本文主要研究内容
作者白雪,曹帅,向殿军,李兴,刘鹏（2019）在《低温条件下蓖麻种子萌发期转录组分析》一文中研究指出：蓖麻(Ricinus communis L.)是一种冷敏感作物,解析其响应低温胁迫的关键调控基因,对于选育耐低温蓖麻品种具有重要的理论意义。以蓖麻耐低温品种‘通蓖5号’为材料,构建15℃(低温)和25℃(适温)萌发条件下完全展开的子叶cDNA文库,利用Illumina测序技术进行转录组测序(RNA-Seq),筛选差异表达基因(differentially expressed genes, DEGs)。结果表明:借助RNA-Seq技术共筛选到1 530个DEGs,其中低温相对于适温表达上调的DEGs有848个,表达下调的DEGs为682个;对1 530个DEGs进行GO功能分类和富集分析显示,共有953个DEGs被注释到GO功能三大分类的57个亚类中,涉及生物学过程、细胞成分及分子功能的DEGs比例分别为88.46%、69.67%和25.71%;KEGG功能分类显示,低温相对于适温表达上调的DEGs有243个,被富集到201个代谢通路中,其中显著富集的通路包括细胞周期、激素信号转导、DNA复制、细胞周期-酵母、减数分裂酵母和孕酮介导的卵母细胞成熟等20个通路,差异基因数富集最多的代谢通路为细胞周期;利用qRT-PCR对上调表达且显著富集的8个DEGs进行了表达分析,证实了转录组测序结果的准确性。该研究将为揭示蓖麻种子低温条件下萌发的分子机制提供理论依据。
Abstract
bi ma (Ricinus communis L.)shi yi chong leng min gan zuo wu ,jie xi ji xiang ying di wen xie pai de guan jian diao kong ji yin ,dui yu shua yo nai di wen bi ma pin chong ju you chong yao de li lun yi yi 。yi bi ma nai di wen pin chong ‘tong bi 5hao ’wei cai liao ,gou jian 15℃(di wen )he 25℃(kuo wen )meng fa tiao jian xia wan quan zhan kai de zi xie cDNAwen ku ,li yong Illuminace xu ji shu jin hang zhuai lu zu ce xu (RNA-Seq),shai shua cha yi biao da ji yin (differentially expressed genes, DEGs)。jie guo biao ming :jie zhu RNA-Seqji shu gong shai shua dao 1 530ge DEGs,ji zhong di wen xiang dui yu kuo wen biao da shang diao de DEGsyou 848ge ,biao da xia diao de DEGswei 682ge ;dui 1 530ge DEGsjin hang GOgong neng fen lei he fu ji fen xi xian shi ,gong you 953ge DEGsbei zhu shi dao GOgong neng san da fen lei de 57ge ya lei zhong ,she ji sheng wu xue guo cheng 、xi bao cheng fen ji fen zi gong neng de DEGsbi li fen bie wei 88.46%、69.67%he 25.71%;KEGGgong neng fen lei xian shi ,di wen xiang dui yu kuo wen biao da shang diao de DEGsyou 243ge ,bei fu ji dao 201ge dai xie tong lu zhong ,ji zhong xian zhe fu ji de tong lu bao gua xi bao zhou ji 、ji su xin hao zhuai dao 、DNAfu zhi 、xi bao zhou ji -jiao mu 、jian shu fen lie jiao mu he yun tong jie dao de luan mu xi bao cheng shou deng 20ge tong lu ,cha yi ji yin shu fu ji zui duo de dai xie tong lu wei xi bao zhou ji ;li yong qRT-PCRdui shang diao biao da ju xian zhe fu ji de 8ge DEGsjin hang le biao da fen xi ,zheng shi le zhuai lu zu ce xu jie guo de zhun que xing 。gai yan jiu jiang wei jie shi bi ma chong zi di wen tiao jian xia meng fa de fen zi ji zhi di gong li lun yi ju 。
论文参考文献
论文详细介绍
论文作者分别是来自分子植物育种的白雪,曹帅,向殿军,李兴,刘鹏，发表于刊物分子植物育种2019年12期论文，是一篇关于蓖麻论文,低温论文,萌发期论文,转录组论文,分子植物育种2019年12期论文的文章。本文可供学术参考使用，各位学者可以免费参考阅读下载，文章观点不代表本站观点，资料来自分子植物育种2019年12期论文网站，若本站收录的文献无意侵犯了您的著作版权，请联系我们删除。
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