田佳:基于高通量测序的土壤中ermF基因宿主细菌多样性分析论文

田佳:基于高通量测序的土壤中ermF基因宿主细菌多样性分析论文

本文主要研究内容

作者田佳,吴楠,解诗雨,黄志伟,原尚奇(2019)在《基于高通量测序的土壤中ermF基因宿主细菌多样性分析》一文中研究指出:为探究土壤环境中抗生素抗性基因宿主微生物的多样性,本研究以天津地区的农田土壤为研究对象,利用高通量测序技术对土样中大环内酯类抗性基因ermF的宿主细菌在不同分类水平的多样性进行了评估。土样中宿主细菌种类覆盖9个门,39个科,42个属。4个土样之间所共有的OTUs只占总OTUs数目的 0.5%,说明样品间宿主细菌群落的差异性显著,可能主要与采样地点不同有关。在所有土样中,ermF基因的优势宿主细菌在门的水平上均为拟杆菌门(Bacteroidetes,相对丰度50.3%~87.7%);同时检测到少量的变形菌门(Proteobacteria),放线菌门(Actinobacteria)和厚壁菌门(Firmicutes),占比均小于4.2%。土样中ermF优势宿主细菌在科水平上都为拟杆菌科(Bacteroidaceae,相对丰度50.3%~87.5%),在属水平上都为拟杆菌属(Bacteroides,相对丰度50.3%~87.5%),其中相对丰度大于0.1%的ermF的宿主菌属有14种。

Abstract

wei tan jiu tu rang huan jing zhong kang sheng su kang xing ji yin su zhu wei sheng wu de duo yang xing ,ben yan jiu yi tian jin de ou de nong tian tu rang wei yan jiu dui xiang ,li yong gao tong liang ce xu ji shu dui tu yang zhong da huan nei zhi lei kang xing ji yin ermFde su zhu xi jun zai bu tong fen lei shui ping de duo yang xing jin hang le ping gu 。tu yang zhong su zhu xi jun chong lei fu gai 9ge men ,39ge ke ,42ge shu 。4ge tu yang zhi jian suo gong you de OTUszhi zhan zong OTUsshu mu de 0.5%,shui ming yang pin jian su zhu xi jun qun la de cha yi xing xian zhe ,ke neng zhu yao yu cai yang de dian bu tong you guan 。zai suo you tu yang zhong ,ermFji yin de you shi su zhu xi jun zai men de shui ping shang jun wei ni gan jun men (Bacteroidetes,xiang dui feng du 50.3%~87.7%);tong shi jian ce dao shao liang de bian xing jun men (Proteobacteria),fang xian jun men (Actinobacteria)he hou bi jun men (Firmicutes),zhan bi jun xiao yu 4.2%。tu yang zhong ermFyou shi su zhu xi jun zai ke shui ping shang dou wei ni gan jun ke (Bacteroidaceae,xiang dui feng du 50.3%~87.5%),zai shu shui ping shang dou wei ni gan jun shu (Bacteroides,xiang dui feng du 50.3%~87.5%),ji zhong xiang dui feng du da yu 0.1%de ermFde su zhu jun shu you 14chong 。

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  • 论文详细介绍

    论文作者分别是来自天津农业科学的田佳,吴楠,解诗雨,黄志伟,原尚奇,发表于刊物天津农业科学2019年11期论文,是一篇关于抗生素抗性基因论文,土壤论文,高通量论文,多样性论文,天津农业科学2019年11期论文的文章。本文可供学术参考使用,各位学者可以免费参考阅读下载,文章观点不代表本站观点,资料来自天津农业科学2019年11期论文网站,若本站收录的文献无意侵犯了您的著作版权,请联系我们删除。

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