类异黄酮还原酶基因论文-张古文,刘娜,冯志娟,徐盛春,胡齐赞

类异黄酮还原酶基因论文-张古文,刘娜,冯志娟,徐盛春,胡齐赞

导读:本文包含了类异黄酮还原酶基因论文开题报告文献综述及选题提纲参考文献,主要关键词:大豆,异黄酮,异黄酮还原酶,基因家族

类异黄酮还原酶基因论文文献综述

张古文,刘娜,冯志娟,徐盛春,胡齐赞[1](2016)在《大豆异黄酮还原酶基因的鉴定及生物信息学分析》一文中研究指出异黄酮是大豆生长过程中形成的一类次级代谢产物,是大豆主要的功能活性成分之一。异黄酮还原酶(isoflavone reductase,IFR)是异黄酮分解途径的关键酶之一,在调控异黄酮含量及成分方面起着重要作用。本研究基于大豆全基因组测序数据,利用生物信息学方法鉴定了大豆异黄酮还原酶基因家族成员,并对其基因的序列特征、结构特征和遗传多样性进行了分析。结果表明:大豆异黄酮还原酶(GmIFR)家族含有17个成员,蛋白序列介于191(GmIFR07)和376(GmIFR11)个氨基酸之间,序列相似性为19.59%(Gm IFR07和GmIFR11)~98.43%(Gm IFR12和GmIFR17),结构分析表明这些基因内含子数目差异较大,2~6个不等,不均匀的分布在大豆的1、4、6、9、11、12和16号染色体上。(本文来源于《大豆科学》期刊2016年06期)

陈伟,林叶春,高维常,李春俭,王叁根[2](2014)在《烟草类异黄酮还原酶基因家族的分子克隆》一文中研究指出为揭示类异黄酮还原酶(Isoflavone reductase-like,IRL)在烟草次生物质合成和生理功能中的作用,从品种龙里红花烟中克隆普通烟草IRL(NtIRL)基因家族2个成员的全长cDNA和gDNA序列,完成了生物信息学分析、Southern杂交和RT-PCR等分子鉴定。NtIRL1基因为1 946bp,全长cDNA为1 257bp;NtIRL2基因为2 089bp,全长cDNA为1 261bp。NtIRL1和NtIRL2蛋白均为310个氨基酸,分子质量分别为34.652和34.650ku,等电点分别为5.58和5.78。2个蛋白可能发生磷酸化等翻译后修饰,无信号肽,定位于细胞质,但有可能通过跨膜域与质膜发生联系。预测这2个蛋白的K8~G88为AdoHycase(cl09931)保守域,I9~T239为NmrA(pfam05368)保守域,并具有PIP类型蛋白的所有保守性基序和活性残基。预测2个蛋白的二级结构以α螺旋和延伸链为主;叁级结构具有PIP酶典型特征,中间有1个催化裂口。BLAST和系统发生分析进一步证实NtIRL家族属于PIP大家族,与IFR的关系比PCBER和PLR更近。Southern blot杂交也证明,普通烟草基因组中有且只有2个IRL基因存在。半定量RT-PCR结果显示,NtIRL1和NtIRL2均在根中优势表达,在地上部各器官中表达很弱或无表达。(本文来源于《中国农业大学学报》期刊2014年06期)

谢晓娜,张小秋,邵敏,朱惠,杨丽涛[3](2014)在《甘蔗类异黄酮还原酶(IRL)基因的克隆与表达分析》一文中研究指出采用RT-PCR技术从甘蔗中克隆So IRL基因,用生物信息学方法对获得的氨基酸序列进行分析,利用荧光定量PCR技术研究So IRL基因在甘蔗不同组织和不同胁迫条件下的表达特性。结果表明,克隆获得甘蔗So IRL,Gen Bank登录号为KF808324。该c DNA全长1 169 bp,含有1个927 bp的完整开放阅读框(ORF),编码309个氨基酸。系统进化树分析显示,甘蔗So IRL与玉米的IRL蛋白亲缘关系较近。q RT-PCR分析表明So IRL在甘蔗根、茎、叶中均有表达;在RSD病菌及低温(4℃)、聚乙二醇(PEG)、Na Cl和脱落酸(ABA)4种非生物胁迫下均被诱导表达,但表达模式不同。说明该基因可能参与甘蔗应答RSD过程,并可能在非生物胁迫中也发挥了作用。(本文来源于《生物技术通报》期刊2014年11期)

