫组化标志物胎盘钙黏蛋白(P-cadherin)和激活增强子结合蛋白2β(AP2β)的表达与FOXO1基因分离的相关性及两者替代检测FOXO1基因分离的可行性。方法收集2002-01—2016-03间首都医科大学附属北京同仁医院的46例RMS的临床病理资料。蜡块连续切片4张,分别用于HE染色、免疫组化标记物P-cadherin和AP2β染色及FOXO1基因分离的FISH技术检测。结果男性24例,女性22例。0.5~60岁,平均20岁。P-cadherin染色结果为阳性22例,阴性24例。AP-2β染色结果为阳性为46例,阴性0例。FOXO1基因分离阳性21例,阴性25例。结论 P-cadherin诊断FOXO1基因分离的敏感性和特异性高,其有可能代替FISH检测FOXO1基因分离结果。AP2β不能用于鉴别FOXO1基因分离需进一步讨论。(本文来源于《诊断病理学杂志》期刊2019年11期)

李凤琴,刘怡[4](2019)在《一例牛腹泻病大肠杆菌的分离鉴定与毒力岛基因检测》一文中研究指出为了探究一例牛腹泻病的病因,通过16SrRNA鉴定分离出大肠杆菌,并对分离株进行了ETT2毒力基因PCR检测,结果显示分离株携带ETT2毒力岛基因,推测该腹泻病的发生可能和毒力基因携带有关。(本文来源于《吉林畜牧兽医》期刊2019年11期)

姚学君,李峰,陈国清,张红军,姜仁杰[5](2019)在《盐城地区柯萨奇病毒A组16型分离株VP1区基因分子生物信息学分析》一文中研究指出目的分析盐城地区柯萨奇病毒A组16型(coxsackievirus A16,CVA16)VP1区蛋白结构和B细胞表位。方法基于盐城地区2017年CVA16分离株J837 VP1区蛋白序列,采用分子生物信息学软件预测蛋白质理化特性、亲水性、二级结构和抗原表位等。结果盐城地区CVA16分离株VP1区编码蛋白为亲水蛋白,无信号肽,有1个跨膜螺旋区域,二级结构以无规则卷曲为主,存在7个潜在的B细胞抗原表位。结论本文成功预测了CVA16分离株VP1区蛋白二级结构和B细胞优势表位,为CVA16疫苗研研发提供了科学依据。(本文来源于《现代预防医学》期刊2019年21期)

毛彦华,禇海青[6](2019)在《脓肿分枝杆菌临床分离株抗生素敏感性与基因型的关系》一文中研究指出目的观察脓肿分枝杆菌临床分离株抗生素敏感性与基因型的关系。方法选择2016年1月~2018年9月上海市肺科医院分离出的脓肿分枝杆菌分离株87株进行研究,其中痰标本72株,支气管肺泡灌洗液15株。所有菌株均经MGIT960培养基生长和对硝基苯甲酸试验鉴定为非结核分枝杆菌,通过对rPOB基因测序进一步鉴定为脓肿分枝杆菌。对所有菌株进行定量聚合酶链式反应扩增,采用NCBI Nucleotide blast program进行单核苷酸多态性分析,采用微量稀释法测定抗生素敏感性,分析抗生素敏感性与基因型的关系。结果 87株分离株包括81个subsp.abscessus,6个subsp.massiliense。81个subsp.abscessus中共72个ERM(41)T28序列和9个ERM(41)C28序列,ERM(41)序列对10种抗生素敏感;81个subsp.abscessu亚型中包括41个克拉霉素(CLA)敏感株和10个CLA中介株,8个ERM(41)C28和43个ERM(41)T28分离株不存在rrl 2058/2059突变,30个耐药分离株中包括29个ERM(41)T28分离株(其中5个发生rrl 2058/2059突变)和1个ERM(41)C28分离株(1个发生rrl2058/2059突变)。subsp.massiliense耐药分离株2个,1个发生rrl 2058/2059突变。结论 rrl和ERM(41)基因型对脓肿分离杆菌临床分离株CLA耐药具有一定预测作用,阿米卡星治疗脓肿分枝杆菌可能具有更佳效果,值得进一步研究探讨。(本文来源于《中国医药导报》期刊2019年31期)