赵海霞,李成磊,白悦辰,陈惠,吴琦[4](2012)在《苦荞类异黄酮还原酶基因(FtIRL)的克隆及序列分析》一文中研究指出利用RT-PCR技术,从苦荞(Fagopyrum tatarium)中克隆得到类异黄酮还原酶基因(IRL)的开放阅读框序列(ORF),命名为FtIRL。序列分析表明:FtIRL含一个长942bp的ORF,编码313个氨基酸,其氨基酸序列与金荞异黄酮还原酶FcIFR(GenBank登录号ABV02071)同源性最高,达到97%;与其他植物IRL同源性为44%~73%。生物信息学分析表明:FtIRL推导的蛋白质含有典型的底物结合口袋和保守的NADPH结合位点,符合短链脱氢酶家族的结构特征。构建基于氨基酸的系统发育树表明,苦荞FcIFR虽然在氨基酸序列上与其他植物的异黄酮还原酶(IFR)有较高的同源性,但其生物学功能可能更接近落叶松脂醇还原酶(PLR)。(本文来源于《食品科学》期刊2012年11期)

祝钦泷,郭铁英,眭顺照,刘光德,雷兴华[5](2009)在《野生金荞麦高黄酮含量愈伤组织中一个类异黄酮还原酶(IRL)基因的克隆与分析(英文)》一文中研究指出木脂素是重要的植物防御物质之一,具有优良的生物学活性。为研究传统抗肿瘤良药野生金荞麦的药用次生代谢,用RACE与文库结合的方法,从野生金荞麦高黄酮含量愈伤系cDNA文库中快速克隆了一个类异黄酮还原酶(isoflavone reductase-like,IRL)基因FcIRL的全长cDNA(accession no.EU116032)。FcIRL cDNA全长1 217 bp,含有1个942 bp的开放阅读框(open reading frame,ORF),编码313个氨基酸,其5′UTR区含有2个终止子TAG,3′UTR区含有推测的加尾信号ATAAA和polyA尾,对应基因组序列不含内含子。FcIRL蛋白N端含有1个N-乙酰化作用位点(M1-K5)和1个保守的NADPH结合位点(G10-G-T-G13-Y-I-G16),具有1个保守的NmrA结构域(V6-N244)和多个重要的磷酸化位点,以及1个保守的N-糖基化作用位点(N214)。序列同源性比较、系统发生分析以及蛋白质高级结构预测分析均表明,FcIRL属于松脂醇-落叶松脂醇还原酶(pinoresinol-lariciresinol reductase,PLR)类,推测具有PLR的生物活性,是8-8′连接木脂素(8-8′-linked lignans)合成途径中的关键酶,催化松脂醇和落叶松脂醇,还原生成开环异落叶松脂(secoisolariciresinol),参与金荞麦药用次生代谢与植物的防御。(本文来源于《药学学报》期刊2009年07期)

郭铁英[6](2008)在《野生金荞麦类异黄酮还原酶基因(FcIRL)的克隆与功能的初步研究》一文中研究指出野生金荞麦[Fagopyrum cymosum(Trev.)Meisn]是蓼科(Fagopyrum)荞麦属(Polygonaceae)多年生草本植物,是一种营养丰富且具有重要药用价值的资源植物,其块根活性提取物具有显着的抗癌、抑制肿瘤细胞侵袭和转移以及抗菌消炎等重要作用。但是目前对野生金荞麦的研究还主要的集中在营养成分与化学成分分析、药效学研究和抗癌机制研究上,而对于约效成分及相关代谢途径基因的研究还报道的不多。到目前为止,野生金莽麦次生代谢途径中关键酶基因的研究还仅限于二氢黄酮醇4-还原酶(dihydroflavonol-4-reductase,DFR)基因及转录调控因子P基因的克隆及其功能的初步验证。其他的功能基因和调控基因等还未见有研究报道。为了进一步的研究金荞麦药物的次生代谢途径,我们采用RACE与cDNA文库结合的方法首次从野生金荞麦中分离克隆到了可能的类异黄酮还原酶基因(FclRL基因),并对其进行生物信息学的分析和功能的初步预测,构建了正义表达载体,并进行了转化模式植物烟草与矮牵牛的研究。FclRL基因的cDNA(accession no.EU116032)全长1217bp,含有1个942 bp的开放阅读框(open reading frame,ORF),编码313个氨基酸,其5'UTR区含有2个终止子TAG,3'UTR区含有推测的加尾信号ATAAA和polyA尾巴,对应基因组序列不含内含子。FcIRL蛋白N端含有1个N-乙酰化作用位点(M_1-K_5)和1个保守的NADPH结合位点(G_(10)-G-T-G_(13)-Y-1-G_(16)),具有1个保守的NmrA(nitrogen metabolite repression regulator)结构域(V_6-N_(244))和多个重要的磷酸化位点,以及1个保守的N-糖基化作用位点(N_(214))。序列同源性分析、系统发生分析以及蛋白质高级结构预测分析均表明,FcIRL蛋白属于松脂醇-落叶松脂醇还原酶(pinoresinol-lariciresinol reductase,PLR)类,推测其具有PLR的生物活性,是8-8'连接木脂素(8-8'-linked lignans)合成途径中的关键酶,催化松脂醇和落叶松脂醇还原生成开环异落叶松脂(secoisolariciresinol),参与金荞麦药用次生代谢与植物的防御。成功构建了野生金荞麦FcIRL基因正向表达载体pC2301-FcIRL,用农杆菌介导的叶盘法将FcIRL基因导入模式植物烟草与矮牵牛中。通过抗性筛选、报告基因GUS活性组织化学染色筛选及PCR检测,证实FcIRL基因已经整合进两种模式植物基因组中。(本文来源于《西南大学》期刊2008-05-20)