沈莉萍,徐锋[7](2019)在《上海地区动物源金黄色葡萄球菌分离株mecA基因的表达及耐药性分析》一文中研究指出为了解上海地区动物源性金黄色葡萄球菌的耐药情况,采用微量肉汤稀释法对1999年、2011—2018年(2016年除外)分离鉴定保存的78株金黄色葡萄球菌进行19种药物的药敏试验,采用头孢西丁纸片法进行耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(Methicillin-resistant staphylococcus aureus,MRSA)菌株筛选,采用聚合酶链反应(PCR)进行mecA基因检测。结果:金黄色葡萄球菌除万古霉素、利奈唑胺、夫西地酸、莫匹罗星外,均产生耐药性,多重耐药现象严重,耐药谱广;MRSA检出率为51.3%,发病样品、健康畜禽的粪便样品、环境样品中均检测到MRSA;mecA基因检出率为51.3%,MRSA中mecA基因携带率显着高于甲氧西林敏感金黄色葡萄球菌(Methicillin-sensitive staphylococcus aureus,MSSA)。(本文来源于《上海畜牧兽医通讯》期刊2019年05期)

王婧泽,高树仁,于洋,孙丽芳,王霞[8](2019)在《玉米响应盐胁迫的差异表达基因分离》一文中研究指出以耐盐玉米自交系"M-2导入系"为试验材料,采用224对引物组合利用cDNA-AFLP(complementary DNA-amplified fragment length polymorphism)技术,分析玉米在4个不同浓度的盐胁迫诱导下的基因表达差异,对其差异片段回收测序。结果表明,成功回收测序其中的71条TDFs(transcript-derived fragments)。用NCBI BlastX对测序结果进行比对分析,49条TDFs与已知蛋白功能基因有较高的同源性,涉及光合作用、细胞信号转导、胁迫响应、细胞代谢等多种途径,此外还有20个假设蛋白、未知蛋白和2个没有匹配的基因片段。利用qRT-PCR对TDF98、TDF3进行表达特征分析,结果表明,这2个TDFs代表的基因在抵御玉米盐胁迫过程中起到不同程度的调控作用。(本文来源于《玉米科学》期刊2019年05期)

邹伟斌,赖月辉,牛贝贝,吴文福,齐冬梅[9](2019)在《猪伪狂犬病病毒变异株GD株的分离鉴定及TK和gE基因的进化分析》一文中研究指出为了解猪伪狂犬病病毒(Pseudorabies virus,PRV)流行变异毒株的病原学特性及分子遗传变异特点,本研究从广东省某疑似暴发猪伪狂犬病的猪场采集的病料中分离到一株PRV毒株,命名为GD株。该病毒在PK-15细胞中能够产生典型的PRV细胞病变,病毒滴度可达109.0 TCID50/mL。将病毒感染KM SPF小鼠,接种小鼠在4 d内全部死亡,并且均出现典型的PR症状。序列比对结果显示,PRV GD株的TK和gE基因与国内外PRV参考株的核苷酸同源性分别为99.4%~100%和97.6~99.9%,氨基酸同源性分别为99.4%~100%和95.5%~99.8%。基于gE基因的遗传进化分析发现,PRV GD株与国内近几年分离鉴定的流行变异毒株位于同一分支上。与经典株相比,PRV GD株的gE蛋白氨基酸序列在48和496位均有1个天冬氨酸(D)的插入,符合PRV变异株的典型特征。本研究成功分离到一株PRV变异株,为PRV流行变异毒株的防控和新型疫苗的研究提供一定的科学依据。(本文来源于《现代畜牧兽医》期刊2019年10期)

张金龙,吴玉俊,肖成斌,方显明,王桠楠[10](2019)在《马铃薯SERKs家族基因的分离及其在植物免疫信号中的功能》一文中研究指出【目的】对马铃薯体细胞胚胎发生类受体激酶(somatic embryogenesis receptor-like kinases,SERKs)基因进行克隆,通过序列分析和表达分析,初步探究马铃薯体细胞胚胎发生类受体激酶是否能够作为共受体在植物免疫防御应答中发挥功能.【方法】以拟南芥SERKs家族基因氨基酸序列同源比对马铃薯基因组数据库,找到了3个马铃薯SERKs家族基因.利用高效的Gateway技术,从马铃薯中克隆了StSERK1,StSERK3A和StSERK3B 3个马铃薯SERKs家族基因;以拟南芥免疫激活型突变体bak1-3 bkk1-1为背景,通过遗传学、分子生物学及生理生化的方法对3个马铃薯SERKs基因在植物免疫调控中的作用进行基因功能研究.【结果】结构域分析和遗传进化树结果证实,StSERK1、StSERK3A和StSERK3B均具有体细胞胚胎发生类受体激酶结构域特征.组织表达分析显示,马铃薯3个SERKs基因均能在植物中表达.遗传数据证实,3个马铃薯SERKs基因均能不同程度抑制bak1-3 bkk1-1免疫激活的表型.【结论】马铃薯StSERKs基因具有SERKs家族基因的典型保守结构域特征,能够参与植物先天性免疫应答.(本文来源于《甘肃农业大学学报》期刊2019年05期)

基因的分离论文开题报告

(1)论文研究背景及目的

此处内容要求:

首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景,再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题,并提出你的论文准备的观点或解决方法。

写法范例:

[目的]鸡坏死性肠炎由A型产气荚膜梭菌引起,随着其耐药性的增加,养禽业中控制与预防该病的成本在逐渐增加,因此了解该菌的耐药性和毒力情况可对临床用药提供科学依据与指导。本研究以分离自健康鸡和病鸡的74株A型产气荚膜梭菌为研究对象,测定不同药物对其最小抑菌浓度,同时检测耐药基因与毒素基因,探索是否有菌株产生耐药的同时又携带较为重要的毒素基因。[方法]本试验使用磺胺嘧啶、磺胺甲恶唑、青霉素、氨苄西林、泰乐菌素、红霉素、金霉素、土霉素、多西环素、杆菌肽、杆菌肽锌、林可霉素、克林霉素、庆大霉素、甲硝唑、恩诺沙星共16种药物测定对菌株的最小抑菌浓度,药敏试验方法依据CLSI (2018)文件推荐使用的琼脂稀释法进行。将药物采用合适的溶剂溶解配制成5120μg/mL储存液于-20℃保存,试验时使用灭菌肉汤或生理盐水倍比稀释,添加至绵羊血琼脂混匀制成终浓度在0.03-512μg/mL之间的含药平板。利用多点接种仪将稀释至0.5麦氏比浊度的菌液接种于含药平板,厌氧环境下培养18-24h后判定结果,根据CLSI (2018)文件给出的耐药折点值和MIC_(90)判断是否耐药。利用PCR检测菌株是否携带毒素基因cpb2、cpe与netB,耐药基因lnu(A)、lnu(B)、tet(M)、tet(L)、tet(K)、tetB(P)、tetP(B)、mef(A)、ermB和ermQ,扩增产物采用1%琼脂糖凝胶电泳,回收目的片段经测序比对分析确定。[结果]在测得的药敏试验结果中,青霉素、氨苄西林最为敏感,磺胺类药物耐药率最高,其余药物呈现不同的耐药率,这可能与养殖场药物使用情况有关。杆菌肽、杆菌肽锌耐药率分别为12.16%、6.76%,这两种药物常作为饲料添加剂来预防坏死性肠炎等疾病,但根据MIC_(90)判断测试菌株中对两者耐药的并不多,我们推测可能在菌株来源的养殖场中两种药物的使用量少,还可能与菌株数量比较少有关,其余无耐药折点值的药物均是如此。另外对菌株的耐药谱统计分析发现,耐3种药物或3种以上药物的菌株达66株,占比达89%,其中有1株同时对12种被检药物耐药。毒素基因的扩增结果表明,在所有菌株中未扩增到cpe毒素基因,cpb2、netB毒素基因检出率分别为71.6%(53株)与9.5%(7株)。在检出neB毒素基因的菌株中,其中6株同时检出cpb2毒素基因。有文献报道两种毒素都可位于质粒,但本研究中同时包含两种毒素基因的菌株所携带的毒素基因是否位于质粒还有待进一步验证。在携带netB毒素基因的菌株中,有1株对6种药物耐药,这提示我们如果在未了解菌株耐药背景的情况下盲目、错误地使用药物治疗,将有很大可能错过最佳治疗时期,造成更多的损失。此外,我们测定了44株菌株(42株多耐菌株与2株仅对磺胺类药物耐药菌株)中已有文献报道的部分耐药基因,其中检出含四环素类耐药基因tetA(P)29株、tetB(P)23株、tetP(B)9株、tet(K)1株,含大环内酯类耐药基因ermQ 20株、ermB 1株,林可酰胺类耐药基因lnu(A)1株、lnu(B)2株。另外我们还发现,在一些不存在耐药表型的菌株中也扩增到了耐药基因,如在对四环素类药物敏感的菌株中扩增到了tetA (P)和tetB(P)基因,推测可能是由于该基因表达量低不足以引起耐药表型;也有存在耐药表型但未扩增到相应耐药基因的菌株,如林可酰胺类,推测可能是由于其它耐药基因或基因突变所造成的。[结论]临床分离的产气荚膜梭菌耐药情况较为严重,部分菌株虽无耐药表型但存在耐药基因,在一定程度上会增加耐药性的传播风险。毒素基因检测结果表明含有多种毒素基因的菌株中存在着多重耐药性,增加了临床治疗失败的风险,因此养殖环节中对疾病的防治应在了解致病菌耐药背景后有针对性地选择药物使用。