类异黄酮还原酶基因论文开题报告

(1)论文研究背景及目的

此处内容要求:

首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景,再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题,并提出你的论文准备的观点或解决方法。

写法范例:

为揭示类异黄酮还原酶(Isoflavone reductase-like,IRL)在烟草次生物质合成和生理功能中的作用,从品种龙里红花烟中克隆普通烟草IRL(NtIRL)基因家族2个成员的全长cDNA和gDNA序列,完成了生物信息学分析、Southern杂交和RT-PCR等分子鉴定。NtIRL1基因为1 946bp,全长cDNA为1 257bp;NtIRL2基因为2 089bp,全长cDNA为1 261bp。NtIRL1和NtIRL2蛋白均为310个氨基酸,分子质量分别为34.652和34.650ku,等电点分别为5.58和5.78。2个蛋白可能发生磷酸化等翻译后修饰,无信号肽,定位于细胞质,但有可能通过跨膜域与质膜发生联系。预测这2个蛋白的K8~G88为AdoHycase(cl09931)保守域,I9~T239为NmrA(pfam05368)保守域,并具有PIP类型蛋白的所有保守性基序和活性残基。预测2个蛋白的二级结构以α螺旋和延伸链为主;叁级结构具有PIP酶典型特征,中间有1个催化裂口。BLAST和系统发生分析进一步证实NtIRL家族属于PIP大家族,与IFR的关系比PCBER和PLR更近。Southern blot杂交也证明,普通烟草基因组中有且只有2个IRL基因存在。半定量RT-PCR结果显示,NtIRL1和NtIRL2均在根中优势表达,在地上部各器官中表达很弱或无表达。

(2)本文研究方法

调查法:该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。

观察法:用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。

实验法:通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。

文献研究法:通过调查文献来获得资料,从而全面的、正确的了解掌握研究方法。

实证研究法:依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。

定性分析法:对研究对象进行“质”的方面的研究,这个方法需要计算的数据较少。

定量分析法:通过具体的数字,使人们对研究对象的认识进一步精确化。

跨学科研究法:运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。

功能分析法:这是社会科学用来分析社会现象的一种方法,从某一功能出发研究多个方面的影响。

模拟法:通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。

类异黄酮还原酶基因论文参考文献

[1].张古文,刘娜,冯志娟,徐盛春,胡齐赞.大豆异黄酮还原酶基因的鉴定及生物信息学分析[J].大豆科学.2016

[2].陈伟,林叶春,高维常,李春俭,王叁根.烟草类异黄酮还原酶基因家族的分子克隆[J].中国农业大学学报.2014

[3].谢晓娜,张小秋,邵敏,朱惠,杨丽涛.甘蔗类异黄酮还原酶(IRL)基因的克隆与表达分析[J].生物技术通报.2014

[4].赵海霞,李成磊,白悦辰,陈惠,吴琦.苦荞类异黄酮还原酶基因(FtIRL)的克隆及序列分析[J].食品科学.2012

[5].祝钦泷,郭铁英,眭顺照,刘光德,雷兴华.野生金荞麦高黄酮含量愈伤组织中一个类异黄酮还原酶(IRL)基因的克隆与分析(英文)[J].药学学报.2009

[6].郭铁英.野生金荞麦类异黄酮还原酶基因(FcIRL)的克隆与功能的初步研究[D].西南大学.2008

标签:;  ;  ;  ;  

类异黄酮还原酶基因论文-张古文,刘娜,冯志娟,徐盛春,胡齐赞
下载Doc文档

猜你喜欢