(2)本文研究方法

调查法:该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。

观察法:用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。

实验法:通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。

文献研究法:通过调查文献来获得资料,从而全面的、正确的了解掌握研究方法。

实证研究法:依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。

定性分析法:对研究对象进行“质”的方面的研究,这个方法需要计算的数据较少。

定量分析法:通过具体的数字,使人们对研究对象的认识进一步精确化。

跨学科研究法:运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。

功能分析法:这是社会科学用来分析社会现象的一种方法,从某一功能出发研究多个方面的影响。

模拟法:通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。

基因的分离论文参考文献

[1].彭斌,张晓玲,张晓红,姚刚.牛源空肠弯曲菌的污染调查及分离株毒力基因检测分析[C].中国畜牧兽医学会兽医食品卫生学分会第十五次学术交流会论文集.2019

[2].冯家伟,赵月,彭忠,王湘如,张凡.临床分离的鸡源产气荚膜梭菌的耐药性及毒素基因检测[C].中国畜牧兽医学会兽医食品卫生学分会第十五次学术交流会论文集.2019

[3].张小龙,岳常丽,刘红刚.头颈部横纹肌肉瘤P-cadherin和AP2β的表达与FOXO1基因分离的研究[J].诊断病理学杂志.2019

[4].李凤琴,刘怡.一例牛腹泻病大肠杆菌的分离鉴定与毒力岛基因检测[J].吉林畜牧兽医.2019

[5].姚学君,李峰,陈国清,张红军,姜仁杰.盐城地区柯萨奇病毒A组16型分离株VP1区基因分子生物信息学分析[J].现代预防医学.2019

[6].毛彦华,禇海青.脓肿分枝杆菌临床分离株抗生素敏感性与基因型的关系[J].中国医药导报.2019

[7].沈莉萍,徐锋.上海地区动物源金黄色葡萄球菌分离株mecA基因的表达及耐药性分析[J].上海畜牧兽医通讯.2019

[8].王婧泽,高树仁,于洋,孙丽芳,王霞.玉米响应盐胁迫的差异表达基因分离[J].玉米科学.2019

[9].邹伟斌,赖月辉,牛贝贝,吴文福,齐冬梅.猪伪狂犬病病毒变异株GD株的分离鉴定及TK和gE基因的进化分析[J].现代畜牧兽医.2019

[10].张金龙,吴玉俊,肖成斌,方显明,王桠楠.马铃薯SERKs家族基因的分离及其在植物免疫信号中的功能[J].甘肃农业大学学报.2019

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